- g -

• G() : Cmd5
• GCD() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod
• geFailedConstraintCounter() : COptProblem
• generalize() : CFunctionAnalyzer::CValue
• generate() : CExpressionGenerator
• generatedNodeId() : CRDFGraph
• generateExpressionFor() : CExpressionGenerator
• GenerateIdHandler() : CRDFParser
• generateIssueMessages() : CValidity
• generateObjectsFromName() : CDataHandler , CReport
• generateRandomNumbers() : CStochasticRungeKuttaRI5
• generateReactionIndex() : CStochMethod
• generateReactionTime() : CHybridMethod , CStochMethod
• generateUuid() : CUndoObjectInterface
• genrand_res53() : Cmt19937
• get() : CKeyFactory , CKeyFactory::HashTable , CValidity
• get2DTransformationString() : CLTransformation2D
• get3DTransformationString() : CLTransformation
• get_autothrow_id() : copasi::autoexcept
• get_help_comment() : copasi::option_error
• get_locations() : copasi::COptionParser
• get_non_options() : copasi::COptionParser
• get_options() : copasi::COptionParser
• getAboutNode() : CRDFGraph
• getAbsoluteValue() : CLRelAbsVector
• getActDateInSeconds() : CMIRIAMResources
• getAction() : CMathEventQueue
• getActiveModelParameterSet() : CModel
• getActivity() : CPlotItem
• getAffectedExperiments() : FittingItem
• getAfterData() : CDataHandler
• getAllExperiments() : ResultData
• getAllMessageText() : CCopasiMessage
• getAllowedLocationList() : CRDFPredicate
• getAllUnsetBitIndexes() : CBitPatternMethod , CStepMatrix , CStepMatrixColumn
• getAllValidUnits() : CUnitDefinitionDB
• getAlpha() : CLColorDefinition
• getAlphaFromArgb() : SEDMLUtils
• getAlphaFromRgba() : SEDMLUtils
• getAmount() : CMoiety
• getAmountRateUnit() : CReactionInterface
• getAnnotations() : CFlags< Enum >
• getAnnotationsCN() : CDataArray
• getAnnotationsString() : CDataArray
• getApplicationFont() : CConfigurationFile
• getApplyInitialValuesSequence() : CMathContainer
• getArchiveFileName() : SEDMLImporter
• getAreaUnit() : CModel
• getAreaUnitName() : CModel
• getArray() : CDataArray
• getAspect() : CLLayoutRenderer
• getAssignment() : CMathEvent::CAssignment
• getAssignments() : CEvent , CMathEvent
• getAssociatedEntityKey() : CSlider
• getAttribute() : CXMLAttributeList
• getAttributeValue() : CExpatTemplate< CType >
• getAuthor() : Copasi2SBMLTranslator
• getAuthorID() : CUndoData
• getAutomaticStepSize() : CTrajectoryProblem
• getAvogadro() : CModel
• getBackgroundColor() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getBalances() : CChemEq
• getBase1() : CLLineSegment
• getBase2() : CLLineSegment
• getBeforeData() : CDataHandler
• getBerkeleyMadonnaString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeUnit , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getBestItem() : ResultData
• getBestParameters() : COptMethod , COptMethodCoranaWalk , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodSA , COptMethodStatistics , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch
• getBestValue() : COptMethod , COptMethodCoranaWalk , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodSA , COptMethodStatistics , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch
• getBestValueFor() : ResultData
• getBiologicalDescriptions() : CMIRIAMInfo
• getBlankNodeID() : CRDFObject , CRDFSubject
• getBlankNodeMap() : CRDFGraph
• getBlue() : CLColorDefinition
• getBMatrixReduced() : CLNAMethod
• getBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getBodyAddr() : CReportDefinition
• getBoundingBox() : CLGraphicalObject , CLLineEnding
• getBuffer() : CExpatTemplate< CType >
• getCalculateStatistics() : COptProblem
• getCalculateValue() : COptProblem
• getCalculationTime() : CMathEvent
• getCallBack() : CCopasiMethod , CCopasiProblem , CCopasiTask , CSBMLExporter
• getCalledTree() : CEvaluationNodeCall
• getCallParameters() : CReaction
• getCCodeString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeNumber , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeUnit , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getCells() : CTableRow
• getCenter() : CLBoundingBox
• getCenterX() : CLRadialGradient
• getCenterY() : CLRadialGradient
• getCenterZ() : CLRadialGradient
• getChangedObjects() : CMathReaction
• getChangedProperties() : CUndoData
• getChannels() : CPlotItem
• getCharacterData() : CXMLParser
• getCheckForUpdates() : CConfigurationFile
• getChemEq() : CReaction
• getChemEqInterface() : CReactionInterface
• getChemEqString() : CChemEqInterface , CReactionInterface
• getChild() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter , CModelParameterGroup
• getChildObjectUnits() : CDataContainer , CMetab , CModel , CModelEntity , CReaction
• getChildrenCount() : CBitPatternTreeNode
• getCN() : CArrayElementReference , CCopasiParameter , CDataObject , CMathContainer , CMathObject , CModelParameter , CModelParameterSet , CObjectInterface
• getCNs() : CReactionParameter
• getCollapsedResult() : CSensProblem
• getCollapsedResultAnnotated() : CSensProblem
• getColorDefinition() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getColorString() : CCellDesignerImporter
• getColSliderPos() : CQBarChart
• getColumnIndex() : CCompressedColumnFormat::const_row_iterator
• getColumnNames() : CExperiment
• getColumns() : CSparseMatrix
• getColumnStart() : CCompressedColumnFormat
• getColumnValidValueCount() : CExperiment
• getComment() : CReportDefinition
• getCompareResult() : CModelParameter
• getCompartment() : CChemEqInterface , CMathContainer , CMetab
• getCompartmentCN() : CModelParameterSpecies
• getCompartmentNumber() : CChemEq , CReaction
• getCompartments() : CChemEq , CChemEqInterface , CModel
• getCompartmentValue() : CMathObject
• getCompiler() : CJitExpression
• getCompleteInitialState() : CMathContainer
• getComponents() : CUnit , CUnitParserBase
• getConcentration() : CMetab
• getConcentrationData() : CTimeSeries
• getConcentrationRate() : CMetab
• getConcentrationRateReference() : CMetab
• getConcentrationRateUnit() : CReactionInterface
• getConcentrationReference() : CMetab
• getConfigDir() : COptions
• getConfigFile() : COptions
• getConfiguration() : CConfigurationFile::CXML , CRootContainer
• getConstant() : CNodeK
• getConstraintEvaluations() : COptProblem
• getConstraintList() : COptProblem
• getConstraintViolation() : CFitConstraint , CFitItem , COptItem
• getContainerVariables() : COptProblem
• getContentType() : CDataModel
• getContinueFromCurrentState() : CScanProblem
• getContinueOnError() : CScanProblem
• getConvergenceOutTolerance() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getConvergenceTolerance() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getCopasi2SBMLMap() : CDataModel
• getCOPASI2SBMLMap() : CSBMLExporter
• getCopasi2SEDMLMap() : CDataModel
• getCopasiColorStr() : CPlotColors
• getCopasiDir() : COptions
• getCOPASIkey() : SBMLReference
• getCopyright() : Copasi2SBMLTranslator
• getCorrelations() : CFitProblem
• getCorrespondingProperty() : CMathObject
• getCorrespondingTransientObject() : CModel
• getCountAssignments() : CMathContainer
• getCountDependentSpecies() : CMathContainer
• getCounters() : COptProblem
• getCountFixed() : CMathContainer
• getCountFixedEventTargets() : CMathContainer
• getCountIndependentSpecies() : CMathContainer
• getCountNoise() : CMathContainer
• getCountODEs() : CMathContainer
• getCountOfDependentReactions() : CMetab
• getCovarianceMatrix() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixReduced() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getCreatedDT() : CMIRIAMInfo
• getCreateParameterSets() : CFitProblem
• getCreators() : CMIRIAMInfo
• getCrossingsLimit() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getCrossValidation() : CFitItem
• getCrossValidationCount() : CFitItem
• getCrossValidationRMS() : CFitProblem
• getCrossValidations() : CFitItem
• getCrossValidationSD() : CFitProblem
• getCrossValidationSet() : CFitProblem
• getCrossValidationSolutionValue() : CFitProblem
• getCurrentAuthorEmail() : CConfigurationFile
• getCurrentAuthorFamilyName() : CConfigurationFile
• getCurrentAuthorGivenName() : CConfigurationFile
• getCurrentAuthorOrganization() : CConfigurationFile
• getCurrentByteCount() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentByteIndex() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentColumnNumber() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentGeneration() : COptPopulationMethod
• getCurrentGroup() : CXMLParser
• getCurrentLineNumber() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentParameters() : COptMethod , COptMethodCoranaWalk , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodSA , COptMethodStatistics , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch
• getCurrentSBMLDocument() : CDataModel
• getCurrentSEDMLDocument() : CDataModel
• getCurrentStep() : CTSSAMethod
• getCurrentValue() : COptMethod , COptMethodCoranaWalk , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodSA , COptMethodStatistics , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch
• getCurrentVersion() : CModelVersionHierarchy
• getCurrentWallTime() : CCopasiTimeVariable
• getCurve() : CLGlyphWithCurve
• getCurveBoundingBox() : CLLayoutRenderer
• getCurveElement() : CLRenderCurve
• getCurveSegments() : CLCurve
• getCX() : CLEllipse
• getCY() : CLEllipse
• getCZ() : CLEllipse
• getDashArray() : CLGraphicalPrimitive1D
• getData() : CCopasiNode< _Data > , CCopasiTree< _Node > , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeObject , CTimeSeries , CUndoData
• getDataModel() : CSEDMLExporter , SEDMLImporter
• getDatamodelList() : CRootContainer
• getDataObject() : CDataObject , CMathContainer , CMathObject , CObjectInterface
• getDataObjects() : CExperimentObjectMap
• getDataPointCount() : CExperimentSet
• getDataType() : CRDFLiteral
• getDate() : CModification
• getDays() : CCopasiTimeVariable
• getDefault() : CCopasiParameter
• getDefaultCompartment() : CChemEqInterface
• getDefaultFileName() : CDataModel
• getDefaultMode() : CDataArray
• getDefaultNoiseExpression() : CModelEntity , CReaction
• getDefaultPlotIndex() : COutputAssistant
• getDefaultReportIndex() : COutputAssistant
• getDefaults() : CReadConfig
• getDefaultScale() : CExperiment , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap
• getDefaultScalingCompartment() : CReactionInterface
• getDelayAssignment() : CEvent
• getDelayExpression() : CEvent
• getDelayExpressionPtr() : CEvent
• getDelayLags() : CMathContainer
• getDeletedParameters() : CReactionInterface
• getDependentData() : CExperiment , CExperimentSet
• getDependentDataCount() : CExperimentSet
• getDependentErrorMean() : CExperimentSet
• getDependentErrorMeanSD() : CExperimentSet
• getDependentItems() : COptItem
• getDependentNumber() : CMoiety
• getDependentNumberReference() : CMoiety
• getDependentObjectiveValues() : CExperimentSet
• getDependentObjects() : CExperimentSet
• getDependentObjectsMap() : CExperiment
• getDependentRMS() : CExperimentSet
• getDependents() : CDependencyGraph , CDependencyGraphNode , CMathDependencyNode
• getDepth() : CLDimensions
• getDescendants() : CDataContainer
• getDescendantsWithPredicate() : CRDFNode
• getDescription() : CCopasiTask , CDataArray , CMoiety , Copasi2SBMLTranslator , CReference
• getDetails() : SBMLIncompatibility
• getDimensionality() : CCompartment
• getDimensionDescription() : CDataArray
• getDimensions() : CLayout , CLBoundingBox , CLGraphicalObject
• getDiretory() : CModelVersionHierarchy
• getDisableJIT() : CConfigurationFile
• getDisplayExpressionString() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• getDisplayFunctionString() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterXPPAUT
• getDisplayName() : CMetabNameInterface , CMIRIAMResourceObject , CRDFPredicate
• getDisplayString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CExpression , CSBMLunit , CSBMLunitInformation
• getDOTNodeId() : CMathDependencyGraph
• getDoublePrecision() : CConfigurationFile
• getDuplicateFromCN() : CModelExpansion::ElementsMap
• getDuplicateFromObject() : CModelExpansion::ElementsMap
• getDuration() : CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getDuringData() : CDataHandler
• getEffectiveKineticLawUnit() : CReactionInterface
• getEffectiveKineticLawUnitType() : CReaction , CReactionInterface
• getEigenValues() : CSteadyStateTask
• getEigenValuesReduced() : CSteadyStateTask
• getEigenValueStatus() : CLNAMethod
• getElapsedTime() : CCopasiTimer
• getElapsedTimeSeconds() : CCopasiTimer
• getElement() : CLGroup , CLPolygon
• getElementCount() : COptLog
• getElementIndex() : CCommonName
• getElementName() : CCommonName , CXMLHandler
• getElementTemplates() : CCopasiParameterGroup
• getEmail() : CCreator
• getEnd() : CLLineSegment
• getEndHead() : CLGroup , CLRenderCurve
• getEndValue() : CProcessReportItem
• getEndValuePointer() : CProcessReportItem
• getEntities() : CStateTemplate
• getEntityType() : CMathContainer , CMathObject
• getEnvironmentVariable() : COptions
• getEquation() : CMoiety
• getErrorCode() : CExpatTemplate< CType >
• getErrorMean() : CExperiment
• getErrorMeanSD() : CExperiment
• getErrorMesssage() : CRungeKutta
• getErrorPosition() : CEvaluationParserBase , CEvaluationTree
• getErrorString() : CExpatTemplate< CType >
• getErrorSum() : CExperiment
• getEvent() : CMathEventQueue::CAction
• getEvents() : CMathContainer , CModel
• getEventTargets() : CObjectLists
• getExecutionTime() : CMathEvent , CMathEventQueue::CKey , COptProblem
• getExpandedMetabList() : CReactionInterface
• getExpatVersion() : CExpatTemplate< CType >
• getExpectedElements() : CXMLHandler
• getExperiment() : CExperimentFileInfo , CExperimentSet , CFitItem
• getExperimentCount() : CExperimentSet , CFitItem
• getExperimentNames() : CExperimentFileInfo
• getExperiments() : CFitItem
• getExperimentSet() : CFitProblem
• getExperimentType() : CExperiment , CExperimentSet
• getExplicitFunctionString() : CNodeK
• getExponent() : CUnitComponent
• getExponentNumber() : CLyapProblem
• getExponentOfSymbol() : CUnit
• getExportActivePlotsOnly() : CSEDMLExporter
• getExportExecutableTasksOnly() : CSEDMLExporter
• getExportSpecificPlots() : CSEDMLExporter
• getExpression() : CEventAssignment , CModelEntity , CMoiety , CUnit
• getExpressionPtr() : CEventAssignment , CMathObject , CModelEntity
• getExpressions() : CSBMLunitInterface
• getExpressionTree() : CReaction
• getFailedEvaluationsExc() : COptProblem
• getFailedEvaluationsNaN() : COptProblem
• getFamilyName() : CCreator
• getFastParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getFastReactionPointerAnn() : CCSPMethod
• getFastReactionPointerNormedAnn() : CCSPMethod
• getFieldValue() : CRDFNode
• getFileExtension() : Copasi2SBMLTranslator
• getFileName() : CDataModel , CExperiment , CExperimentFileInfo
• getFilename() : CFunctionDB
• getFileNameOnly() : CExperiment
• getFileNames() : CExperimentSet
• getFileType() : Copasi2SBMLTranslator
• getFillColor() : CLGraphicalPrimitive2D
• getFillRule() : CLGraphicalPrimitive2D
• getFireAtInitialTime() : CEvent
• getFirstCModelOrDefault() : CReaction
• getFirstMessage() : CCopasiMessage
• getFirstModel() : SedmlInfo
• getFirstReport() : SedmlInfo
• getFirstRow() : CExperiment
• getFirstTaskWithOutput() : SedmlInfo
• getFirstUnconvertedRow() : CStepMatrix
• getFirstUnusedSection() : CExperimentFileInfo
• getFirstWorstIssue() : CValidity
• getFisherInformation() : CFitProblem
• getFisherInformationEigenvalues() : CFitProblem
• getFisherInformationEigenvectors() : CFitProblem
• getFitTask() : ResultData
• getFittingPoints() : CExperiment
• getFlagLimitConvergence() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getFlagLimitCrossings() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutConvergence() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutCrossings() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutTime() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getFlux() : CReaction
• getFluxes() : CMathContainer
• getFluxMode() : CTableauLine
• getFluxModeDescription() : CEFMTask
• getFluxModes() : CEFMProblem , CEFMTask
• getFluxObject() : CMathReaction
• getFluxReference() : CReaction
• getFocalPointX() : CLRadialGradient
• getFocalPointY() : CLRadialGradient
• getFocalPointZ() : CLRadialGradient
• getFogColor() : CLLayoutRenderer
• getFogDensity() : CLLayoutRenderer
• getFontFamily() : CLGroup , CLText
• getFontSize() : CLGroup , CLText
• getFontSpec() : CLLayoutRenderer
• getFontStyle() : CLGroup , CLText
• getFontWeight() : CLGroup , CLText
• getFooterAddr() : CReportDefinition
• getFunction() : CReaction , CReactionInterface
• getFunctionalRole() : CLMetabReferenceGlyph
• getFunctionDefinitionForName() : SBMLImporter
• getFunctionDescription() : CReactionInterface
• getFunctionEvaluations() : COptProblem
• getFunctionList() : CCopasiXML , CRootContainer
• getFunctionName() : CReactionInterface
• getFunctionParameters() : CFunctionParameterMap , CReaction
• getGivenName() : CCreator
• getGlobalQuantityCN() : CModelParameterReactionParameter
• getGradientBase() : CLRenderResolver
• getGradientDefinition() : CLRenderInformationBase
• getGradientStop() : CLGradientBase
• getGraphicalObject() : CLTextGlyph
• getGraphicalObjectKey() : CLTextGlyph
• getGreen() : CLColorDefinition
• getGroup() : CCopasiParameterGroup , CLLineEnding , CLStyle
• getGUI() : CCopasiXML , CDataModel
• getHandler() : CXMLHandler , CXMLHandlerFactory , CXMLParser
• getHeader() : COptLogEntry , COptLogItem
• getHeaderAddr() : CReportDefinition
• getHeaderRow() : CExperiment
• getHeight() : CLDimensions , CLGraphicalObject , CLImage , CLRectangle
• getHierarchy() : CEigen
• getHighestSeverity() : CCopasiMessage , CValidity
• getHighlightColor() : CLLayoutRenderer
• getHighlightedObjects() : CLLayoutRenderer
• getHighlightFlag() : CLLayoutRenderer
• getHistory() : CMathContainer
• getHome() : COptions
• getHours() : CCopasiTimeVariable
• getI() : CEigen
• getId() : CBiologicalDescription , CLColorDefinition , CLGradientBase , CLLineEnding , CMIRIAMResourceObject , CRDFNode , CReference , SBMLUtils
• getIdentifier() : CSBMLunitInterface
• getIdentifiersOrgURL() : CMIRIAMResource , CMIRIAMResourceObject
• getIdentityMatrix() : CLTransformation
• getIdentityMatrix2D() : CLTransformation2D
• getIdFromSBase() : SBMLUtils
• getIdsFromNode() : SBMLImporter
• getIgnoreStop() : CProcessReport
• getImageReference() : CLImage
• getImportanceIndexAnn() : CCSPMethod
• getImportanceIndexNormedRowAnn() : CCSPMethod
• getImportCOPASIMIRIAM() : SBMLImporter
• getIncomingTriplets() : CRDFGraph
• getIndependentData() : CExperiment , CExperimentSet
• getIndependentObjects() : CExperiment
• getIndex() : CCopasiParameterGroup , CDataContainer , CDataVector< CType > , CDataVectorN< CType > , CEvaluationNodeVariable , CMetabOld , CModelParameter , CModelParameterSet , CNodeK , CStateTemplate , ResultData
• getInfix() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CEvaluationTree
• getInfo() : CSBMLunitInformation
• getInitialConcentration() : CMetab
• getInitialConcentrationReference() : CMetab
• getInitialDependencies() : CMathContainer
• getInitialExpression() : CModelEntity , CModelParameter
• getInitialExpressionPtr() : CModelEntity , CModelParameter
• getInitialState() : CMathContainer
• getInitialStateObjects() : CMathContainer
• getInitialTime() : CModel
• getInitialTotalNumberReference() : CMoiety
• getInitialValue() : CModelEntity
• getInitialValueObject() : CMathContainer
• getInitialValuePointer() : CMathContainer
• getInitialValueReference() : CModelEntity , CMoiety
• getInitialValues() : CAbstractLayoutInterface , CCopasiSpringLayout
• getInputContext() : CExpatTemplate< CType >
• getIntensiveNoiseReference() : CMetab
• getInterfaces() : COutputHandler
• getInternalSpecies() : CEFMTask
• getInterruption() : CExperimentFileInfo
• getIntervalUpdateSequence() : COptItem
• getIsEnabledRotationalMapping() : CLLineEnding
• getIssueMessages() : CValidity
• getItem() : COutputAssistant
• getItemName() : COutputAssistant
• getItems() : CPlotSpecification , ResultData
• getJacobian() : CSteadyStateTask
• getJacobianAnnotated() : CSteadyStateTask
• getJacobianReduced() : CSteadyStateTask
• getJacobianXAnnotated() : CSteadyStateTask
• GetJitBufferSize() : CJitCompilerImplementation
• getKey() : CAnnotation , CBiologicalDescription , CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CCopasiTask , CCreator , CDataObject , CEvent , CEventAssignment , CFunction , CFunctionParameter , CIndexedPriorityQueue , CLayout , CLColorDefinition , CLEllipse , CLGradientBase , CLGradientStop , CLGraphicalObject , CLGroup , CLImage , CListOfLayouts , CLLineEnding , CLPolygon , CLRectangle , CLRenderCurve , CLRenderInformationBase , CLStyle , CLText , CMIRIAMInfo , CModel , CModelEntity , CModelParameterSet , CModification , CMoiety , COutputDefinitionVector , CReaction , CReference , CReportDefinition , CReportDefinitionVector , CSlider , CTimeSeries , CUnitDefinition
• getKeyFactory() : CRootContainer
• getKeyList() : CLLocalStyle
• getKind() : CIssue , CUnitComponent
• getKineticLawUnit() : CReaction
• getKineticLawUnitType() : CReaction , CReactionInterface
• getL() : CModel
• getL0() : CModel
• getLanguage() : CRDFLiteral
• getLAnnotation() : CModel
• getLargestCompartment() : CChemEq , CReaction
• getLargestReactionCompartment() : CMathContainer
• getLastColumn() : CExperimentObjectMap
• getLastExecution() : CUndoStack
• getLastFilledCell() : CTableRow
• getLastMessage() : CCopasiMessage
• getLastNotIgnoredColumn() : CExperimentObjectMap
• getLastRow() : CExperiment
• getLastStartValue() : COptItem
• getLayout() : CCellDesignerImporter
• getLayoutInterface() : CLayoutEngine
• getLayoutList() : CCopasiXML , CXMLParser
• getLeft() : CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeOperator , CNodeK
• getLengthUnit() : CModel
• getLengthUnitName() : CModel
• getLexicalData() : CRDFLiteral
• getLicenseHTML() : CRootContainer
• getLicenseTxt() : CRootContainer
• getLineEnding() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getListOfChildNodes() : CEvaluationNodeCall
• getListOfColorDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getListOfCompartmentGlyphs() : CLayout
• getListOfCompartments() : CChemEqInterface
• getListOfConflictingNodes() : CSBMLunitInterface
• getListOfConstObjects() : CObjectLists
• getListOfContainer() : CExpression
• getListOfCurveElements() : CLRenderCurve
• getListOfDefaultOutputDescriptions() : COutputAssistant
• getListOfDisplayNames() : CChemEqInterface
• getListOfElements() : CLGroup , CLPolygon
• getListOfGeneralGlyphs() : CLayout
• getListOfGlobalRenderInformationObjects() : CListOfLayouts
• getListOfGradientDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getListOfGradientStops() : CLGradientBase
• getListOfLayouts() : CDataModel
• getListOfLineEndings() : CLRenderInformationBase
• getListOfLocalParametersWithGivenUnitStatus() : CSBMLunitInterface
• getListOfLocalRenderInformationObjects() : CLayout
• getListOfMetaboliteGlyphs() : CLayout
• getListOfMetabReferenceGlyphs() : CLReactionGlyph
• getListOfMetabs() : CReactionInterface
• getListOfMultiplicities() : CChemEqInterface
• getListOfObjects() : CObjectLists
• getListOfObjectsWithGivenUnitStatus() : CSBMLunitInterface
• getListOfPoints() : CLCurve
• getListOfPossibleFunctions() : CReactionInterface
• getListOfReactionGlyphs() : CLayout
• getListOfReferenceGlyphs() : CLGeneralGlyph
• getListOfSpecies() : CChemEqInterface
• getListOfStyles() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation
• getListOfSubglyphs() : CLGeneralGlyph
• getListOfTextGlyphs() : CLayout
• getListType() : CSensItem
• getListTypeDisplayName() : CSensItem
• getLiteral() : CRDFObject
• getLocalResourceNodeMap() : CRDFGraph
• getLocalTime() : CUndoData
• getLocalValue() : CFitItem , CReactionInterface
• getLowerBound() : COptItem
• getLowerBoundValue() : COptItem
• getMap() : CModelExpansion::ElementsMap , CReaction
• getMappedUnitFromIdentifier() : CSBMLunitInterface
• getMappedUnitFromNumberNode() : CSBMLunitInterface
• getMapping() : CReactionInterface
• getMappings() : CReactionInterface
• getMassVector() : CAbstractLayoutInterface
• getMathContainer() : CCopasiMethod , CCopasiProblem , CCopasiTask , CModel
• getMathML() : Expression2PresentationMMLUnits
• getMathObject() : CMathContainer
• getMathReaction() : CMathContainer
• getMatrix() : CLTransformation
• getMatrix2D() : CLTransformation2D
• getMaximagpart() : CEigen
• getMaxLogVerbosity() : COptMethod , COptMethodCoranaWalk , COptMethodDE , COptMethodEP , COptMethodGA , COptMethodGASR , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodPS , COptMethodSA , COptMethodSRES , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch
• getMaxrealpart() : CEigen
• getMaxValue() : CSlider
• getMessage() : CCopasiException , SBMLIncompatibility
• getMessageAboutUnknownUnits() : CSBMLunitInterface
• getMetabGlyph() : CLMetabReferenceGlyph
• getMetabGlyphKey() : CLMetabReferenceGlyph
• getMetabolite() : CChemEqElement , CMetabNameInterface
• getMetaboliteKey() : CChemEqElement , CMetabNameInterface
• getMetabolites() : CCompartment , CModel
• getMetabolitesX() : CModel
• getMetaData() : CUndoData
• getMetaDataProperty() : CUndoData
• getMethod() : CCopasiTask
• getMethodLog() : COptMethod , CSteadyStateMethod
• getMicroSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getMilliSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getMinutes() : CCopasiTimeVariable
• getMinValue() : CSlider
• getMiriamAnnotation() : CAnnotation
• getMIRIAMCitation() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMDeprecated() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMDisplayName() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMLastUpdateDate() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMMIRIAMResource() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMNamespaceEmbeddedInPattern() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMPattern() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMResource() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMResourceIndex() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMResourceObject() : CBiologicalDescription , CReference
• getMIRIAMResources() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMUpdateFrequency() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMURI() : CMIRIAMResource
• getMMLName() : CMathMl
• getMMLString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeNumber , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeUnit , CEvaluationNodeVariable
• getMode() : CDataArray
• getModel() : CCopasiXML , CDataModel , CMathContainer , CMCAMethod , CModelEntity , CModelParameter , CModelParameterSet , CSBMLunitInterface , CXMLParser
• getModelForDataGen() : SedmlInfo
• getModelForTask() : SedmlInfo
• getModelId() : CSEDMLExporter , SedmlImportOptions
• getModelObject() : CLGraphicalObject
• getModelObjectCN() : CFittingPoint
• getModelObjectDisplayName() : CLGraphicalObject
• getModelObjectKey() : CLGraphicalObject
• getModelObjectName() : CLGraphicalObject
• getModelParameter() : CModelParameterGroup , CModelParameterSet
• getModelParameterSets() : CModel
• getModelReaction() : CMathReaction
• getModelType() : CModel
• getModelValues() : CModel
• getModifications() : CMIRIAMInfo
• getModifierCompartments() : CChemEqParserBase
• getModifierMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getModifierNames() : CChemEqParserBase
• getModifiers() : CChemEq
• getModulus() : CRandom
• getMoieties() : CModel
• getMoiety() : CMetab
• getMolecularity() : CChemEq , CChemEqInterface
• getMsgId() : COptLogItem
• getMultiplicity() : CChemEqElement
• getMultiplier() : CFluxMode , CStepMatrixColumn , CTableauLine , CUnitComponent
• getName() : CCopasiParameterGroup , CExperimentObjectMap , CLRenderInformationBase , CModelParameter , CModelParameterSet , CModelParameterSpecies , CModelVersion , CNodeK , Copasi2SBMLTranslator , CReactionResult , CTableCell , CXMLAttributeList , VariableInfo
• getNames() : CDataHandler
• getNameSpaceMap() : CRDFGraph
• getNameSpaceQualifier() : CRDFUtilities
• getNcplxconj() : CEigen
• getNetReaction() : CEFMTask
• getNetReactionData() : CEFMTask
• getNewData() : CUndoData
• getNext() : CCopasiNode< _Data >
• getNextId() : SEDMLUtils
• getNextNonChild() : CCopasiNode< _Data >
• getNextUnusedSection() : CExperimentFileInfo
• getNimag() : CEigen
• getNnegreal() : CEigen
• getNode() : CMIRIAMResourceObject
• getNodeIterator() : CModelVersionHierarchy
• getNodeList() : CEvaluationParserBase , CEvaluationTree
• getNodeObject() : CEvaluationTree , CExpression
• getNodes() : CEvaluationNodeVector , CKinFunction
• getNoise() : CMathContainer
• getNoiseExpression() : CModelEntity , CReaction , CReactionInterface
• getNoiseExpressionPtr() : CModelEntity , CReaction
• getNoiseInputObjects() : CMathContainer
• getNoiseReference() : CModelEntity , CReaction
• getNoiseSequence() : CMathContainer
• getNonOptions() : COptions
• getNormalizeWeightsPerExperiment() : CExperiment
• getNotes() : CAnnotation
• getNposreal() : CEigen
• getNreal() : CEigen
• getNthCnOfType() : CExperimentObjectMap
• getNumAssignmentMetabs() : CModel
• getNumber() : CCopasiMessage , CMoiety
• getNumber2QuantityFactor() : CModel
• getNumberBalance() : CMathReaction
• getNumberOfBits() : CZeroSet
• getNumberOfParametersByUsage() : CFunctionParameters
• getNumberOfScanItems() : CScanProblem
• getNumberOfSetBits() : CZeroSet
• getNumberOfSubtaskCalculations() : CSensMethod
• getNumberOfUnsetBits() : CZeroSet
• getNumberOfVariables() : CSensProblem
• getNumChannels() : CPlotItem
• getNumChildren() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter , CModelParameterGroup
• getNumColorDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getNumColumns() : CExperiment
• getNumCopasiColors() : CPlotColors
• getNumCurveSegments() : CLCurve
• getNumDataRows() : CExperiment
• getNumDependent() : CLinkMatrix , CStateTemplate
• getNumDependentReactionMetabs() : CModel
• getNumElements() : CLGroup , CLPolygon , CLRenderCurve
• getNumFixed() : CStateTemplate
• getNumGenerations() : COptPopulationMethod
• getNumGradientDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getNumGradientStops() : CLGradientBase
• getNumIndependent() : CLinkMatrix , CStateTemplate
• getNumIndependentReactionMetabs() : CModel
• getNumKeys() : CLLocalStyle
• getNumLineEndings() : CLRenderInformationBase
• getNumMetabs() : CModel
• getNumModelValues() : CModel
• getNumODEMetabs() : CModel
• getNumParameters() : CTimeSensProblem
• getNumRoles() : CLStyle
• getNumSteps() : CScanItem
• getNumStyles() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation , CLRenderInformationBase
• getNumTargets() : CTimeSensProblem
• getNumTypes() : CLStyle
• getNumUnconvertedRows() : CStepMatrix
• getNumVariable() : CStateTemplate
• getNumVariableMetabs() : CModel
• getNumVariables() : CAbstractLayoutInterface , CTimeSeries
• getNzero() : CEigen
• getObject() : CCopasiParameterGroup , CDataArray , CDataContainer , CDataMatrixReference< CType > , CDataObject , CDataVector< CType > , CDataVectorN< CType > , CDataVectorReference< CType > , CMathContainer , CMathDependencyNode , CMathObject , CModelParameter , CObjectInterface , COptItem , CRDFNode , CReaction , CScanItem , CUndoData
• getObjectAncestor() : CDataObject
• getObjectBalance() : CMathReaction
• getObjectCN() : CEvaluationNodeObject , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , COptItem , CUndoData
• getObjectDataModel() : CDataObject , CLRenderResolver
• getObjectDisplayName() : CArrayElementReference , CCopasiParameter , CCopasiReportSeparator , CDataArray , CDataObject , CDataObjectReference< CType > , CDataString , CEvent , CFittingPoint , CMathObject , CMetab , CObjectInterface , COptItem , CReaction , CUndoData
• getObjectForSbmlId() : SEDMLUtils
• getObjectFromCN() : CDataObject , CMathContainer
• GetObjectFromCN() : CObjectInterface
• getObjectInterfacePtr() : CEvaluationNodeObject
• getObjectiveFunction() : COptProblem
• getObjectiveValue() : CExperiment
• getObjectiveValues() : COptPopulationMethod
• getObjectMap() : CExperiment
• getObjectName() : CCommonName , CDataObject
• getObjectNameVector() : CReportTable
• getObjectParent() : CDataObject
• getObjectRole() : CLGraphicalObject
• getObjects() : CDataContainer , CFunctionParameterMap , COutputInterface , CReactionParameter
• getObjectsAt() : CLLayoutRenderer
• getObjectsAtViewportPosition() : CLLayoutRenderer
• getObjectsForSelection() : CExpressionGenerator
• getObjectsInBoundingBox() : CLLayoutRenderer
• getObjectType() : CCommonName , CDataObject , CUndoData
• getObjectUnit() : CModelParameterGroup , CUnitValidator
• getObjectUnits() : CUnitValidator
• getObjectValue() : CFitItem , COptItem
• getObjectValuePtr() : CEvaluationNodeObject
• getOffset() : CLGradientStop
• getOldData() : CUndoData
• getOptConstraint() : COptProblem
• getOptConstraintSize() : COptProblem
• getOptItem() : COptProblem
• getOptItemList() : COptProblem
• getOptItemSize() : COptProblem
• getOptTask() : ResultData
• getORG() : CCreator
• getOriginalValue() : CSlider
• getOriginFor() : CEvent
• getOutCrossingsLimit() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getOutputEvent() : CTrajectoryProblem
• getOutputHandler() : CCopasiTask
• getOutputInSubtask() : CScanProblem
• getOutputMode() : CCopasiTask
• getOutputStartTime() : CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getParameter() : CCopasiParameterGroup
• getParameterByUsage() : CFunctionParameters
• getParameterCN() : CTimeSensProblem
• getParameterCNs() : CReaction
• getParameterEstimationJacobian() : CFitProblem
• getParameterIndex() : CReaction
• getParameterName() : CReactionInterface
• getParameterObjects() : CReaction
• getParameters() : CFunctionParameters , CReaction
• getParameterValue() : CReaction
• getParameterValueAsString() : CSEDMLExporter
• getParent() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter , CUndoData
• getParentName() : CModelVersion
• getParentSubjects() : CRDFGraph
• getParentVersion() : CModelVersionHierarchy
• getParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getParticipationIndexNormedColumnAnn() : CCSPMethod
• getParticipationIndexNormedRowAnn() : CCSPMethod
• getParticleFlux() : CModel , CReaction
• getParticleFluxes() : CMathContainer
• getParticleFluxObject() : CMathReaction
• getParticleFluxReference() : CReaction
• getParticleNoiseReference() : CReaction
• getPath() : CRDFNode
• getPersistentTrigger() : CEvent
• getPlainLog() : COptLog
• getPlotDefinitionList() : CDataModel
• getPlotList() : CCopasiXML , CXMLParser
• getPlots() : SedmlImportOptions
• getPlotsForTask() : SedmlInfo
• getPointers() : CFunctionParameterMap
• getPopulation() : COptPopulationMethod
• getPopulationSize() : COptPopulationMethod
• getPosition() : CLBoundingBox , CLGraphicalObject
• getPositionPoint() : CCellDesignerImporter
• getPossibleTargetFunctions() : CSensProblem
• getPossibleVariables() : CSensProblem
• getPostProcessData() : CUndoData
• getPotential() : CAbstractLayoutInterface , CCopasiSpringLayout
• getPrecision() : CReportDefinition
• getPredicate() : CBiologicalDescription
• getPredicateFromDisplayName() : CRDFPredicate
• getPredicateFromURI() : CRDFPredicate
• getPredicatePath() : CRDFGraph
• getPreProcessData() : CUndoData
• getPrerequisites() : CDataObject , CMathDependencyNode , CMathExpression , CMathObject , CObjectInterface
• getPrimary() : CCommonName
• getPriority() : CMathEvent , CMathEventQueue::CAction
• getPriorityExpression() : CEvent
• getPriorityExpressionPtr() : CEvent
• getProblem() : CCopasiTask
• getProcessingModes() : CMathDependencyNodeIterator , CNodeContextIterator< Node, Context >
• getProcessLogic() : AdditionalGraphicalObjectHandler , AssignmentHandler , BoundingBoxHandler , CallParameterHandler , ChannelSpecHandler , CharacterDataHandler , ColorDefinitionHandler , CommentHandler , CompartmentGlyphHandler , CompartmentHandler , ConstantHandler , COPASIHandler , CubicBezierHandler , CurveHandler , CXMLHandler , DimensionsHandler , EllipseHandler , EventHandler , FunctionHandler , GradientStopHandler , GroupHandler , GUIHandler , ImageHandler , InitialStateHandler , KineticLawHandler , LayoutHandler , LinearGradientHandler , LineEndingHandler , LineSegmentHandler , ListOfCurveSegmentsHandler , ListOfGradientDefinitionsHandler , ListOfHandler , ListOfLayoutsHandler , MathMLHandler , MetaboliteGlyphHandler , MetaboliteHandler , MetaboliteReferenceGlyphHandler , MethodHandler , MiriamAnnotationHandler , ModelHandler , ModelParameterGroupHandler , ModelParameterHandler , ModelParameterSetHandler , ModelValueHandler , ModifierHandler , ObjectHandler , ParameterDescriptionHandler , ParameterGroupHandler , ParameterHandler , ParameterTextHandler , PlotItemHandler , PlotSpecificationHandler , PointHandler , PolygonHandler , ProductHandler , RadialGradientHandler , ReactionGlyphHandler , ReactionHandler , RectangleHandler , RenderCurveElementHandler , RenderCurveHandler , RenderInformationHandler , RenderTextHandler , ReportDefinitionHandler , ReportSectionHandler , ReportTargetHandler , SBMLMapHandler , SliderHandler , SourceParameterHandler , StateTemplateHandler , StateTemplateVariableHandler , StyleHandler , SubstrateHandler , TableHandler , TaskHandler , TextGlyphHandler , UnitDefinitionHandler , UNKNOWNHandler , UnsupportedAnnotationHandler
• getProcessQueue() : CMathContainer
• getProcessQueueExecutionTime() : CMathContainer , CMathEventQueue
• getProcessReport() : SBMLImporter , SEDMLImporter
• getProcessTime() : CCopasiTimeVariable
• getProductCompartments() : CChemEqParserBase
• getProductMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getProductNames() : CChemEqParserBase
• getProducts() : CChemEq
• getPropensities() : CMathContainer
• getPropensityObject() : CMathReaction
• getPropensityReference() : CReaction
• getProperty() : CData
• getProxyPassword() : CConfigurationFile
• getProxyPort() : CConfigurationFile
• getProxyServer() : CConfigurationFile
• getProxyUser() : CConfigurationFile
• getptc_() : CTruncatedNewton
• getPWD() : COptions
• getQuantity2NumberFactor() : CMathContainer , CModel
• getQuantity2NumberFactorObject() : CMathContainer
• getQuantityUnit() : CModel
• getQuantityUnitName() : CModel
• getR() : CEigen
• getRadicalPointerAnn() : CCSPMethod
• getRadius() : CLRadialGradient
• getRadiusX() : CLRectangle
• getRadiusY() : CLRectangle
• getRandomCC() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomCO() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomExp() : CRandom
• getRandomGamma() : CRandom
• getRandomGenerator() : CMathContainer
• getRandomizeStartValues() : COptProblem
• getRandomNormal() : CRandom
• getRandomNormal01() : CRandom
• getRandomNormalLog() : CRandom
• getRandomNormalPositive() : CRandom
• getRandomObject() : CMathContainer
• getRandomOO() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomPoisson() : CRandom
• getRandomS() : Cmt19937 , Cr250 , CRandom
• getRandomStdGamma() : CRandom
• getRandomU() : Cmt19937 , Cr250 , CRandom
• getRandomValue() : COptItem
• getRate() : CMathContainer , CModelEntity
• getRateReference() : CModelEntity
• getRDFGraph() : CMIRIAMInfo
• getReacSlowSpacePrintAnn() : CILDMMethod
• getReaction() : CModelParameterReactionParameter , CStepMatrixColumn
• getReactionCN() : CModelParameterReactionParameter
• getReactionEquation() : CEFMTask
• getReactionResults() : CModelAnalyzer
• getReactions() : CMathContainer , CModel
• getReactionScheme() : CReaction
• getReactionsPerSpecies() : CModel
• getReactionToFire() : CHybridMethodODE45
• getRecentFiles() : CConfigurationFile
• getRecentMIRIAMResources() : CConfigurationFile
• getRecentSBMLFiles() : CConfigurationFile
• getRecentSEDMLFiles() : CConfigurationFile
• getRecordedSteps() : CTimeSeries
• getRed() : CLColorDefinition
• getRedStoi() : CModel
• getRedStoiAnnotation() : CModel
• getReferenceDirectory() : CDataModel
• getReferenceRenderInformationKey() : CLRenderInformationBase
• getReferences() : CMIRIAMInfo
• getRelativeValue() : CLRelAbsVector
• getRemainder() : CCommonName
• getRemoteResourceNodes() : CRDFGraph
• getRenderInformation() : CLayout , CListOfLayouts
• getReorderedReactions() : CEFMProblem
• getReplacedExpression() : CUnitParserBase
• getReport() : CCopasiTask
• getReportDefinition() : CReport
• getReportDefinitionList() : CDataModel
• getReportFile() : SedmlImportOptions
• getReportFileName() : SedmlInfo
• getReportId() : SedmlImportOptions
• getReportList() : CCopasiXML , CXMLParser
• getReportsForTask() : SedmlInfo
• getResiduals() : CFitProblem
• getResource() : CBiologicalDescription , CMIRIAMResourceObject , CRDFObject , CRDFSubject , CReference
• getResourceIndexFromDisplayName() : CMIRIAMResources
• getResourceList() : CMIRIAMResourceObject , CMIRIAMResources
• getResult() : CCopasiTask , CFunctionAnalyzer , CSensProblem , CSteadyStateTask
• getResultAnnotated() : CSensProblem
• getResultString() : CReactionResult
• getReversibility() : CChemEq , CChemEqInterface
• getRichLog() : COptLog
• getRight() : CEvaluationNodeOperator , CNodeK
• getRMS() : CExperiment , CFitProblem
• getRole() : CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , CLMetabReferenceGlyph , CLReferenceGlyph
• getRoleDisplayName() : CLMetabReferenceGlyph
• getRoleList() : CLStyle
• getRoleListString() : CLStyle
• getRoot() : CBitPatternTree , CCopasiTree< _Node > , CEvaluationTree , CRootContainer
• getRootError() : CRootFinder
• getRootIsDiscrete() : CMathContainer
• getRootIsTimeDependent() : CMathContainer
• getRootNode() : CEvaluationParserBase , CMathDerive
• getRootProcessors() : CMathContainer
• getRoots() : CMathContainer , CMathEvent::CTrigger , CTimeSensMethod , CTrajectoryMethod
• getRootTime() : CRootFinder
• getRootValues() : CRootFinder
• getRow() : CMathHistoryCore
• getRowIndex() : CCompressedColumnFormat
• getRowPivots() : CLinkMatrix
• getRows() : CSparseMatrix
• getRowSliderPos() : CQBarChart
• getRX() : CLEllipse
• getRY() : CLEllipse
• getSBMLBoundingBox() : CLBoundingBox
• getSBMLDimensions() : CLDimensions
• getSBMLDocument() : CCellDesignerImporter , CSBMLExporter
• getSBMLFileName() : CDataModel
• getSBMLId() : CEvent , CFunction , CModelEntity , CReaction , CTimeSeries
• getSBMLid() : SBMLReference
• getSbmlId() : SEDMLUtils , VariableInfo
• getSBMLPoint() : CLPoint
• getSBMLUnitDefinition() : CSBMLunit
• getScale() : CExperiment , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , CUnitComponent
• getScaledBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getScaledConcentrationCC() : CMCAMethod
• getScaledConcentrationCCAnn() : CMCAMethod
• getScaledCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getScaledCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getScaledElasticities() : CMCAMethod
• getScaledElasticitiesAnn() : CMCAMethod
• getScaledFisherInformation() : CFitProblem
• getScaledFisherInformationEigenvalues() : CFitProblem
• getScaledFisherInformationEigenvectors() : CFitProblem
• getScaledFluxCC() : CMCAMethod
• getScaledFluxCCAnn() : CMCAMethod
• getScaledParameterEstimationJacobian() : CFitProblem
• getScaledResult() : CSensProblem
• getScaledResultAnnotated() : CSensProblem
• getScaledStateResult() : CTimeSensProblem
• getScaledStateResultAnnotated() : CTimeSensProblem
• getScaledTargetsResult() : CTimeSensProblem
• getScaledTargetsResultAnnotated() : CTimeSensProblem
• getScaling() : CSlider
• getScalingCompartment() : CReaction , CReactionInterface
• getScalingCompartmentCN() : CReaction
• getScalingMatrix() : CExperiment
• getScanItem() : CScanProblem
• getScore() : CTableauLine
• getSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getSEDMLDocument() : CSEDMLExporter , SEDMLImporter
• getSEDMLFileName() : CDataModel
• getSedMLStringForArchive() : SEDMLUtils
• getSegmentAt() : CLCurve
• getSelectedObject() : CAnalyticsProblem
• getSelection() : CLLayoutRenderer
• getSelectionBox() : CLLayoutRenderer
• getSeparate() : CDataHandler
• getSeparator() : CExperiment , CReportDefinition , CReportTable , CTableCell
• getSet() : CModelParameter
• getSetChild() : CBitPatternTreeNode
• getSeverity() : CIssue , SBMLIncompatibility
• getSibling() : CCopasiNode< _Data >
• getSimulationType() : CMathObject , CModelParameter
• getSimulationUpToDateObjects() : CMathContainer
• getSimulationValuesSequence() : CMathContainer
• getSingleLineComment() : CODEExporter , CODEExporterC
• getSingleObjectCN() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem , CSensItem
• getSingleObjectDisplayName() : CSensItem
• getSIUnit() : CUnitDefinition
• getSliderList() : SCopasiXMLGUI
• getSliderObject() : CSlider
• getSliderObjectCN() : CSlider
• getSliders() : CCopasiTask
• getSliderType() : CSlider
• getSliderValue() : CSlider
• getSlowParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getSolutionValue() : COptProblem
• getSolutionVariables() : COptProblem
• getSpeciesChanges() : CEFMTask
• getSpeciesCN() : CMetabNameInterface
• getSpreadMethod() : CLGradientBase
• getStabilityResolution() : CSteadyStateMethod
• getStart() : CLLineSegment
• getStartHead() : CLGroup , CLRenderCurve
• getStartInSteadyState() : CTrajectoryProblem
• getStartValue() : COptItem
• getState() : CCopasiTaskStatus , CMathContainer , CSteadyStateTask
• getStateObjects() : CMathContainer
• getStateResult() : CTimeSensProblem
• getStateResultAnnotated() : CTimeSensProblem
• getStateTemplate() : CModel
• getStaticString() : CDataString
• getStatistics() : CSBMLunitInterface
• getStatus() : CFunctionAnalyzer::CValue , CModelEntity
• getStatusDetails() : COptLogEntry , COptLogItem
• getStatValue() : CStatistics
• getStatValueReference() : CStatistics
• getStdDeviation() : CFitProblem
• getSteadyStateStatus() : CLNAMethod , CMCAMethod
• getStepMatrixColumn() : CBitPatternTreeNode
• getStepNumber() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem , CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getStepSize() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem , CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getStiffness() : CEigen
• getStochTimeAndIndex() : CHybridMethod
• getStoi() : CModel
• getStoiAnnotation() : CModel
• getStoichiometry() : CMathContainer
• getStopColor() : CLGradientStop
• getStream() : CReport
• getStroke() : CLGraphicalPrimitive1D
• getStrokeWidth() : CLGraphicalPrimitive1D
• getStyle() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation , CLRenderInformationBase
• getStyleForGraphicalObject() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation , CLRenderInformationBase
• getSubject() : CRDFNode
• getSubPathIndex() : CRDFPredicate
• getSubstrateCompartments() : CChemEqParserBase
• getSubstrateMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getSubstrateNames() : CChemEqParserBase
• getSubstrates() : CChemEq
• getSubTask() : CCopasiProblem , CLNAProblem , CMCAProblem , COptProblem , CScanProblem
• getSubtask() : CScanProblem
• getSubTask() : CSensProblem
• getSubtaskType() : COptProblem
• getSubTaskType() : CSensProblem
• getSubtext() : COptLogEntry , COptLogItem
• getSubType() : CCopasiMethod
• getSubtype() : CNodeK
• getSupportedOperations() : CExpressionGenerator
• getSymbol() : CBaseUnit , CUnitDefinition , VariableInfo
• getSymbolComponents() : CUnit
• getSymbolicExpExp() : CSBMLunit
• getSymbolicExponent() : CSBMLunit
• getSymbols() : CUnitParserBase
• getSynced() : CSlider
• getSynchronizeInitialValuesSequence() : CMathContainer
• getSystemSeed() : CRandom
• getTable() : CReportBody , CTSSAMethod
• getTableAddr() : CReportDefinition
• getTableNames() : CTSSAMethod
• getTag() : CLBase
• getTarget() : CMathEvent::CAssignment , CReport
• getTargetCN() : CEventAssignment , CTimeSensProblem
• getTargetFunctions() : CSensProblem
• getTargetGlyph() : CLReferenceGlyph
• getTargetGlyphKey() : CLReferenceGlyph
• getTargetObject() : CEventAssignment
• getTargetsResult() : CTimeSensProblem
• getTargetsResultAnnotated() : CTimeSensProblem
• getTargetValues() : CMathEvent
• getTaskId() : SedmlImportOptions
• getTaskList() : CCopasiXML , CDataModel , CXMLParser
• getTaskNames() : SedmlInfo
• getTasks() : SedmlInfo
• getTaskType() : CReportDefinition
• getTaskTypes() : CPlotSpecification
• getTemp() : COptions
• getTerm() : VariableInfo
• getTeX() : CStructureParser
• getText() : CCopasiMessage , CLText , CLTextGlyph
• getTextAnchor() : CLGroup , CLText
• getTextureSize() : CLFontRendererBase
• getThreadTime() : CCopasiTimeVariable
• getThreshold() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem , CCrossValidationSet
• getTickFactor() : CSlider
• getTickNumber() : CSlider
• getTime() : CHybridNextReactionLSODAMethod::LSODA , CModel , CUndoData
• getTimeData() : CExperiment
• getTimeForStep() : CTSSAMethod
• getTimeLimit() : CAnalyticsProblem , CCrossSectionProblem
• getTimeSensJac() : CFitProblem
• getTimeSeries() : CTimeSensTask , CTrajectoryTask , CTSSATask
• getTimestamp() : COptLogItem
• getTimeUnit() : CModel
• getTimeUnitName() : CModel
• getTitle() : CPlotItem , CReportDefinition , CTimeSeries
• getTMP1PrintAnn() : CILDMMethod
• getTMP2PrintAnn() : CILDMMethod
• getTMP3PrintAnn() : CILDMMethod
• getToggledRoots() : CRootFinder
• getTotalMasses() : CMathContainer
• getTotalNumberOfSteps() : CScanMethod
• getTotalNumberReference() : CMoiety
• getTotalValueCount() : CExperiment
• getTotSteps() : CModel
• getTransientDataValueSequence() : CMathContainer
• getTransientDependencies() : CMathContainer
• getTransientTime() : CLyapProblem
• getTransitionTime() : CMetab
• getTransitionTimeReference() : CMetab
• getTree() : CEvaluationNode
• getTreesWithDiscontinuities() : CModel
• getTreshold() : CSparseMatrix
• getTrigger() : CMathEvent
• getTriggerExpression() : CEvent
• getTriggerExpressionPtr() : CEvent
• getTriplet() : CBiologicalDescription , CCreator , CModification , CReference
• getTriplets() : CRDFGraph
• getType() : CCopasiMessage , CCopasiMethod , CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CCopasiProblem , CCopasiTask , CDataValue , CEvaluationTree , CEvent , CFunctionParameter , CMathEvent , CMathEventQueue::CAction , CModelParameter , CNodeK , CPlotItem , CRandom , CRDFLiteral , CRDFObject , CRDFPredicate , CRDFSubject , CUndoData , CVCard
• getTypeForObject() : CLGlobalRenderInformation
• getTypeList() : CLStyle
• getTypeListString() : CLStyle
• getUndefinedFunction() : CRootContainer
• getUndoStack() : CDataModel
• getUniqueParameterName() : CCopasiParameterGroup
• getUnit() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeUnit , CEvaluationNodeVariable , CEvaluationNodeVector , CModelParameter , CReactionInterface , CUnitValidator
• getUnitDefFromSymbol() : CRootContainer , CUnitDefinitionDB
• getUnitDefinitionImportList() : CXMLParser
• getUnitExpression() : CModelEntity
• getUnitList() : CRootContainer
• getUnits() : CCompartment , CDataContainer , CDataObject , CMetab , CModel , CModelValue , CUnitValidator
• getUnitSymbolUsage() : CModel
• getUnitVector() : CReactionInterface
• getUnknownMiriamResource() : CRootContainer
• getUnscaledBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledConcentrationCC() : CMCAMethod
• getUnscaledConcentrationCCAnn() : CMCAMethod
• getUnscaledCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledElasticities() : CMCAMethod
• getUnscaledElasticitiesAnn() : CMCAMethod
• getUnscaledFluxCC() : CMCAMethod
• getUnscaledFluxCCAnn() : CMCAMethod
• getUnsetBitIndexes() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod , CStepMatrix
• getUnsetChild() : CBitPatternTreeNode
• getUnsupportedAnnotations() : CAnnotation
• getUpdateActions() : CCopasiSpringLayout
• getUpdateSequence() : CMathDependencyGraph
• getUpperBound() : COptItem
• getUpperBoundValue() : COptItem
• getURI() : CBiologicalDescription , CMIRIAMResourceObject , CRDFPredicate , CReference
• getURL() : Copasi2SBMLTranslator , SBMLReference
• getUsage() : CFunctionParameter , CReactionInterface
• getUsedFunctions() : CFunctionDB
• getUsedSymbols() : CUnit
• getUsedUnits() : CModel
• getUserInterfaceFlag() : CCopasiParameter
• getUserOrder() : CStateTemplate
• getUseTimeSens() : CFitProblem
• getUseValues() : CTrajectoryProblem
• getUTCTime() : CUndoData
• getUTCTimeStamp() : CModelVersion
• getUuid() : CUndoObjectInterface
• getValidity() : CDataObject , CMathObject , CObjectInterface
• getValidMethods() : CAnalyticsTask , CCopasiTask , CCrossSectionTask , CEFMTask , CFitTask , CLNATask , CLyapTask , CMCATask , CMoietiesTask , COptTask , CScanTask , CSensTask , CSteadyStateTask , CTimeSensTask , CTrajectoryTask , CTSSATask
• getValidValueCount() : CExperiment , CExperimentSet
• getValidValues() : CCopasiParameter
• getValidValuesPointer() : CCopasiParameter
• getValue() : CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CFunctionAnalyzer::CValue , CMathObject , CModelEntity , CModelParameter , CModelParameterSpecies , COptions::COptionValue , COptions , CReactionParameter , CTableCell , CXMLAttributeList
• getValueChangeProhibited() : CMathContainer
• getValueFromNumberNode() : CSBMLunitInterface
• getValueObject() : CArrayElementReference , CDataContainer , CDataMatrixReference< CType > , CDataObject , CDataObjectReference< CType > , CDataVectorReference< CType > , CMathContainer , CMetab , CModelEntity
• getValuePointer() : CArrayElementReference , CCopasiParameter , CCopasiTimer , CDataMatrixReference< CType > , CDataObject , CDataObjectReference< CType > , CDataVectorReference< CType > , CEvaluationNode , CMathContainer , CMathObject , CMetab , CModelEntity , CObjectInterface , COptItem , COptProblem
• getValueReference() : CCopasiParameter , CModelEntity , CMoiety
• getValues() : CCompressedColumnFormat , CMathContainer , CTrajectoryProblem
• getValueString() : CTrajectoryProblem
• getValueType() : CEvaluationNode , CEvaluationParserBase , CMathObject
• getVariable() : CReadConfig
• getVariableGradients() : COptProblem
• getVariableIndex() : CEvaluationTree , CFunction
• getVariables() : CFunction , CSensProblem
• getVariablesDescription() : CAbstractLayoutInterface
• getVariableSize() : COptProblem
• getVariablesPointerList() : CSensItem
• getVariableStdDeviations() : CFitProblem
• getVariableUnits() : CUnitValidator
• getVariableValue() : CEvaluationTree , CFunction
• getVec_TimeScale() : CTSSAMethod
• getVersion() : CModelVersionHierarchy , Copasi2SBMLTranslator , CReadConfig , CVersion
• getVersionDevel() : CVersion
• getVersionDirectory() : CModelVersionHierarchy
• getVersionMajor() : CVersion
• getVersionMinor() : CVersion
• getVfastSpacePrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVolumeUnit() : CModel
• getVolumeUnitName() : CModel
• getVslowMetabPrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVslowPrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVslowSpacePrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVTextAnchor() : CLGroup , CLText
• getWeight() : CCrossValidationSet
• getWeightMethod() : CExperiment
• getWidth() : CLDimensions , CLGraphicalObject , CLImage , CLRectangle
• getWorkingDirectory() : CConfigurationFile
• getX() : CLGraphicalObject , CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText
• getXOffset() : CLRenderPoint
• getXpath() : VariableInfo
• getXPathAndName() : SEDMLUtils
• getXPathForObject() : SEDMLUtils
• getXPathForObjectAndType() : SEDMLUtils
• getXPathForSbmlIdAndType() : SEDMLUtils
• getXPoint1() : CLLinearGradient
• getXPoint2() : CLLinearGradient
• getXPPString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeUnit , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getY() : CLGraphicalObject , CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText
• getYOffset() : CLRenderPoint
• getYPoint1() : CLLinearGradient
• getYPoint2() : CLLinearGradient
• getZ() : CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText
• getZeroSet() : CBitPatternTreeNode , CStepMatrixColumn
• getZOffset() : CLRenderPoint
• getZoomFactor() : CLLayoutRenderer
• getZPoint1() : CLLinearGradient
• getZPoint2() : CLLinearGradient
• GG() : Cmd5
• globalIndex() : CContext< Data >
• gradient() : COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodSteepestDescent
• GradientStopHandler() : GradientStopHandler
• graphFromXml() : CRDFParser
• GroupHandler() : GroupHandler
• gtims_() : CTruncatedNewton
• guessColumnNumber() : CExperiment , CTableRow
• guessGraphRoot() : CRDFGraph
• GUIHandler() : GUIHandler