- g -

• CGA() : CGA
• CGraphCurve() : CGraphCurve
• CGraphNode() : CGraphNode
• GCD() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod
• generalize() : CFunctionAnalyzer::CValue
• generateCanonicalDNF() : CNormalLogical
• generatedNodeId() : CRDFGraph
• GenerateIdHandler() : CRDFParser
• generateObjectsFromName() : CReport
• generateReactionIndex() : CStochMethod
• generateReactionTime() : CHybridMethod , CHybridMethodLSODA , CHybridMethodODE45 , CStochMethod
• genrand_res53() : Cmt19937
• get() : CKeyFactory , CKeyFactory::HashTable
• get2DTransformationString() : CLTransformation2D
• get3DTransformationString() : CLTransformation
• get_autothrow_id() : copasi::autoexcept
• Get_BestFoundSoFar_candidate() : COptMethodEP2 , COptMethodHGASA
• get_help_comment() : copasi::option_error
• get_locations() : copasi::COptionParser
• get_non_options() : copasi::COptionParser
• Get_NumGeneration() : COptMethodEP2 , COptMethodHGASA
• Get_NumParameter() : COptMethodEP2 , COptMethodHGASA
• get_options() : copasi::COptionParser
• Get_PopulationSize() : COptMethodEP2 , COptMethodHGASA
• getAboutNode() : CRDFGraph
• getAbsoluteValue() : CLRelAbsVector
• getActDateInSeconds() : CMIRIAMResources
• getAction() : CProcessQueue
• getActivity() : C2DPlotCurve , CPlotItem
• getAffects() : CHybridMethod , CHybridMethodLSODA , CHybridMethodODE45 , CStochMethod
• getAllDependencies() : CCopasiObject
• getAllMessageText() : CCopasiMessage
• getAllowedLocationList() : CRDFPredicate
• getAllUnsetBitIndexes() : CBitPatternMethod , CStepMatrix , CStepMatrixColumn
• getAlpha() : CLColorDefinition
• getAmount() : CMoiety
• getAmplitudeAnn() : CCSPMethod
• getAndSets() : CNormalLogical
• getAnimationRunning() : CQLayoutMainWindow
• getAnnotation() : CMiaseBase
• getAnnotationsCN() : CArrayAnnotation
• getAnnotationsString() : CArrayAnnotation
• getAnyNote() : CMiaseAnnotation
• getApplicationFont() : CConfigurationFile
• getApplyInitialValueRefresh() : CConcentrationReference
• getArchiveFileName() : SEDMLImporter
• getAreaUnitEnum() : CModel
• getAreaUnitName() : CModel
• getAreaUnitsDisplayString() : CModel
• getArray() : CStateRecord
• getArrayLen() : CStateRecord
• getArrow() : CGraphCurve
• getArrowLength() : CArrow
• getArrowWidth() : CArrow
• getAspect() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getAssignments() : CEvent , CMathEventN
• getAssignmentTime() : CMathEvent
• getAssociatedEntityKey() : CSlider
• getAttribute() : CXMLAttributeList
• getAttributeValue() : CExpatTemplate< CType >
• getAuthor() : Copasi2SBMLTranslator
• getAvogadro() : CModel
• getBackgroundColor() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getBackwardAction() : CQPlayerControlWidget
• getBalances() : CChemEq
• getBase1() : CLLineSegment
• getBase2() : CLLineSegment
• getBerkeleyMadonnaString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getBestCandidate() : CGA
• getBiologicalDescriptions() : CMIRIAMInfo
• getBlankNodeID() : CRDFObject , CRDFSubject
• getBlankNodeMap() : CRDFGraph
• getBlue() : CLColorDefinition
• getBMatrixReduced() : CLNAMethod
• getBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getBodyAddr() : CReportDefinition
• getBoundingBox() : CLGraphicalObject , CLLineEnding
• getBuffer() : CExpatTemplate< CType >
• getCalculateStatistics() : COptProblem
• getCalculateValue() : COptProblem
• getCalculateVariableUpdateMethods() : COptProblem
• getCalculationTime() : CMathEvent
• getCallBack() : CCopasiTask
• getCalledTree() : CEvaluationNodeCall
• getCallParameters() : CReaction
• getCCodeString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeNumber , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getCells() : CTableRow
• getCenter() : CLBoundingBox
• getCenterX() : CLRadialGradient
• getCenterY() : CLRadialGradient
• getCenterZ() : CLRadialGradient
• getChange() : CMiaseModel
• getChannels() : CPlotItem
• getCharacterData() : CCopasiXMLParser
• getChemEq() : CReaction
• getChemEqInterface() : CReactionInterface
• getChemEqString() : CChemEqInterface , CReactionInterface
• getChild() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter , CModelParameterGroup
• getChildObjectUnits() : CCompartment , CCopasiContainer , CMetab , CModel , CReaction
• getChildrenCount() : CBitPatternTreeNode
• getChoices() : CNormalLogical
• getCN() : CArrayElementReference , CCopasiObject , CCopasiParameter , CMathContainer , CMathObject , CModelParameter , CObjectInterface , CQEffectDescription , CQReportListItem
• getCollapsedResult() : CSensProblem
• getCollapsedResultAnnotated() : CSensProblem
• getColor() : CColorScale1 , CColorScale , CColorScaleAdvanced , CColorScaleBiLog , CColorScaleSimple , CQPlotColors
• getColorCoding() : CQArrayAnnotationsWidget
• getColorDefinition() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getColorString() : CCellDesignerImporter
• getColSliderPos() : CQBarChart
• getColumn() : CMiaseOutput
• getColumnIndex() : CCompressedColumnFormat::const_row_iterator
• getColumnNames() : CExperiment
• getColumns() : CSparseMatrix
• getColumnStart() : CCompressedColumnFormat
• getColumnValidValueCount() : CExperiment
• getComment() : CReportDefinition
• getCompareResult() : CModelParameter
• getCompartment() : CChemEqInterface , CMetab
• getCompartmentCN() : CModelParameterSpecies
• getCompartmentNumber() : CChemEq , CReaction
• getCompartments() : CChemEq , CModel
• getConcentration() : CMetab
• getConcentrationData() : CTimeSeries
• getConcentrationRate() : CMetab
• getConcentrationRateReference() : CMetab
• getConcentrationRateUnitsDisplayString() : CModel
• getConcentrationReference() : CMetab
• getConcentrationUnitsDisplayString() : CModel
• getCondition() : CNormalChoice , CNormalChoiceLogical
• getConfigDir() : COptions
• getConfigFile() : COptions
• getConfiguration() : CConfigurationFile::CXML , CCopasiRootContainer
• getConstant() : CNodeK
• getConstraintList() : COptProblem
• getConstraintViolation() : CFitConstraint , CFitItem , COptItem
• getContinueFromCurrentState() : CScanProblem
• getContinueSimultaneousEvents() : CProcessQueue , CTrajectoryProblem
• getControlWidget() : CQLayoutMainWindow
• getConvergenceOutTolerance() : CCrossSectionProblem
• getConvergenceTolerance() : CCrossSectionProblem
• getCopasi2SBMLMap() : CCopasiDataModel
• getCOPASI2SBMLMap() : CSBMLExporter
• getCopasiColorStr() : CPlotColors
• getCopasiDir() : COptions
• getCOPASIkey() : SBMLReference
• getCopasiSliderForCSlider() : SliderDialog
• getCopyright() : Copasi2SBMLTranslator
• getCorrelations() : CFitProblem
• getCorrespondingTransientObject() : CModel
• getCovarianceMatrix() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixReduced() : CLNAMethod
• getCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getCreatedDT() : CMIRIAMInfo
• getCreateParameterSets() : CFitProblem
• getCreators() : CMIRIAMInfo
• getCrossingsLimit() : CCrossSectionProblem
• getCrossSectionWidget() : ListViews
• getCrossValidation() : CFitItem
• getCrossValidationCount() : CFitItem
• getCrossValidationRMS() : CFitProblem
• getCrossValidations() : CFitItem
• getCrossValidationSD() : CFitProblem
• getCrossValidationSet() : CFitProblem
• getCrossValidationSolutionValue() : CFitProblem
• getCSlider() : CopasiSlider
• getCSliderForCopasiSlider() : SliderDialog
• getCSlidersForCurrentFolderId() : SliderDialog
• getCSlidersForObject() : SliderDialog
• getCurrentByteCount() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentByteIndex() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentColumnNumber() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentGroup() : CCopasiXMLParser
• getCurrentHeight() : CQGLLayoutPainter
• getCurrentIndex() : CQPlotSubwidget
• getCurrentItemId() : ListViews
• getCurrentLayout() : CQLayoutScene
• getCurrentLineNumber() : CExpatTemplate< CType >
• getCurrentObjectList() : SensWidgetComboBox
• getCurrentPositionX() : CQGLLayoutPainter , CQGLNetworkPainter
• getCurrentPositionY() : CQGLLayoutPainter , CQGLNetworkPainter
• getCurrentRenderInfo() : CQLayoutScene
• getCurrentSBMLDocument() : CCopasiDataModel
• getCurrentStep() : CQGLNetworkPainter , CQLayoutMainWindow , CTSSAMethod
• getCurrentWallTime() : CCopasiTimeVariable
• getCurrentWidget() : ListViews
• getCurrentWidth() : CQGLLayoutPainter
• getCurve() : CLGlyphWithCurve
• getCurveBoundingBox() : CLLayoutRenderer
• getCurveElement() : CLRenderCurve
• getCurveSegments() : CLCurve
• getCX() : CLEllipse
• getCY() : CLEllipse
• getCZ() : CLEllipse
• getDashArray() : CLGraphicalPrimitive1D
• getData() : CCopasiNode< _Data > , CCopasiTree< _Node > , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeObject , CTimeSeries
• getDataModel() : CopasiUI3Window , CopasiWidget , CQLayoutView , ListViews
• getDatamodelList() : CCopasiRootContainer
• getDataObject() : CCopasiDataModel , CMathObject
• getDataPointCount() : CExperimentSet
• getDataResources() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataSetAt() : CQGLNetworkPainter
• getDataType() : CRDFLiteral
• getDataTypeDef() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypePattern() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypesId() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypesName() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypeSynonyms() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypeURI() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDataTypeURIs() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getDate() : CModification
• getDays() : CCopasiTimeVariable
• getDebugString() : CDimension
• getDefaultAtol() : CHybridMethodLSODA , CHybridMethodODE45
• getDefaultMode() : CArrayAnnotation
• getDefaultPlotIndex() : COutputAssistant
• getDefaultReportIndex() : COutputAssistant
• getDefaults() : CReadConfig
• getDefaultScale() : CExperiment , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap
• getDelayAssignment() : CEvent
• getDelayExpression() : CEvent
• getDelayExpressionPtr() : CEvent
• getDeletedObjects() : CCompartment , CEvaluationTree , CMetab , CModelEntity , CReaction
• getDeletedParameters() : CReactionInterface
• getDenominator() : CNormalFraction , CNormalProduct
• getDependentData() : CExperiment , CExperimentSet
• getDependentErrorMean() : CExperimentSet
• getDependentErrorMeanSD() : CExperimentSet
• getDependentNumber() : CMoiety
• getDependentNumberReference() : CMoiety
• getDependentObjectiveValues() : CExperimentSet
• getDependentObjects() : CExperiment , CExperimentSet
• getDependentRMS() : CExperimentSet
• getDependents() : CDependencyGraph , CDependencyGraphNode , CMathDependencyNode
• getDependsOn() : CHybridMethod , CHybridMethodLSODA , CHybridMethodODE45 , CStochMethod
• getDepth() : CLDimensions
• getDescendantsWithPredicate() : CRDFNode
• getDescription() : CArrayAnnotation , CCopasiTask , CMoiety , Copasi2SBMLTranslator , CReference
• getDetails() : SBMLIncompatibility
• getDimensionality() : CCompartment
• getDimensionDescription() : CArrayAnnotation
• getDimensions() : CFindDimensions , CLayout , CLBoundingBox , CLGraphicalObject
• getDirectDependencies() : CConcentrationReference , CCopasiObject , CParticleReference
• getDisplayExpressionString() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• getDisplayFunctionString() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterXPPAUT
• getDisplayName() : CMetabNameInterface , CMIRIAMResourceObject , CRDFPredicate
• getDisplayRole() : CQBrowserPaneDM::CNode
• getDisplayString() : CDimension , CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CExpression , CSBMLunit , CSBMLunitInformation
• getDOTNodeId() : CMathDependencyGraph
• getDuplicateKey() : CModelExpansion::ElementsMap
• getDuplicatePtr() : CModelExpansion::ElementsMap
• getDuration() : CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getEigenValues() : CSteadyStateTask
• getEigenValuesReduced() : CSteadyStateTask
• getEigenValueStatus() : CLNAMethod
• getElapsedTime() : CCopasiTimer
• getElapsedTimeSeconds() : CCopasiTimer
• getElement() : CLGroup , CLPolygon
• getElementIndex() : CCopasiObjectName
• getElementName() : CCopasiObjectName
• getEmail() : CCreator
• getEnd() : CLLineSegment
• getEndColor() : CQEffectDescription
• getEndHead() : CLGroup , CLRenderCurve
• getEndOfLine() : CArrow
• getEndValue() : CProcessReportItem
• getEntities() : CStateTemplate
• getEntityType() : CMathContainer , CMathObject
• getEntries() : CQCopasiAnimation
• getEnvironmentVariable() : COptions
• getEquation() : CMoiety
• getErrorCode() : CExpatTemplate< CType >
• getErrorMean() : CExperiment
• getErrorMeanSD() : CExperiment
• getErrorPosition() : CEvaluationParserBase , CEvaluationTree
• getErrorString() : CExpatTemplate< CType >
• getErrorSum() : CExperiment
• getEvent() : CProcessQueue::CAction
• getEvents() : CModel
• getEventTargets() : CObjectLists
• getExecutionTime() : COptProblem , CProcessQueue::CKey
• getExp() : CNormalItemPower
• getExpandedMetabList() : CReactionInterface
• getExpatVersion() : CExpatTemplate< CType >
• getExperiementSet() : CFitProblem
• getExperiment() : CExperimentFileInfo , CExperimentSet , CFitItem
• getExperimentCount() : CExperimentSet , CFitItem
• getExperimentNames() : CExperimentFileInfo
• getExperiments() : CFitItem
• getExperimentType() : CExperiment , CExperimentSet
• getExplicitFunctionString() : CNodeK
• getExponentNumber() : CLyapProblem
• getExpression() : CEventAssignment , CModelEntity , CMoiety , CQExpressionWidget , CQValidatorExpression
• getExpressionPtr() : CEventAssignment , CMathObject , CModelEntity
• getExpressions() : CSBMLunitInterface
• getExpressionTree() : CReaction
• getFactor() : CNormalProduct
• getFalseExpression() : CNormalChoice , CNormalChoiceLogical
• getFamilyList() : CQFontRenderer
• getFamilyName() : CCreator
• getFastParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getFastReactionPointerAnn() : CCSPMethod
• getFastReactionPointerNormedAnn() : CCSPMethod
• getFieldCopasiObject() : ObjectBrowserWidget
• getFieldValue() : CRDFNode
• getFileExtension() : Copasi2SBMLTranslator
• getFilename() : Arguments
• getFileName() : CCopasiDataModel , CExperiment , CExperimentFileInfo
• getFilename() : CFunctionDB
• getFileNames() : CExperimentSet
• getFileType() : Arguments , Copasi2SBMLTranslator
• getFillColor() : CLGraphicalPrimitive2D
• getFillRule() : CLGraphicalPrimitive2D
• getFireAtInitialTime() : CEvent
• getFirstMessage() : CCopasiMessage
• getFirstRow() : CExperiment
• getFirstScheduledTask() : Arguments
• getFirstUnconvertedRow() : CStepMatrix
• getFirstUnusedSection() : CExperimentFileInfo
• getFisherInformation() : CFitProblem
• getFisherInformationEigenvalues() : CFitProblem
• getFisherInformationEigenvectors() : CFitProblem
• getFittingPoints() : CExperiment
• getFittingWidget() : ListViews
• getFlagLimitConvergence() : CCrossSectionProblem
• getFlagLimitCrossings() : CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutConvergence() : CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutCrossings() : CCrossSectionProblem
• getFlagLimitOutTime() : CCrossSectionProblem
• getFlux() : CReaction
• getFluxMode() : CTableauLine
• getFluxModeDescription() : CEFMTask
• getFluxModes() : CEFMProblem , CEFMTask
• getFluxObject() : CMathReaction
• getFluxReference() : CReaction
• getFocalPointX() : CLRadialGradient
• getFocalPointY() : CLRadialGradient
• getFocalPointZ() : CLRadialGradient
• getFogColor() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getFogDensity() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getFont() : CQFontRenderer
• getFontFamily() : CLGroup , CLText
• getFontSize() : CLGroup , CLText , CQGLNetworkPainter , CQLayoutMainWindow
• getFontSpec() : CLLayoutRenderer
• getFontStyle() : CLGroup , CLText
• getFontWeight() : CLGroup , CLText
• getFooterAddr() : CReportDefinition
• getForwardAction() : CQPlayerControlWidget
• getFraction() : CNormalFunction
• getFractions() : CNormalCall , CNormalSum
• getFrameOption() : CQScreenshotOptionsDialog
• getFrameSet() : CQScreenshotOptionsDialog
• getFrequencyUnitsDisplayString() : CModel
• getFromHistory() : CQTaskMethodWidget
• getFunction() : CQExpressionWidget , CQValidatorFunction , CReaction , CReactionInterface
• getFunctionDefinitionForName() : SBMLImporter
• getFunctionDescription() : CReactionInterface
• getFunctionEvaluations() : COptProblem
• getFunctionList() : CCopasiRootContainer , CCopasiXML
• getFunctionName() : CReactionInterface
• getFunctionParameters() : CFunctionParameterMap , CReaction
• getGeneration() : CGA
• getGivenName() : CCreator
• getGlobalQuantityCN() : CModelParameterReactionParameter
• getGradientBase() : CLRenderResolver
• getGradientDefinition() : CLRenderInformationBase
• getGradientStop() : CLGradientBase
• getGraphicalObject() : CLTextGlyph
• getGraphicalObjectKey() : CLTextGlyph
• getGraphMax() : CQGLNetworkPainter
• getGraphMin() : CQGLNetworkPainter
• getGreen() : CLColorDefinition
• getGroup() : CCopasiParameterGroup , CLLineEnding , CLStyle
• getGUI() : CCopasiDataModel , CCopasiXML
• getHeaderAddr() : CReportDefinition
• getHeaderRow() : CExperiment
• getHeight() : CLDimensions , CLGraphicalObject , CLImage , CLRectangle , CQScreenshotOptionsDialog
• getHierarchy() : CEigen
• getHighestSeverity() : CCopasiMessage
• getHighlightColor() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getHighlightedObjects() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getHighlightFlag() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter
• getHome() : COptions
• getHours() : CCopasiTimeVariable
• getI() : CEigen
• getId() : CBiologicalDescription , CLColorDefinition , CLGradientBase , CLLineEnding , CMiaseBaseEnhanced , CMiaseColumn , CMiasePlot2D , CMIRIAMResourceObject , CQBrowserPaneDM::CNode , CRDFNode , CReference , SBMLUtils
• getIdentifier() : CSBMLunitInterface
• getIdentifiersOrgURL() : CMIRIAMResource , CMIRIAMResourceObject
• getIdentityMatrix() : CLTransformation
• getIdentityMatrix2D() : CLTransformation2D
• getIdFromIndex() : CQBrowserPaneDM
• getIdFromSBase() : SBMLUtils
• getIdsFromNode() : SBMLImporter
• getIgnoreUpdates() : CopasiWidget
• getImage() : CQGLNetworkPainter
• getImageHeight() : CQScreenshotOptionsDialog
• getImageReference() : CLImage
• getImageWidth() : CQScreenshotOptionsDialog
• getImportanceIndexAnn() : CCSPMethod
• getImportanceIndexNormedRowAnn() : CCSPMethod
• getImportCOPASIMIRIAM() : SBMLImporter
• getImportHandlerAddr() : SBMLImporter , SEDMLImporter
• getIncomingTriplets() : CRDFGraph
• getIncrement() : C2DPlotCurve
• getIndependentData() : CExperiment , CExperimentSet
• getIndependentObjects() : CExperiment
• getIndex() : CCopasiParameterGroup , CCopasiVector< T > , CCopasiVectorN< CType > , CEvaluationNodeVariable , CMetabOld , CModelParameter , CNodeK , CStateTemplate , CUpDownSubwidget , QTimeCourseAnimation
• getIndexForTask() : Worker
• getIndexForWidget() : Worker
• getInfix() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CEvaluationTree
• getInfo() : CSBMLunitInformation
• getInitArgs() : Arguments
• getInitialConcentration() : CMetab
• getInitialConcentrationReference() : CMetab
• getInitialExpression() : CModelEntity , CModelParameter
• getInitialExpressionPtr() : CModelEntity , CModelParameter
• getInitialState() : CMathContainer , CModel
• getInitialTime() : CMathModel , CMiaseUniformTimeCourse , CModel
• getInitialUpdateSequence() : CModel
• getInitialValue() : CModelEntity
• getInitialValuePointer() : CMathContainer
• getInitialValueReference() : CModelEntity , CMoiety
• getInitialValues() : CAbstractLayoutInterface , CCopasiSpringLayout
• getInputContext() : CExpatTemplate< CType >
• getInterfaces() : COutputHandler
• getInternalSpecies() : CEFMTask
• getInterpolationState() : CInterpolation
• getIsEnabledRotationalMapping() : CLLineEnding
• getItem() : CNormalItemPower , COutputAssistant
• getItemFor() : CQLayoutScene
• getItemName() : COutputAssistant
• getItemPowers() : CNormalLcm , CNormalProduct
• getItems() : CPlotSpecification , CQComboDelegate
• getItemToType() : CQCompartmentDM , CQGlobalQuantityDM , CQSpecieDM
• getItemType() : CNormalItemPower
• getJacobian() : CSteadyStateTask
• getJacobianAnnotated() : CSteadyStateTask
• getJacobianReduced() : CSteadyStateTask
• getJacobianXAnnotated() : CSteadyStateTask
• getJavaLibraryVersion() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getKey() : CAnnotation , CBiologicalDescription , CCopasiObject , CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CCopasiTask , CCreator , CEvent , CEventAssignment , CFunction , CFunctionParameter , CIndexedPriorityQueue , CLayout , CLColorDefinition , CLEllipse , CLGradientBase , CLGradientStop , CLGraphicalObject , CLGroup , CLImage , CListOfLayouts , CLLineEnding , CLPolygon , CLRectangle , CLRenderCurve , CLRenderInformationBase , CLStyle , CLText , CMIRIAMInfo , CModel , CModelEntity , CModelParameterSet , CModification , CMoiety , COutputDefinitionVector , CQBrowserPaneDM::CNode , CQModelElementTreeWidgetItem , CQSideCompoundWizardPage::CQListWidgetModelItem , CReaction , CReference , CReportDefinition , CReportDefinitionVector , CSlider , CTimeSeries
• getKeyFactory() : CCopasiRootContainer
• getKeyForRow() : CQCurrentValueTable
• getKeyFromIndex() : CQBrowserPaneDM
• getKeyList() : CLLocalStyle
• getKeySpace() : ObjectBrowserItem
• getL() : CModel
• getL0() : CModel
• getLabelText() : CGraphNode
• getLabelWindowWidth() : CQGLNetworkPainter
• getLanguage() : CRDFLiteral
• getLargestCompartment() : CChemEq , CReaction
• getLastChange() : CMiaseModel
• getLastColumn() : CExperimentObjectMap , CMiaseOutput
• getLastFilledCell() : CTableRow
• getLastMeasurement() : CMiaseTask
• getLastMessage() : CCopasiMessage
• getLastModel() : CMiaseSed
• getLastNotIgnoredColumn() : CExperimentObjectMap
• getLastObj() : CMiaseParser
• getLastOutput() : CMiaseSed
• getLastPlot2D() : CMiaseOutput
• getLastRow() : CExperiment
• getLastSimulation() : CMiaseSed
• getLastStartValue() : COptItem
• getLastTask() : CMiaseSed
• getLayout() : CCellDesignerImporter
• getLayoutInterface() : CLayoutEngine
• getLayoutList() : CCopasiXML , CCopasiXMLParser
• getLayoutParameters() : CQSpringLayoutParameterWindow
• getLeft() : CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeOperator , CNodeK , CNormalGeneralPower , CNormalLogicalItem
• getLengthUnitEnum() : CModel
• getLengthUnitName() : CModel
• getLengthUnitsDisplayString() : CModel
• getLexicalData() : CRDFLiteral
• getLicenseHTML() : CCopasiRootContainer
• getLicenseTxt() : CCopasiRootContainer
• getLine() : CArrow
• getLineEnding() : CLRenderInformationBase , CLRenderResolver
• getListOfAllCompartmentNames() : ParameterTable
• getListOfAllGlobalParameterNames() : ParameterTable
• getListOfAllMetabNames() : ParameterTable
• getListOfChildNodes() : CEvaluationNodeCall
• getListOfColorDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getListOfCompartmentGlyphs() : CLayout
• getListOfConflictingNodes() : CSBMLunitInterface
• getListOfConstantRefreshes() : CModel
• getListOfConstObjects() : CObjectLists
• getListOfContainer() : CExpression
• getListOfCurveElements() : CLRenderCurve
• getListOfDefaultOutputDescriptions() : COutputAssistant
• getListOfDisplayNames() : CChemEqInterface
• getListOfElements() : CLGroup , CLPolygon
• getListOfGeneralGlyphs() : CLayout
• getListOfGlobalRenderInformationObjects() : CListOfLayouts
• getListOfGradientDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getListOfGradientStops() : CLGradientBase
• getListOfInitialRefreshes() : CModel
• getListOfLayouts() : CCopasiDataModel
• getListOfLineEndings() : CLRenderInformationBase
• getListOfLocalParametersWithGivenUnitStatus() : CSBMLunitInterface
• getListOfLocalRenderInformationObjects() : CLayout
• getListOfMetaboliteGlyphs() : CLayout
• getListOfMetabReferenceGlyphs() : CLReactionGlyph
• getListOfMetabs() : CReactionInterface
• getListOfMultiplicities() : CChemEqInterface
• getListOfNonSimulatedRefreshes() : CModel
• getListOfObjects() : CObjectLists
• getListOfObjectsWithGivenUnitStatus() : CSBMLunitInterface
• getListOfPoints() : CLCurve
• getListOfPossibleFunctions() : CReactionInterface
• getListOfReactionGlyphs() : CLayout
• getListOfReferenceGlyphs() : CLGeneralGlyph
• getListOfSimulatedRefreshes() : CModel
• getListOfStyles() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation
• getListOfSubglyphs() : CLGeneralGlyph
• getListOfTextGlyphs() : CLayout
• getListType() : CSensItem
• getListTypeDisplayName() : CSensItem
• getLiteral() : CRDFObject
• getLNAWidget() : ListViews
• getLocalResourceNodeMap() : CRDFGraph
• getLocalValue() : CFitItem , CReactionInterface
• getLocation() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getLocations() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getLocations_() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getLowerBound() : COptItem
• getLowerBoundValue() : COptItem
• getMainWidget() : CopasiUI3Window
• getMainWindow() : CopasiUI3Window
• getMap() : CModelExpansion::ElementsMap
• getMappedObjects() : CExperimentObjectMap
• getMappedUnitFromIdentifier() : CSBMLunitInterface
• getMappedUnitFromNumberNode() : CSBMLunitInterface
• getMapping() : CReactionInterface
• getMappingMode() : CQLayoutMainWindow
• getMappings() : CReactionInterface
• getMassVector() : CAbstractLayoutInterface
• getMathML() : Expression2PresentationMMLUnits
• getMathModel() : CModel
• getMathObject() : CMathContainer
• getMathTrigger() : CMathEvent
• getMatrix() : CLTransformation
• getMatrix2D() : CLTransformation2D
• getMax() : QTimeCourseAnimation
• getMaxForSpecies() : CSimSummaryInfo
• getMaximagpart() : CEigen
• getMaxNodeSize() : CQLayoutMainWindow
• getMaxOverallConcentration() : CSimSummaryInfo
• getMaxrealpart() : CEigen
• getMaxValue() : CSlider
• getMCAWidget() : ListViews
• getMeasurement() : CMiaseTask
• getMessage() : CCopasiException , SBMLIncompatibility
• getMessageAboutUnknownUnits() : CSBMLunitInterface
• getMetabGlyph() : CLMetabReferenceGlyph
• getMetabGlyphKey() : CLMetabReferenceGlyph
• getMetabolite() : CChemEqElement , CMetabNameInterface
• getMetaboliteKey() : CChemEqElement , CMetabNameInterface
• getMetabolites() : CCompartment , CModel
• getMetabolitesX() : CModel
• getMetaId() : CMiaseBase
• getMethod() : CCopasiTask
• getMethodLog() : CSteadyStateMethod
• getMicroSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getMilliSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getMinForSpecies() : CSimSummaryInfo
• getMinNodeSize() : CQLayoutMainWindow
• getMinOverallConcentration() : CSimSummaryInfo
• getMinutes() : CCopasiTimeVariable
• getMinValue() : CSlider
• getMiriamAnnotation() : CAnnotation
• getMIRIAMCitation() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMDeprecated() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMDisplayName() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMInfo() : CQMiriamWidget
• getMIRIAMLastUpdateDate() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMMIRIAMResource() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMPattern() : CMIRIAMResource
• getMIRIAMResource() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMResourceIndex() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMResourceObject() : CBiologicalDescription , CReference
• getMIRIAMResources() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMUpdateFrequency() : CMIRIAMResources
• getMIRIAMURI() : CMIRIAMResource
• getMiriamURI() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getMMLName() : CMathMl
• getMMLString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeNumber , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVariable
• getMode() : CArrayAnnotation , CQEffectDescription
• getModel() : CCopasiDataModel , CCopasiProblem , CCopasiXML , CCopasiXMLParser , CLNAMethod , CMathContainer , CMCAMethod , CMetab , CMiaseSed , CModelParameter , CModelParameterSet , CSBMLunitInterface
• getModelObject() : CLGraphicalObject
• getModelObjectCN() : CFittingPoint
• getModelObjectDisplayName() : CLGraphicalObject
• getModelObjectKey() : CLGraphicalObject
• getModelObjectName() : CLGraphicalObject
• getModelParameter() : CModelParameterGroup
• getModelParameterSet() : CModel
• getModelParameterSets() : CModel
• getModelReaction() : CMathReaction
• getModelReference() : CMiaseTask
• getModelType() : CModel
• getModelValues() : CModel
• getModifications() : CMIRIAMInfo
• getModifiedSpecies() : CMathReaction
• getModifierCompartments() : CChemEqParserBase
• getModifierMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getModifierNames() : CChemEqParserBase
• getModifiers() : CChemEq
• getModulus() : CRandom
• getMoieties() : CModel
• getMoiety() : CMetab
• getMolecularity() : CChemEq , CChemEqInterface
• getMultiplicity() : CChemEqElement
• getMultiplier() : CFluxMode , CStepMatrixColumn , CTableauLine
• getName() : CCopasiParameterGroup , CCopasiXMLParser::UnsupportedAnnotationElement , CExperimentObjectMap , CLRenderInformationBase , CMiaseBaseEnhanced , CMiaseColumn , CMiaseMeasurementData , CMiasePlot2D , CModelParameter , CModelParameterSet , CModelParameterSpecies , CNodeK , CNormalCall , CNormalItem , Copasi2SBMLTranslator , CTableCell , CXMLAttributeList , MiriamWebServicesSoapBindingProxy , UnsupportedAnnotationElement
• getNameForNodeKey() : CQGLNetworkPainter
• getNames() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getNameSpaceMap() : CRDFGraph
• getNameSpaceQualifier() : CRDFUtilities
• getNcplxconj() : CEigen
• getNetReaction() : CEFMTask
• getNetReactionData() : CEFMTask
• getNewMath() : CMiaseChangeMath
• getNewValue() : CMiaseChangeAttribute
• getNext() : CCopasiNode< _Data >
• getNextId() : SEDMLUtils
• getNextNonChild() : CCopasiNode< _Data >
• getNextUnusedSection() : CExperimentFileInfo
• getNimag() : CEigen
• getNnegreal() : CEigen
• getNode() : CMIRIAMResourceObject
• getNodeList() : CEvaluationParserBase , CEvaluationTree
• getNodeNameEntry() : CQGLNetworkPainter
• getNodeObject() : CExpression
• getNodes() : CKinFunction
• getNonOptions() : COptions
• getNormalizeWeightsPerExperiment() : CExperiment
• getNotes() : CAnnotation , CMiaseBase , CMiaseNotes
• getNposreal() : CEigen
• getNreal() : CEigen
• getNumAssignmentMetabs() : CModel
• getNumber() : CCopasiMessage , CMoiety
• getNumber2QuantityFactor() : CModel
• getNumberOfBits() : CZeroSet
• getNumberOfElements() : CDataEntity
• getNumberOfMeasurements() : CMiaseTask
• getNumberOfNodeEntries() : CQGLNetworkPainter
• getNumberOfParametersByUsage() : CFunctionParameters
• getNumberOfPoints() : CMiaseUniformTimeCourse
• getNumberOfReactants() : CSimSummaryInfo
• getNumberOfScanItems() : CScanProblem
• getNumberOfSetBits() : CZeroSet
• getNumberOfSteps() : CQGLNetworkPainter , CSimSummaryInfo
• getNumberOfSubtaskCalculations() : CSensMethod
• getNumberOfUnsetBits() : CZeroSet
• getNumberOfVariables() : CSensProblem
• getNumChannels() : CPlotItem
• getNumChildren() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter , CModelParameterGroup
• getNumColorDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getNumColumns() : CExperiment
• getNumCopasiColors() : CPlotColors
• getNumCurveSegments() : CLCurve
• getNumDataRows() : CExperiment
• getNumDependent() : CLinkMatrix , CState , CStateTemplate
• getNumDependentReactionMetabs() : CModel
• getNumElements() : CLGroup , CLPolygon , CLRenderCurve
• getNumerator() : CNormalFraction
• getNumFixed() : CState , CStateTemplate
• getNumGradientDefinitions() : CLRenderInformationBase
• getNumGradientStops() : CLGradientBase
• getNumIndependent() : CLinkMatrix , CState , CStateTemplate
• getNumIndependentReactionMetabs() : CModel
• getNumKeys() : CLLocalStyle
• getNumLineEndings() : CLRenderInformationBase
• getNumMetabs() : CModel
• getNumModelValues() : CModel
• getNumODEMetabs() : CModel
• getNumOfChanges() : CMiaseModel
• getNumOfModels() : CMiaseSed
• getNumOfOutputs() : CMiaseSed
• getNumOfSimulations() : CMiaseSed
• getNumOfTasks() : CMiaseSed
• getNumRoles() : CLStyle
• getNumRoots() : CMathModel , CModel
• getNumSteps() : CQCopasiAnimation , CScanItem
• getNumStyles() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation
• getNumTypes() : CLStyle
• getNumUnconvertedRows() : CStepMatrix
• getNumVariable() : CState , CStateTemplate
• getNumVariableMetabs() : CModel
• getNumVariables() : CAbstractLayoutInterface , CTimeSeries
• getNzero() : CEigen
• getObject() : CArrayAnnotation , CCopasiContainer , CCopasiMatrixReference< CType > , CCopasiObject , CCopasiParameterGroup , CCopasiVector< T > , CCopasiVectorN< CType > , CCopasiVectorReference< CType > , CMathContainer , CMathDependencyNode , CMathObject , CModelParameter , CObjectInterface , COptItem , CQModelElementTreeWidgetItem , CQSideCompoundWizardPage::CQListWidgetModelItem , CRDFNode , CReaction , CScanItem , ObjectBrowserItem , Refresh , RefreshTemplate< CClass >
• getObjectAncestor() : CCopasiObject
• getObjectCN() : CEvaluationNodeObject , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , COptItem
• getObjectDataFromRefresh() : CDotOutput
• getObjectDataModel() : CCopasiObject
• getObjectDisplayName() : CArrayAnnotation , CArrayElementReference , CCopasiObject , CCopasiObjectReference< CType > , CCopasiParameter , CCopasiReportSeparator , CCopasiStaticString , CEvent , CFittingPoint , CMetab , COptItem , CReaction
• getObjectForSbmlId() : SEDMLUtils
• getObjectFromName() : CCopasiXMLParser
• getObjectInterfacePtr() : CEvaluationNodeObject
• getObjectiveFunction() : COptProblem
• getObjectiveValue() : CExperiment
• getObjectKey() : CCompartmentGraphNode , CGraphNode
• getObjectMap() : CExperiment
• getObjectName() : CCopasiObject , CCopasiObjectName
• getObjectNameVector() : CReportTable
• getObjectParent() : CCopasiObject
• getObjectRole() : CLGraphicalObject
• getObjects() : CCopasiContainer , CFunctionParameterMap , COutputInterface , PlotWindow
• getObjectsAt() : CLLayoutRenderer
• getObjectsAtViewportPosition() : CLLayoutRenderer
• getObjectsInBoundingBox() : CLLayoutRenderer
• getObjectSingle() : CCopasiSelectionDialog
• getObjectType() : CCopasiObject , CCopasiObjectName
• getObjectValue() : CFitItem , COptItem
• getObjectValuePtr() : CEvaluationNodeObject
• getObjectVector() : CCopasiSelectionDialog
• getOfficialDataTypeURI() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getOffset() : CLGradientStop
• getOpenFileName() : CopasiFileDialog
• getOptimizationWidget() : ListViews
• getOptItem() : COptProblem
• getOptItemList() : COptProblem
• getOptItemSize() : COptProblem
• getOrder() : CMathEvent
• getORG() : CCreator
• getOrigHeight() : CLabel
• getOriginalValue() : CSlider
• getOrigNodeKey() : CCompartmentGraphNode , CGraphNode
• getOrigValueForSpecies() : CDataEntity
• getOrigWidth() : CLabel
• getOutCrossingsLimit() : CCrossSectionProblem
• getOutput() : CMiaseSed
• getOutputDir() : Arguments
• getOutputEndTime() : CMiaseUniformTimeCourse
• getOutputEvent() : CTrajectoryProblem
• getOutputHandler() : CCopasiTask
• getOutputInSubtask() : CScanProblem
• getOutputMode() : CCopasiTask
• getOutputStartTime() : CMiaseUniformTimeCourse , CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getOutputToGenerate() : Arguments
• getPainter() : CQGLLayoutViewer , CQGLViewport
• getParameter() : CCopasiParameterGroup
• getParameterByUsage() : CFunctionParameters
• getParameterIndex() : CReaction
• getParameterMapping() : CReaction
• getParameterMappings() : CReaction
• getParameterName() : CReactionInterface
• getParameters() : CReaction
• getParameterValue() : CReaction
• getParameterWindow() : CQLayoutThread
• getParamNum() : CGA
• getParent() : CCopasiNode< _Data > , CModelParameter
• getParentSubjects() : CRDFGraph
• getParticipatesIn() : CHybridMethod , CHybridMethodLSODA
• getParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getParticipationIndexNormedColumnAnn() : CCSPMethod
• getParticipationIndexNormedRowAnn() : CCSPMethod
• getParticleFlux() : CModel , CReaction
• getParticleFluxObject() : CMathReaction
• getParticleFluxReference() : CReaction
• getPath() : CQConnectionGraphicsItem , CRDFNode
• getPauseAction() : CQPlayerControlWidget
• getPersistentTrigger() : CEvent
• getPlayAction() : CQPlayerControlWidget
• getPlot() : PlotWindow
• getPlot2D() : CMiaseOutput
• getPlotDefinitionList() : CCopasiDataModel , DataModelGUI
• getPlotList() : CCopasiXML , CCopasiXMLParser
• getPoint() : CArrow
• getPointers() : CFunctionParameterMap
• getPointNearCircle() : CQGLNetworkPainter
• getPointOnCircle() : CQGLNetworkPainter
• getPointOnRectangle() : CGraphNode , CQGLNetworkPainter
• getPopSize() : CGA
• getPosition() : CLBoundingBox , CLGraphicalObject
• getPositionPoint() : CCellDesignerImporter
• getPossibleTargetFunctions() : CSensProblem
• getPossibleVariables() : CSensProblem
• getPotential() : CAbstractLayoutInterface , CCopasiSpringLayout
• getPrecision() : CReportDefinition
• getPredicate() : CBiologicalDescription
• getPredicateFromDisplayName() : CRDFPredicate
• getPredicateFromURI() : CRDFPredicate
• getPredicatePath() : CRDFGraph
• getPrerequisites() : CCopasiObject , CMathDependencyNode , CMathExpression , CMathObject , CObjectInterface , CParticleReference
• getPrimary() : CCopasiObjectName
• getPriorityExpression() : CEvent
• getPriorityExpressionPtr() : CEvent
• getProblem() : CCopasiTask
• getProcessingModes() : CMathDependencyNodeIterator , CNodeContextIterator< Node, Context >
• getProcessQueue() : CMathModel
• getProcessQueueExecutionTime() : CMathModel , CModel , CProcessQueue
• getProcessTime() : CCopasiTimeVariable
• getProductCompartments() : CChemEqParserBase
• getProductMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getProductNames() : CChemEqParserBase
• getProducts() : CChemEq , CNormalSum
• getPropensityObject() : CMathReaction
• getPropensityReference() : CReaction
• getptc_() : CTruncatedNewton
• getPWD() : COptions
• getQuantity2NumberFactor() : CModel
• getQuantityRateUnitsDisplayString() : CModel
• getQuantityUnitEnum() : CModel
• getQuantityUnitName() : CModel
• getQuantityUnitOldXMLName() : CModel
• getQuantityUnitsDisplayString() : CModel
• getR() : CEigen
• getRadicalPointerAnn() : CCSPMethod
• getRadius() : CLRadialGradient
• getRadiusX() : CLRectangle
• getRadiusY() : CLRectangle
• getRandomCC() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomCO() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomExp() : CRandom
• getRandomGamma() : CRandom
• getRandomizeStartValues() : COptProblem
• getRandomNormal() : CRandom
• getRandomNormal01() : CRandom
• getRandomNormalLog() : CRandom
• getRandomNormalPositive() : CRandom
• getRandomOO() : Cmt19937 , Cmt19937HR , Cr250 , CRandom
• getRandomPoisson() : CRandom
• getRandomS() : Cmt19937 , Cr250 , CRandom
• getRandomStdGamma() : CRandom
• getRandomU() : Cmt19937 , Cr250 , CRandom
• getRandomValue() : COptItem
• getRate() : CModelEntity
• getRateReference() : CModelEntity
• getRDFGraph() : CMIRIAMInfo
• getReacSlowSpacePrintAnn() : CILDMMethod
• getReaction() : CModelParameterReactionParameter , CStepMatrixColumn
• getReactionEquation() : CEFMTask
• getReactionIndex4Hybrid() : CHybridMethodODE45
• getReactions() : CModel
• getRecentFiles() : CConfigurationFile
• getRecentMIRIAMResources() : CConfigurationFile
• getRecentSBMLFiles() : CConfigurationFile
• getRecentSEDMLFiles() : CConfigurationFile
• getRecordedSteps() : CTimeSeries
• getRed() : CLColorDefinition
• getRedStoi() : CModel
• getReferenceDirectory() : CCopasiDataModel
• getReferenceRenderInformationKey() : CLRenderInformationBase
• getReferences() : CMIRIAMInfo
• getRefresh() : CCopasiObject
• getRelativeValue() : CLRelAbsVector
• getRemainder() : CCopasiObjectName
• getRemoteResourceNodes() : CRDFGraph
• getRenderInformation() : CLayout , CListOfLayouts
• getReorderedReactions() : CEFMProblem
• getReport() : CCopasiTask
• getReportDefinition() : CReport
• getReportDefinitionList() : CCopasiDataModel
• getReportFile() : Arguments
• getReportList() : CCopasiXML , CCopasiXMLParser
• getResiduals() : CFitProblem
• getResolver() : CQCopasiGraphicsItem , CQLayoutScene
• getResource() : CBiologicalDescription , CMIRIAMResourceObject , CRDFObject , CRDFSubject , CReference
• getResourceIndexFromDisplayName() : CMIRIAMResources
• getResourceInfo() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getResourceInstitution() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getResourceList() : CMIRIAMResourceObject , CMIRIAMResources
• getResourceLocation() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getResult() : CCopasiTask , CFunctionAnalyzer , CSensProblem , CSteadyStateTask
• getResultAnnotated() : CSensProblem
• getReversibility() : CChemEq , CChemEqInterface
• getRight() : CEvaluationNodeOperator , CNodeK , CNormalGeneralPower , CNormalLogicalItem
• getRMS() : CExperiment , CFitProblem
• getRole() : CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , CGraphCurve , CLMetabReferenceGlyph , CLReferenceGlyph
• getRoleDisplayName() : CLMetabReferenceGlyph
• getRoleList() : CLStyle
• getRoot() : CBitPatternTree , CCopasiRootContainer , CCopasiTree< _Node > , CEvaluationTree , ObjectList
• getRootFinders() : CMathModel , CMathTrigger , CModel
• getRootNode() : CEvaluationParserBase
• getRoots() : CMathEventN::CTrigger , CTrajectoryMethod
• getRootValuePtr() : CMathTrigger::CRootFinder
• getRow() : CQBrowserPaneDM::CNode , CQParameterOverviewDM , CQPlotSubwidget
• getRowIndex() : CCompressedColumnFormat
• getRowPivots() : CLinkMatrix
• getRows() : CSparseMatrix
• getRowSliderPos() : CQBarChart
• getRX() : CLEllipse
• getRY() : CLEllipse
• getSaveFileName() : CopasiFileDialog , CQSBMLFileDialog , CQSEDMLFileDialog
• getSBMLBoundingBox() : CLBoundingBox
• getSBMLDimensions() : CLDimensions
• getSBMLDocument() : CCellDesignerImporter , CSBMLExporter
• getSBMLFileName() : CCopasiDataModel
• getSBMLId() : CEvent , CFunction , CModelEntity , CReaction , CTimeSeries
• getSBMLid() : SBMLReference
• getSBMLPoint() : CLPoint
• getSBMLUnitDefinition() : CSBMLunit
• getSBMLUnitDefinitionForId() : SBMLImporter
• getScale() : CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap
• getScaledBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getScaledConcentrationCC() : CMCAMethod
• getScaledConcentrationCCAnn() : CMCAMethod
• getScaledCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getScaledCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getScaledElasticities() : CMCAMethod
• getScaledElasticitiesAnn() : CMCAMethod
• getScaledFisherInformation() : CFitProblem
• getScaledFisherInformationEigenvalues() : CFitProblem
• getScaledFisherInformationEigenvectors() : CFitProblem
• getScaledFluxCC() : CMCAMethod
• getScaledFluxCCAnn() : CMCAMethod
• getScaledResult() : CSensProblem
• getScaledResultAnnotated() : CSensProblem
• getScaleEnd() : CQEffectDescription
• getScaleMode() : CQCopasiAnimation
• getScales() : CQCopasiAnimation , QConservedSpeciesAnimation , QFluxModeAnimation , QTimeCourseAnimation
• getScaleStart() : CQEffectDescription
• getScaling() : CSlider
• getScalingMode() : CQLayoutMainWindow
• getScanItem() : CScanProblem
• getScanWidget() : ListViews
• getScore() : CTableauLine
• getSeconds() : CCopasiTimeVariable
• getSed() : CMiaseML
• getSEDMLDocument() : CSEDMLExporter
• getSegmentAt() : CLCurve
• getSelectedCompartments() : CQAutolayoutWizard
• getSelectedMetabolites() : CQAutolayoutWizard
• getSelectedReactions() : CQAutolayoutWizard
• getSelection() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter , CQNameSelectionDialog
• getSelectionBox() : CLLayoutRenderer
• getSeparator() : CExperiment , CReportDefinition , CReportTable , CTableCell
• getServicesInfo() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getServicesVersion() : MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getSet() : CModelParameter , CRegisteredObjectName
• getSetChild() : CBitPatternTreeNode
• getSeverity() : SBMLIncompatibility
• getSibling() : CCopasiNode< _Data >
• getSideCompounds() : CQSideCompoundWizardPage
• getSideMetabolites() : CQAutolayoutWizard
• getSimulation() : CMiaseSed
• getSimulationReference() : CMiaseTask
• getSimulationType() : CMathObject , CModelParameter
• getSingleLineComment() : CODEExporter , CODEExporterC
• getSingleObjectCN() : CCrossSectionProblem , CSensItem
• getSingleObjectDisplayName() : CSensItem
• getSize() : CGraphNode , CNormalCall , CNormalSum
• getSlider() : SliderSettingsDialog
• getSliderList() : SCopasiXMLGUI
• getSliderObject() : CSlider
• getSliderObjectCN() : CSlider
• getSliders() : CCopasiTask
• getSliderType() : CSlider
• getSliderValue() : CSlider
• getSlowParticipationIndexAnn() : CCSPMethod
• getSlowPropensitySum() : CStateRecord
• getSolutionValue() : COptProblem
• getSolutionVariables() : COptProblem
• getSortRole() : CQBrowserPaneDM::CNode
• getSource() : CMiaseMeasurementData , CMiaseModel
• getSpeciesChanges() : CEFMTask
• getSpreadMethod() : CLGradientBase
• getStabilityResolution() : CSteadyStateMethod
• getStart() : CLLineSegment
• getStartColor() : CQEffectDescription
• getStartHead() : CLGroup , CLRenderCurve
• getStartOfLine() : CArrow
• getStartValue() : COptItem
• getState() : CCrossSectionTask , CHybridMethod , CHybridMethodLSODA , CMathContainer , CModel , CSteadyStateTask , CTrajectoryTask , CTSSATask
• getStateReduced() : CMathContainer
• getStateTemplate() : CModel
• getStaticString() : CCopasiStaticString
• getStatistics() : CSBMLunitInterface
• getStatus() : CFunctionAnalyzer::CValue , CModelEntity
• getStdDeviation() : CFitProblem
• getSteadyStateStatus() : CLNAMethod , CMCAMethod
• getSteadyStateWidget() : ListViews
• getStepBackwardAction() : CQPlayerControlWidget
• getStepForwardAction() : CQPlayerControlWidget
• getStepMatrixColumn() : CBitPatternTreeNode
• getStepNumber() : CCrossSectionProblem , CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getStepSize() : CCrossSectionProblem , CTrajectoryProblem , CTSSAProblem
• getStepsPerSecond() : CQLayoutMainWindow
• getStiffness() : CEigen
• getStochTimeAndIndex() : CHybridMethod , CHybridMethodLSODA , CHybridMethodODE45
• getStoi() : CModel
• getStopAction() : CQPlayerControlWidget
• getStopColor() : CLGradientStop
• getStream() : CReport
• getStroke() : CLGraphicalPrimitive1D
• getStrokeWidth() : CLGraphicalPrimitive1D
• getStyle() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation , CQCopasiGraphicsItem
• getSubject() : CRDFNode
• getSubPathIndex() : CRDFPredicate
• getSubstrateCompartments() : CChemEqParserBase
• getSubstrateMulitplicities() : CChemEqParserBase
• getSubstrateNames() : CChemEqParserBase
• getSubstrates() : CChemEq
• getSubTask() : CLNAProblem , CMCAProblem
• getSubtask() : CScanProblem
• getSubtaskType() : COptProblem
• getSubTaskType() : CSensProblem
• getSubType() : CCopasiMethod
• getSubtype() : CNodeK
• getSubWidget() : CQTSSAResultWidget
• getSums() : CNormalLcm
• getSymbolicExpExp() : CSBMLunit
• getSymbolicExponent() : CSBMLunit
• getSynced() : CSlider
• getSystemSeed() : CRandom
• getTable() : CReportBody , CTSSAMethod
• getTableAddr() : CReportDefinition
• getTableName() : CTSSAMethod
• getTag() : CLBase
• getTarget() : CMiaseChange , CReport
• getTargetFunctions() : CSensProblem
• getTargetGlyph() : CLReferenceGlyph
• getTargetGlyphKey() : CLReferenceGlyph
• getTargetKey() : CEventAssignment
• getTargetObject() : CEventAssignment
• getTargetValues() : CMathEvent
• getTask() : Arguments , CMiaseSed , TaskWidget
• getTaskForFolderId() : SliderDialog
• getTaskForName() : Arguments
• getTaskList() : CCopasiDataModel , CCopasiXML , CCopasiXMLParser
• getTaskName() : Arguments
• getTaskToSwitchTo() : Arguments
• getTaskType() : CReportDefinition
• getTemp() : COptions
• getTeX() : CStructureParser
• getText() : CCopasiMessage , CLabel , CLText , CLTextGlyph , CQExpressionMmlStackedWidget , CQTextDialog
• getTextAnchor() : CLGroup , CLText
• getTexture() : CQFontRenderer
• getTextureForText() : CQGLNetworkPainter
• getTextureSize() : CLFontRendererBase , CQFontRenderer
• getTextWidth() : CQGLNetworkPainter
• getThreadTime() : CCopasiTimeVariable
• getThreshold() : CCrossSectionProblem , CCrossValidationSet
• getTickFactor() : CSlider
• getTickNumber() : CSlider
• getTime() : CDataEntity , CModel , CState , CStateRecord
• getTimeData() : CExperiment
• getTimeLimit() : CCrossSectionProblem
• getTimeSeries() : CCrossSectionTask , CTrajectoryTask , CTSSATask
• getTimeUnitEnum() : CModel
• getTimeUnitName() : CModel
• getTimeUnitsDisplayString() : CModel
• getTitle() : CPlotItem , CReportDefinition , CTimeSeries
• getTMP1PrintAnn() : CILDMMethod
• getTMP2PrintAnn() : CILDMMethod
• getTMP3PrintAnn() : CILDMMethod
• getTotalNumberOfSteps() : CScanMethod
• getTotalNumberReference() : CMoiety
• getTotalTime() : CSimSummaryInfo
• getTotSteps() : CModel
• getTrajectoryWidget() : ListViews
• getTransientTime() : CLyapProblem
• getTransientUpdateSequence() : CModel
• getTransitionTime() : CMetab
• getTreeSelection() : CQSimpleSelectionTree
• getTreesWithDiscontinuities() : CModel
• getTreshold() : CSparseMatrix
• getTrigger() : CMathEventN
• getTriggerExpression() : CEvent
• getTriggerExpressionPtr() : CEvent
• getTriplet() : CBiologicalDescription , CCreator , CModification , CReference
• getTriplets() : CRDFGraph
• getTrueExpression() : CMathTrigger::CRootFinder , CNormalChoice , CNormalChoiceLogical
• getType() : C2DPlotCurve , CCopasiMessage , CCopasiMethod , CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CCopasiProblem , CCopasiTask , CEvaluationNode , CEvaluationTree , CEvent , CFunctionParameter , CMathEvent , CMiaseChange , CMiaseChangeAttribute , CMiaseChangeMath , CMiaseModel , CModelParameter , CNodeK , CNormalCall , CNormalFunction , CNormalGeneralPower , CNormalItem , CNormalLogicalItem , CPlotItem , CProcessQueue::CAction , CRandom , CRDFLiteral , CRDFObject , CRDFPredicate , CRDFSubject , CScanItemData , ObjectBrowserItem
• getTypeList() : CLStyle
• getTypes() : CQCompartmentDM , CQGlobalQuantityDM , CQSpecieDM
• getUndefinedFunction() : CCopasiRootContainer
• getUniqueParameterName() : CCopasiParameterGroup
• getUnit() : CModelParameter
• getUnits() : CCopasiContainer , CCopasiObject
• getUnknownMiriamResource() : CCopasiRootContainer
• getUnscaledBMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledConcentrationCC() : CMCAMethod
• getUnscaledConcentrationCCAnn() : CMCAMethod
• getUnscaledCovarianceMatrixAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledCovarianceMatrixReducedAnn() : CLNAMethod
• getUnscaledElasticities() : CMCAMethod
• getUnscaledElasticitiesAnn() : CMCAMethod
• getUnscaledFluxCC() : CMCAMethod
• getUnscaledFluxCCAnn() : CMCAMethod
• getUnsetBitIndexes() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod , CStepMatrix
• getUnsetChild() : CBitPatternTreeNode
• getUnsupportedAnnotations() : CAnnotation , CCopasiXMLParser::ListOfUnsupportedAnnotationsElement , ListOfUnsupportedAnnotationsElement
• getUpdateActions() : CCopasiSpringLayout
• getUpdateMethod() : CCopasiObject , CFitItem , COptItem
• getUpdateSequence() : CMathDependencyGraph , CModel
• getUpperBound() : COptItem
• getUpperBoundValue() : COptItem
• getUptoDateObjects() : CModel
• getURI() : CBiologicalDescription , CMIRIAMResourceObject , CRDFPredicate , CReference , MiriamWebServicesSoapBindingProxy
• getURL() : Copasi2SBMLTranslator , SBMLReference
• getUsage() : CFunctionParameter , CReactionInterface
• getUsedFunctions() : CFunctionDB
• getUserOrder() : CStateTemplate
• getValidator() : CQExpressionWidget
• getValidValueCount() : CExperimentSet
• getValue() : CCopasiParameter , CCopasiParameterGroup , CEvaluationNode , CFunctionAnalyzer::CValue , CModelEntity , CModelParameter , CModelParameterSpecies , COptions::COptionValue , COptions , CTableCell , CXMLAttributeList , QTimeCourseAnimation
• getValueForRow() : CQCurrentValueTable
• getValueForSpecies() : CDataEntity
• getValueFromNumberNode() : CSBMLunitInterface
• getValueObject() : CArrayElementReference , CCopasiContainer , CCopasiMatrixReference< CType > , CCopasiObject , CCopasiObjectReference< CType > , CCopasiVectorReference< CType > , CMetab , CModelEntity
• getValuePointer() : CArrayElementReference , CCopasiMatrixReference< CType > , CCopasiObject , CCopasiObjectReference< CType > , CCopasiParameter , CCopasiTimer , CCopasiVectorReference< CType > , CEvaluationNode , CMathObject , CMetab , CModelEntity , CObjectInterface
• getValueReference() : CCopasiParameter , CModelEntity , CMoiety
• getValues() : CCompressedColumnFormat , CMathContainer
• getValueType() : CMathObject
• getVariable() : CReadConfig
• getVariableGradients() : COptProblem
• getVariableIndex() : CEvaluationTree , CFunction
• getVariables() : CFunction , CSensProblem
• getVariablesDescription() : CAbstractLayoutInterface
• getVariableSize() : COptProblem
• getVariablesPointerList() : CSensItem
• getVariableStdDeviations() : CFitProblem
• getVariableValue() : CEvaluationTree , CFunction
• getVData() : CMiasePlot2D
• getVec_TimeScale() : CTSSAMethod
• getVector() : CEvaluationNodeVector
• getVersion() : CMiaseML , Copasi2SBMLTranslator , CReadConfig , CVersion
• getVersionDevel() : CVersion
• getVersionMajor() : CVersion
• getVersionMinor() : CVersion
• getVfastSpacePrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getViewportHeight() : CQGLLayoutPainter
• getViewportWidth() : CQGLLayoutPainter
• getVolumeRateUnitsDisplayString() : CModel
• getVolumeUnitEnum() : CModel
• getVolumeUnitName() : CModel
• getVolumeUnitsDisplayString() : CModel
• getVslowMetabPrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVslowPrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVslowSpacePrintAnn() : CILDMMethod , CILDMModifiedMethod
• getVTextAnchor() : CLGroup , CLText
• getWeight() : CCrossValidationSet
• getWeightMethod() : CExperiment
• getWholeOutput() : CMiaseOutput
• getWidgetForTask() : Worker
• getWidgetList() : CScanContainerWidget
• getWidth() : CLDimensions , CLGraphicalObject , CLImage , CLRectangle , CQScreenshotOptionsDialog
• getWindowMenu() : CQAnimationWindow , CQCheckModelWindow , CQNewMainWindow , CWindowInterface , PlotWindow , SliderDialog
• getWindows() : CopasiUI3Window
• getWorkingDirectory() : CConfigurationFile
• getX() : CLGraphicalObject , CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText , CQScreenshotOptionsDialog
• getXData() : CMiasePlot2D
• getXML() : CCopasiXMLParser::UnsupportedAnnotationElement , UnsupportedAnnotationElement
• getXmlNs() : CMiaseAnnotation
• getXmlns() : CMiaseML
• getXmlNs() : CMiaseNotes
• getXOffset() : CLRenderPoint
• getXPathAndName() : SEDMLUtils
• getXPathForObject() : SEDMLUtils
• getXPoint1() : CLLinearGradient
• getXPoint2() : CLLinearGradient
• getXPPString() : CEvaluationNode , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeChoice , CEvaluationNodeConstant , CEvaluationNodeDelay , CEvaluationNodeFunction , CEvaluationNodeLogical , CEvaluationNodeObject , CEvaluationNodeOperator , CEvaluationNodeVector , CExpression
• getY() : CLGraphicalObject , CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText , CQScreenshotOptionsDialog
• getYOffset() : CLRenderPoint
• getYPoint1() : CLLinearGradient
• getYPoint2() : CLLinearGradient
• getZ() : CLImage , CLPoint , CLRectangle , CLText
• getZeroSet() : CBitPatternTreeNode , CStepMatrixColumn
• getZOffset() : CLRenderPoint
• getZoomFactor() : CLLayoutRenderer , CQGLLayoutPainter , CQGLNetworkPainter
• getZPoint1() : CLLinearGradient
• getZPoint2() : CLLinearGradient
• globalCheckBoxToggled() : SliderSettingsDialog
• GlobalRenderInformationElement() : CCopasiXMLParser::GlobalRenderInformationElement
• GlobalStyleElement() : CCopasiXMLParser::GlobalStyleElement
• gradient() : COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodSteepestDescent
• GradientStopElement() : CCopasiXMLParser::GradientStopElement
• graphFromXml() : CRDFParser
• GroupElement() : CCopasiXMLParser::GroupElement
• gtims_() : CTruncatedNewton
• guessColumnNumber() : CExperiment , CTableRow
• guessGraphRoot() : CRDFGraph
• GUIElement() : CCopasiXMLParser::GUIElement