- g -
- CGA()
: CGA
- CGraphCurve()
: CGraphCurve
- CGraphNode()
: CGraphNode
- GCD()
: CBitPatternMethod
, CBitPatternTreeMethod
- generalize()
: CFunctionAnalyzer::CValue
- generateCanonicalDNF()
: CNormalLogical
- generatedNodeId()
: CRDFGraph
- GenerateIdHandler()
: CRDFParser
- generateObjectsFromName()
: CReport
- generateReactionIndex()
: CStochMethod
- generateReactionTime()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CHybridMethodODE45
, CStochMethod
- genrand_res53()
: Cmt19937
- get()
: CKeyFactory
, CKeyFactory::HashTable
- get2DTransformationString()
: CLTransformation2D
- get3DTransformationString()
: CLTransformation
- get_autothrow_id()
: copasi::autoexcept
- Get_BestFoundSoFar_candidate()
: COptMethodEP2
, COptMethodHGASA
- get_help_comment()
: copasi::option_error
- get_locations()
: copasi::COptionParser
- get_non_options()
: copasi::COptionParser
- Get_NumGeneration()
: COptMethodEP2
, COptMethodHGASA
- Get_NumParameter()
: COptMethodEP2
, COptMethodHGASA
- get_options()
: copasi::COptionParser
- Get_PopulationSize()
: COptMethodEP2
, COptMethodHGASA
- getAboutNode()
: CRDFGraph
- getAbsoluteValue()
: CLRelAbsVector
- getActDateInSeconds()
: CMIRIAMResources
- getAction()
: CProcessQueue
- getActivity()
: C2DPlotCurve
, CPlotItem
- getAffects()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CHybridMethodODE45
, CStochMethod
- getAllDependencies()
: CCopasiObject
- getAllMessageText()
: CCopasiMessage
- getAllowedLocationList()
: CRDFPredicate
- getAllUnsetBitIndexes()
: CBitPatternMethod
, CStepMatrix
, CStepMatrixColumn
- getAlpha()
: CLColorDefinition
- getAmount()
: CMoiety
- getAmplitudeAnn()
: CCSPMethod
- getAndSets()
: CNormalLogical
- getAnimationRunning()
: CQLayoutMainWindow
- getAnnotation()
: CMiaseBase
- getAnnotationsCN()
: CArrayAnnotation
- getAnnotationsString()
: CArrayAnnotation
- getAnyNote()
: CMiaseAnnotation
- getApplicationFont()
: CConfigurationFile
- getApplyInitialValueRefresh()
: CConcentrationReference
- getArchiveFileName()
: SEDMLImporter
- getAreaUnitEnum()
: CModel
- getAreaUnitName()
: CModel
- getAreaUnitsDisplayString()
: CModel
- getArray()
: CStateRecord
- getArrayLen()
: CStateRecord
- getArrow()
: CGraphCurve
- getArrowLength()
: CArrow
- getArrowWidth()
: CArrow
- getAspect()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getAssignments()
: CEvent
, CMathEventN
- getAssignmentTime()
: CMathEvent
- getAssociatedEntityKey()
: CSlider
- getAttribute()
: CXMLAttributeList
- getAttributeValue()
: CExpatTemplate< CType >
- getAuthor()
: Copasi2SBMLTranslator
- getAvogadro()
: CModel
- getBackgroundColor()
: CLRenderInformationBase
, CLRenderResolver
- getBackwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getBalances()
: CChemEq
- getBase1()
: CLLineSegment
- getBase2()
: CLLineSegment
- getBerkeleyMadonnaString()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
- getBestCandidate()
: CGA
- getBiologicalDescriptions()
: CMIRIAMInfo
- getBlankNodeID()
: CRDFObject
, CRDFSubject
- getBlankNodeMap()
: CRDFGraph
- getBlue()
: CLColorDefinition
- getBMatrixReduced()
: CLNAMethod
- getBMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getBodyAddr()
: CReportDefinition
- getBoundingBox()
: CLGraphicalObject
, CLLineEnding
- getBuffer()
: CExpatTemplate< CType >
- getCalculateStatistics()
: COptProblem
- getCalculateValue()
: COptProblem
- getCalculateVariableUpdateMethods()
: COptProblem
- getCalculationTime()
: CMathEvent
- getCallBack()
: CCopasiTask
- getCalledTree()
: CEvaluationNodeCall
- getCallParameters()
: CReaction
- getCCodeString()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeNumber
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
- getCells()
: CTableRow
- getCenter()
: CLBoundingBox
- getCenterX()
: CLRadialGradient
- getCenterY()
: CLRadialGradient
- getCenterZ()
: CLRadialGradient
- getChange()
: CMiaseModel
- getChannels()
: CPlotItem
- getCharacterData()
: CCopasiXMLParser
- getChemEq()
: CReaction
- getChemEqInterface()
: CReactionInterface
- getChemEqString()
: CChemEqInterface
, CReactionInterface
- getChild()
: CCopasiNode< _Data >
, CModelParameter
, CModelParameterGroup
- getChildObjectUnits()
: CCompartment
, CCopasiContainer
, CMetab
, CModel
, CReaction
- getChildrenCount()
: CBitPatternTreeNode
- getChoices()
: CNormalLogical
- getCN()
: CArrayElementReference
, CCopasiObject
, CCopasiParameter
, CMathContainer
, CMathObject
, CModelParameter
, CObjectInterface
, CQEffectDescription
, CQReportListItem
- getCollapsedResult()
: CSensProblem
- getCollapsedResultAnnotated()
: CSensProblem
- getColor()
: CColorScale1
, CColorScale
, CColorScaleAdvanced
, CColorScaleBiLog
, CColorScaleSimple
, CQPlotColors
- getColorCoding()
: CQArrayAnnotationsWidget
- getColorDefinition()
: CLRenderInformationBase
, CLRenderResolver
- getColorString()
: CCellDesignerImporter
- getColSliderPos()
: CQBarChart
- getColumn()
: CMiaseOutput
- getColumnIndex()
: CCompressedColumnFormat::const_row_iterator
- getColumnNames()
: CExperiment
- getColumns()
: CSparseMatrix
- getColumnStart()
: CCompressedColumnFormat
- getColumnValidValueCount()
: CExperiment
- getComment()
: CReportDefinition
- getCompareResult()
: CModelParameter
- getCompartment()
: CChemEqInterface
, CMetab
- getCompartmentCN()
: CModelParameterSpecies
- getCompartmentNumber()
: CChemEq
, CReaction
- getCompartments()
: CChemEq
, CModel
- getConcentration()
: CMetab
- getConcentrationData()
: CTimeSeries
- getConcentrationRate()
: CMetab
- getConcentrationRateReference()
: CMetab
- getConcentrationRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getConcentrationReference()
: CMetab
- getConcentrationUnitsDisplayString()
: CModel
- getCondition()
: CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
- getConfigDir()
: COptions
- getConfigFile()
: COptions
- getConfiguration()
: CConfigurationFile::CXML
, CCopasiRootContainer
- getConstant()
: CNodeK
- getConstraintList()
: COptProblem
- getConstraintViolation()
: CFitConstraint
, CFitItem
, COptItem
- getContinueFromCurrentState()
: CScanProblem
- getContinueSimultaneousEvents()
: CProcessQueue
, CTrajectoryProblem
- getControlWidget()
: CQLayoutMainWindow
- getConvergenceOutTolerance()
: CCrossSectionProblem
- getConvergenceTolerance()
: CCrossSectionProblem
- getCopasi2SBMLMap()
: CCopasiDataModel
- getCOPASI2SBMLMap()
: CSBMLExporter
- getCopasiColorStr()
: CPlotColors
- getCopasiDir()
: COptions
- getCOPASIkey()
: SBMLReference
- getCopasiSliderForCSlider()
: SliderDialog
- getCopyright()
: Copasi2SBMLTranslator
- getCorrelations()
: CFitProblem
- getCorrespondingTransientObject()
: CModel
- getCovarianceMatrix()
: CLNAMethod
- getCovarianceMatrixAnn()
: CLNAMethod
- getCovarianceMatrixReduced()
: CLNAMethod
- getCovarianceMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getCreatedDT()
: CMIRIAMInfo
- getCreateParameterSets()
: CFitProblem
- getCreators()
: CMIRIAMInfo
- getCrossingsLimit()
: CCrossSectionProblem
- getCrossSectionWidget()
: ListViews
- getCrossValidation()
: CFitItem
- getCrossValidationCount()
: CFitItem
- getCrossValidationRMS()
: CFitProblem
- getCrossValidations()
: CFitItem
- getCrossValidationSD()
: CFitProblem
- getCrossValidationSet()
: CFitProblem
- getCrossValidationSolutionValue()
: CFitProblem
- getCSlider()
: CopasiSlider
- getCSliderForCopasiSlider()
: SliderDialog
- getCSlidersForCurrentFolderId()
: SliderDialog
- getCSlidersForObject()
: SliderDialog
- getCurrentByteCount()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentByteIndex()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentColumnNumber()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentGroup()
: CCopasiXMLParser
- getCurrentHeight()
: CQGLLayoutPainter
- getCurrentIndex()
: CQPlotSubwidget
- getCurrentItemId()
: ListViews
- getCurrentLayout()
: CQLayoutScene
- getCurrentLineNumber()
: CExpatTemplate< CType >
- getCurrentObjectList()
: SensWidgetComboBox
- getCurrentPositionX()
: CQGLLayoutPainter
, CQGLNetworkPainter
- getCurrentPositionY()
: CQGLLayoutPainter
, CQGLNetworkPainter
- getCurrentRenderInfo()
: CQLayoutScene
- getCurrentSBMLDocument()
: CCopasiDataModel
- getCurrentStep()
: CQGLNetworkPainter
, CQLayoutMainWindow
, CTSSAMethod
- getCurrentWallTime()
: CCopasiTimeVariable
- getCurrentWidget()
: ListViews
- getCurrentWidth()
: CQGLLayoutPainter
- getCurve()
: CLGlyphWithCurve
- getCurveBoundingBox()
: CLLayoutRenderer
- getCurveElement()
: CLRenderCurve
- getCurveSegments()
: CLCurve
- getCX()
: CLEllipse
- getCY()
: CLEllipse
- getCZ()
: CLEllipse
- getDashArray()
: CLGraphicalPrimitive1D
- getData()
: CCopasiNode< _Data >
, CCopasiTree< _Node >
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeObject
, CTimeSeries
- getDataModel()
: CopasiUI3Window
, CopasiWidget
, CQLayoutView
, ListViews
- getDatamodelList()
: CCopasiRootContainer
- getDataObject()
: CCopasiDataModel
, CMathObject
- getDataPointCount()
: CExperimentSet
- getDataResources()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataSetAt()
: CQGLNetworkPainter
- getDataType()
: CRDFLiteral
- getDataTypeDef()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypePattern()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypesId()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypesName()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypeSynonyms()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypeURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDataTypeURIs()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getDate()
: CModification
- getDays()
: CCopasiTimeVariable
- getDebugString()
: CDimension
- getDefaultAtol()
: CHybridMethodLSODA
, CHybridMethodODE45
- getDefaultMode()
: CArrayAnnotation
- getDefaultPlotIndex()
: COutputAssistant
- getDefaultReportIndex()
: COutputAssistant
- getDefaults()
: CReadConfig
- getDefaultScale()
: CExperiment
, CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
- getDelayAssignment()
: CEvent
- getDelayExpression()
: CEvent
- getDelayExpressionPtr()
: CEvent
- getDeletedObjects()
: CCompartment
, CEvaluationTree
, CMetab
, CModelEntity
, CReaction
- getDeletedParameters()
: CReactionInterface
- getDenominator()
: CNormalFraction
, CNormalProduct
- getDependentData()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getDependentErrorMean()
: CExperimentSet
- getDependentErrorMeanSD()
: CExperimentSet
- getDependentNumber()
: CMoiety
- getDependentNumberReference()
: CMoiety
- getDependentObjectiveValues()
: CExperimentSet
- getDependentObjects()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getDependentRMS()
: CExperimentSet
- getDependents()
: CDependencyGraph
, CDependencyGraphNode
, CMathDependencyNode
- getDependsOn()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CHybridMethodODE45
, CStochMethod
- getDepth()
: CLDimensions
- getDescendantsWithPredicate()
: CRDFNode
- getDescription()
: CArrayAnnotation
, CCopasiTask
, CMoiety
, Copasi2SBMLTranslator
, CReference
- getDetails()
: SBMLIncompatibility
- getDimensionality()
: CCompartment
- getDimensionDescription()
: CArrayAnnotation
- getDimensions()
: CFindDimensions
, CLayout
, CLBoundingBox
, CLGraphicalObject
- getDirectDependencies()
: CConcentrationReference
, CCopasiObject
, CParticleReference
- getDisplayExpressionString()
: CODEExporter
, CODEExporterBM
, CODEExporterC
, CODEExporterXPPAUT
- getDisplayFunctionString()
: CODEExporter
, CODEExporterBM
, CODEExporterXPPAUT
- getDisplayName()
: CMetabNameInterface
, CMIRIAMResourceObject
, CRDFPredicate
- getDisplayRole()
: CQBrowserPaneDM::CNode
- getDisplayString()
: CDimension
, CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
, CSBMLunit
, CSBMLunitInformation
- getDOTNodeId()
: CMathDependencyGraph
- getDuplicateKey()
: CModelExpansion::ElementsMap
- getDuplicatePtr()
: CModelExpansion::ElementsMap
- getDuration()
: CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getEigenValues()
: CSteadyStateTask
- getEigenValuesReduced()
: CSteadyStateTask
- getEigenValueStatus()
: CLNAMethod
- getElapsedTime()
: CCopasiTimer
- getElapsedTimeSeconds()
: CCopasiTimer
- getElement()
: CLGroup
, CLPolygon
- getElementIndex()
: CCopasiObjectName
- getElementName()
: CCopasiObjectName
- getEmail()
: CCreator
- getEnd()
: CLLineSegment
- getEndColor()
: CQEffectDescription
- getEndHead()
: CLGroup
, CLRenderCurve
- getEndOfLine()
: CArrow
- getEndValue()
: CProcessReportItem
- getEntities()
: CStateTemplate
- getEntityType()
: CMathContainer
, CMathObject
- getEntries()
: CQCopasiAnimation
- getEnvironmentVariable()
: COptions
- getEquation()
: CMoiety
- getErrorCode()
: CExpatTemplate< CType >
- getErrorMean()
: CExperiment
- getErrorMeanSD()
: CExperiment
- getErrorPosition()
: CEvaluationParserBase
, CEvaluationTree
- getErrorString()
: CExpatTemplate< CType >
- getErrorSum()
: CExperiment
- getEvent()
: CProcessQueue::CAction
- getEvents()
: CModel
- getEventTargets()
: CObjectLists
- getExecutionTime()
: COptProblem
, CProcessQueue::CKey
- getExp()
: CNormalItemPower
- getExpandedMetabList()
: CReactionInterface
- getExpatVersion()
: CExpatTemplate< CType >
- getExperiementSet()
: CFitProblem
- getExperiment()
: CExperimentFileInfo
, CExperimentSet
, CFitItem
- getExperimentCount()
: CExperimentSet
, CFitItem
- getExperimentNames()
: CExperimentFileInfo
- getExperiments()
: CFitItem
- getExperimentType()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getExplicitFunctionString()
: CNodeK
- getExponentNumber()
: CLyapProblem
- getExpression()
: CEventAssignment
, CModelEntity
, CMoiety
, CQExpressionWidget
, CQValidatorExpression
- getExpressionPtr()
: CEventAssignment
, CMathObject
, CModelEntity
- getExpressions()
: CSBMLunitInterface
- getExpressionTree()
: CReaction
- getFactor()
: CNormalProduct
- getFalseExpression()
: CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
- getFamilyList()
: CQFontRenderer
- getFamilyName()
: CCreator
- getFastParticipationIndexAnn()
: CCSPMethod
- getFastReactionPointerAnn()
: CCSPMethod
- getFastReactionPointerNormedAnn()
: CCSPMethod
- getFieldCopasiObject()
: ObjectBrowserWidget
- getFieldValue()
: CRDFNode
- getFileExtension()
: Copasi2SBMLTranslator
- getFilename()
: Arguments
- getFileName()
: CCopasiDataModel
, CExperiment
, CExperimentFileInfo
- getFilename()
: CFunctionDB
- getFileNames()
: CExperimentSet
- getFileType()
: Arguments
, Copasi2SBMLTranslator
- getFillColor()
: CLGraphicalPrimitive2D
- getFillRule()
: CLGraphicalPrimitive2D
- getFireAtInitialTime()
: CEvent
- getFirstMessage()
: CCopasiMessage
- getFirstRow()
: CExperiment
- getFirstScheduledTask()
: Arguments
- getFirstUnconvertedRow()
: CStepMatrix
- getFirstUnusedSection()
: CExperimentFileInfo
- getFisherInformation()
: CFitProblem
- getFisherInformationEigenvalues()
: CFitProblem
- getFisherInformationEigenvectors()
: CFitProblem
- getFittingPoints()
: CExperiment
- getFittingWidget()
: ListViews
- getFlagLimitConvergence()
: CCrossSectionProblem
- getFlagLimitCrossings()
: CCrossSectionProblem
- getFlagLimitOutConvergence()
: CCrossSectionProblem
- getFlagLimitOutCrossings()
: CCrossSectionProblem
- getFlagLimitOutTime()
: CCrossSectionProblem
- getFlux()
: CReaction
- getFluxMode()
: CTableauLine
- getFluxModeDescription()
: CEFMTask
- getFluxModes()
: CEFMProblem
, CEFMTask
- getFluxObject()
: CMathReaction
- getFluxReference()
: CReaction
- getFocalPointX()
: CLRadialGradient
- getFocalPointY()
: CLRadialGradient
- getFocalPointZ()
: CLRadialGradient
- getFogColor()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getFogDensity()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getFont()
: CQFontRenderer
- getFontFamily()
: CLGroup
, CLText
- getFontSize()
: CLGroup
, CLText
, CQGLNetworkPainter
, CQLayoutMainWindow
- getFontSpec()
: CLLayoutRenderer
- getFontStyle()
: CLGroup
, CLText
- getFontWeight()
: CLGroup
, CLText
- getFooterAddr()
: CReportDefinition
- getForwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getFraction()
: CNormalFunction
- getFractions()
: CNormalCall
, CNormalSum
- getFrameOption()
: CQScreenshotOptionsDialog
- getFrameSet()
: CQScreenshotOptionsDialog
- getFrequencyUnitsDisplayString()
: CModel
- getFromHistory()
: CQTaskMethodWidget
- getFunction()
: CQExpressionWidget
, CQValidatorFunction
, CReaction
, CReactionInterface
- getFunctionDefinitionForName()
: SBMLImporter
- getFunctionDescription()
: CReactionInterface
- getFunctionEvaluations()
: COptProblem
- getFunctionList()
: CCopasiRootContainer
, CCopasiXML
- getFunctionName()
: CReactionInterface
- getFunctionParameters()
: CFunctionParameterMap
, CReaction
- getGeneration()
: CGA
- getGivenName()
: CCreator
- getGlobalQuantityCN()
: CModelParameterReactionParameter
- getGradientBase()
: CLRenderResolver
- getGradientDefinition()
: CLRenderInformationBase
- getGradientStop()
: CLGradientBase
- getGraphicalObject()
: CLTextGlyph
- getGraphicalObjectKey()
: CLTextGlyph
- getGraphMax()
: CQGLNetworkPainter
- getGraphMin()
: CQGLNetworkPainter
- getGreen()
: CLColorDefinition
- getGroup()
: CCopasiParameterGroup
, CLLineEnding
, CLStyle
- getGUI()
: CCopasiDataModel
, CCopasiXML
- getHeaderAddr()
: CReportDefinition
- getHeaderRow()
: CExperiment
- getHeight()
: CLDimensions
, CLGraphicalObject
, CLImage
, CLRectangle
, CQScreenshotOptionsDialog
- getHierarchy()
: CEigen
- getHighestSeverity()
: CCopasiMessage
- getHighlightColor()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getHighlightedObjects()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getHighlightFlag()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
- getHome()
: COptions
- getHours()
: CCopasiTimeVariable
- getI()
: CEigen
- getId()
: CBiologicalDescription
, CLColorDefinition
, CLGradientBase
, CLLineEnding
, CMiaseBaseEnhanced
, CMiaseColumn
, CMiasePlot2D
, CMIRIAMResourceObject
, CQBrowserPaneDM::CNode
, CRDFNode
, CReference
, SBMLUtils
- getIdentifier()
: CSBMLunitInterface
- getIdentifiersOrgURL()
: CMIRIAMResource
, CMIRIAMResourceObject
- getIdentityMatrix()
: CLTransformation
- getIdentityMatrix2D()
: CLTransformation2D
- getIdFromIndex()
: CQBrowserPaneDM
- getIdFromSBase()
: SBMLUtils
- getIdsFromNode()
: SBMLImporter
- getIgnoreUpdates()
: CopasiWidget
- getImage()
: CQGLNetworkPainter
- getImageHeight()
: CQScreenshotOptionsDialog
- getImageReference()
: CLImage
- getImageWidth()
: CQScreenshotOptionsDialog
- getImportanceIndexAnn()
: CCSPMethod
- getImportanceIndexNormedRowAnn()
: CCSPMethod
- getImportCOPASIMIRIAM()
: SBMLImporter
- getImportHandlerAddr()
: SBMLImporter
, SEDMLImporter
- getIncomingTriplets()
: CRDFGraph
- getIncrement()
: C2DPlotCurve
- getIndependentData()
: CExperiment
, CExperimentSet
- getIndependentObjects()
: CExperiment
- getIndex()
: CCopasiParameterGroup
, CCopasiVector< T >
, CCopasiVectorN< CType >
, CEvaluationNodeVariable
, CMetabOld
, CModelParameter
, CNodeK
, CStateTemplate
, CUpDownSubwidget
, QTimeCourseAnimation
- getIndexForTask()
: Worker
- getIndexForWidget()
: Worker
- getInfix()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CEvaluationTree
- getInfo()
: CSBMLunitInformation
- getInitArgs()
: Arguments
- getInitialConcentration()
: CMetab
- getInitialConcentrationReference()
: CMetab
- getInitialExpression()
: CModelEntity
, CModelParameter
- getInitialExpressionPtr()
: CModelEntity
, CModelParameter
- getInitialState()
: CMathContainer
, CModel
- getInitialTime()
: CMathModel
, CMiaseUniformTimeCourse
, CModel
- getInitialUpdateSequence()
: CModel
- getInitialValue()
: CModelEntity
- getInitialValuePointer()
: CMathContainer
- getInitialValueReference()
: CModelEntity
, CMoiety
- getInitialValues()
: CAbstractLayoutInterface
, CCopasiSpringLayout
- getInputContext()
: CExpatTemplate< CType >
- getInterfaces()
: COutputHandler
- getInternalSpecies()
: CEFMTask
- getInterpolationState()
: CInterpolation
- getIsEnabledRotationalMapping()
: CLLineEnding
- getItem()
: CNormalItemPower
, COutputAssistant
- getItemFor()
: CQLayoutScene
- getItemName()
: COutputAssistant
- getItemPowers()
: CNormalLcm
, CNormalProduct
- getItems()
: CPlotSpecification
, CQComboDelegate
- getItemToType()
: CQCompartmentDM
, CQGlobalQuantityDM
, CQSpecieDM
- getItemType()
: CNormalItemPower
- getJacobian()
: CSteadyStateTask
- getJacobianAnnotated()
: CSteadyStateTask
- getJacobianReduced()
: CSteadyStateTask
- getJacobianXAnnotated()
: CSteadyStateTask
- getJavaLibraryVersion()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getKey()
: CAnnotation
, CBiologicalDescription
, CCopasiObject
, CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiTask
, CCreator
, CEvent
, CEventAssignment
, CFunction
, CFunctionParameter
, CIndexedPriorityQueue
, CLayout
, CLColorDefinition
, CLEllipse
, CLGradientBase
, CLGradientStop
, CLGraphicalObject
, CLGroup
, CLImage
, CListOfLayouts
, CLLineEnding
, CLPolygon
, CLRectangle
, CLRenderCurve
, CLRenderInformationBase
, CLStyle
, CLText
, CMIRIAMInfo
, CModel
, CModelEntity
, CModelParameterSet
, CModification
, CMoiety
, COutputDefinitionVector
, CQBrowserPaneDM::CNode
, CQModelElementTreeWidgetItem
, CQSideCompoundWizardPage::CQListWidgetModelItem
, CReaction
, CReference
, CReportDefinition
, CReportDefinitionVector
, CSlider
, CTimeSeries
- getKeyFactory()
: CCopasiRootContainer
- getKeyForRow()
: CQCurrentValueTable
- getKeyFromIndex()
: CQBrowserPaneDM
- getKeyList()
: CLLocalStyle
- getKeySpace()
: ObjectBrowserItem
- getL()
: CModel
- getL0()
: CModel
- getLabelText()
: CGraphNode
- getLabelWindowWidth()
: CQGLNetworkPainter
- getLanguage()
: CRDFLiteral
- getLargestCompartment()
: CChemEq
, CReaction
- getLastChange()
: CMiaseModel
- getLastColumn()
: CExperimentObjectMap
, CMiaseOutput
- getLastFilledCell()
: CTableRow
- getLastMeasurement()
: CMiaseTask
- getLastMessage()
: CCopasiMessage
- getLastModel()
: CMiaseSed
- getLastNotIgnoredColumn()
: CExperimentObjectMap
- getLastObj()
: CMiaseParser
- getLastOutput()
: CMiaseSed
- getLastPlot2D()
: CMiaseOutput
- getLastRow()
: CExperiment
- getLastSimulation()
: CMiaseSed
- getLastStartValue()
: COptItem
- getLastTask()
: CMiaseSed
- getLayout()
: CCellDesignerImporter
- getLayoutInterface()
: CLayoutEngine
- getLayoutList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getLayoutParameters()
: CQSpringLayoutParameterWindow
- getLeft()
: CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeOperator
, CNodeK
, CNormalGeneralPower
, CNormalLogicalItem
- getLengthUnitEnum()
: CModel
- getLengthUnitName()
: CModel
- getLengthUnitsDisplayString()
: CModel
- getLexicalData()
: CRDFLiteral
- getLicenseHTML()
: CCopasiRootContainer
- getLicenseTxt()
: CCopasiRootContainer
- getLine()
: CArrow
- getLineEnding()
: CLRenderInformationBase
, CLRenderResolver
- getListOfAllCompartmentNames()
: ParameterTable
- getListOfAllGlobalParameterNames()
: ParameterTable
- getListOfAllMetabNames()
: ParameterTable
- getListOfChildNodes()
: CEvaluationNodeCall
- getListOfColorDefinitions()
: CLRenderInformationBase
- getListOfCompartmentGlyphs()
: CLayout
- getListOfConflictingNodes()
: CSBMLunitInterface
- getListOfConstantRefreshes()
: CModel
- getListOfConstObjects()
: CObjectLists
- getListOfContainer()
: CExpression
- getListOfCurveElements()
: CLRenderCurve
- getListOfDefaultOutputDescriptions()
: COutputAssistant
- getListOfDisplayNames()
: CChemEqInterface
- getListOfElements()
: CLGroup
, CLPolygon
- getListOfGeneralGlyphs()
: CLayout
- getListOfGlobalRenderInformationObjects()
: CListOfLayouts
- getListOfGradientDefinitions()
: CLRenderInformationBase
- getListOfGradientStops()
: CLGradientBase
- getListOfInitialRefreshes()
: CModel
- getListOfLayouts()
: CCopasiDataModel
- getListOfLineEndings()
: CLRenderInformationBase
- getListOfLocalParametersWithGivenUnitStatus()
: CSBMLunitInterface
- getListOfLocalRenderInformationObjects()
: CLayout
- getListOfMetaboliteGlyphs()
: CLayout
- getListOfMetabReferenceGlyphs()
: CLReactionGlyph
- getListOfMetabs()
: CReactionInterface
- getListOfMultiplicities()
: CChemEqInterface
- getListOfNonSimulatedRefreshes()
: CModel
- getListOfObjects()
: CObjectLists
- getListOfObjectsWithGivenUnitStatus()
: CSBMLunitInterface
- getListOfPoints()
: CLCurve
- getListOfPossibleFunctions()
: CReactionInterface
- getListOfReactionGlyphs()
: CLayout
- getListOfReferenceGlyphs()
: CLGeneralGlyph
- getListOfSimulatedRefreshes()
: CModel
- getListOfStyles()
: CLGlobalRenderInformation
, CLLocalRenderInformation
- getListOfSubglyphs()
: CLGeneralGlyph
- getListOfTextGlyphs()
: CLayout
- getListType()
: CSensItem
- getListTypeDisplayName()
: CSensItem
- getLiteral()
: CRDFObject
- getLNAWidget()
: ListViews
- getLocalResourceNodeMap()
: CRDFGraph
- getLocalValue()
: CFitItem
, CReactionInterface
- getLocation()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLocations()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLocations_()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getLowerBound()
: COptItem
- getLowerBoundValue()
: COptItem
- getMainWidget()
: CopasiUI3Window
- getMainWindow()
: CopasiUI3Window
- getMap()
: CModelExpansion::ElementsMap
- getMappedObjects()
: CExperimentObjectMap
- getMappedUnitFromIdentifier()
: CSBMLunitInterface
- getMappedUnitFromNumberNode()
: CSBMLunitInterface
- getMapping()
: CReactionInterface
- getMappingMode()
: CQLayoutMainWindow
- getMappings()
: CReactionInterface
- getMassVector()
: CAbstractLayoutInterface
- getMathML()
: Expression2PresentationMMLUnits
- getMathModel()
: CModel
- getMathObject()
: CMathContainer
- getMathTrigger()
: CMathEvent
- getMatrix()
: CLTransformation
- getMatrix2D()
: CLTransformation2D
- getMax()
: QTimeCourseAnimation
- getMaxForSpecies()
: CSimSummaryInfo
- getMaximagpart()
: CEigen
- getMaxNodeSize()
: CQLayoutMainWindow
- getMaxOverallConcentration()
: CSimSummaryInfo
- getMaxrealpart()
: CEigen
- getMaxValue()
: CSlider
- getMCAWidget()
: ListViews
- getMeasurement()
: CMiaseTask
- getMessage()
: CCopasiException
, SBMLIncompatibility
- getMessageAboutUnknownUnits()
: CSBMLunitInterface
- getMetabGlyph()
: CLMetabReferenceGlyph
- getMetabGlyphKey()
: CLMetabReferenceGlyph
- getMetabolite()
: CChemEqElement
, CMetabNameInterface
- getMetaboliteKey()
: CChemEqElement
, CMetabNameInterface
- getMetabolites()
: CCompartment
, CModel
- getMetabolitesX()
: CModel
- getMetaId()
: CMiaseBase
- getMethod()
: CCopasiTask
- getMethodLog()
: CSteadyStateMethod
- getMicroSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getMilliSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getMinForSpecies()
: CSimSummaryInfo
- getMinNodeSize()
: CQLayoutMainWindow
- getMinOverallConcentration()
: CSimSummaryInfo
- getMinutes()
: CCopasiTimeVariable
- getMinValue()
: CSlider
- getMiriamAnnotation()
: CAnnotation
- getMIRIAMCitation()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMDeprecated()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMDisplayName()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMInfo()
: CQMiriamWidget
- getMIRIAMLastUpdateDate()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMMIRIAMResource()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMPattern()
: CMIRIAMResource
- getMIRIAMResource()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMResourceIndex()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMResourceObject()
: CBiologicalDescription
, CReference
- getMIRIAMResources()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMUpdateFrequency()
: CMIRIAMResources
- getMIRIAMURI()
: CMIRIAMResource
- getMiriamURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getMMLName()
: CMathMl
- getMMLString()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeNumber
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVariable
- getMode()
: CArrayAnnotation
, CQEffectDescription
- getModel()
: CCopasiDataModel
, CCopasiProblem
, CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
, CLNAMethod
, CMathContainer
, CMCAMethod
, CMetab
, CMiaseSed
, CModelParameter
, CModelParameterSet
, CSBMLunitInterface
- getModelObject()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectCN()
: CFittingPoint
- getModelObjectDisplayName()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectKey()
: CLGraphicalObject
- getModelObjectName()
: CLGraphicalObject
- getModelParameter()
: CModelParameterGroup
- getModelParameterSet()
: CModel
- getModelParameterSets()
: CModel
- getModelReaction()
: CMathReaction
- getModelReference()
: CMiaseTask
- getModelType()
: CModel
- getModelValues()
: CModel
- getModifications()
: CMIRIAMInfo
- getModifiedSpecies()
: CMathReaction
- getModifierCompartments()
: CChemEqParserBase
- getModifierMulitplicities()
: CChemEqParserBase
- getModifierNames()
: CChemEqParserBase
- getModifiers()
: CChemEq
- getModulus()
: CRandom
- getMoieties()
: CModel
- getMoiety()
: CMetab
- getMolecularity()
: CChemEq
, CChemEqInterface
- getMultiplicity()
: CChemEqElement
- getMultiplier()
: CFluxMode
, CStepMatrixColumn
, CTableauLine
- getName()
: CCopasiParameterGroup
, CCopasiXMLParser::UnsupportedAnnotationElement
, CExperimentObjectMap
, CLRenderInformationBase
, CMiaseBaseEnhanced
, CMiaseColumn
, CMiaseMeasurementData
, CMiasePlot2D
, CModelParameter
, CModelParameterSet
, CModelParameterSpecies
, CNodeK
, CNormalCall
, CNormalItem
, Copasi2SBMLTranslator
, CTableCell
, CXMLAttributeList
, MiriamWebServicesSoapBindingProxy
, UnsupportedAnnotationElement
- getNameForNodeKey()
: CQGLNetworkPainter
- getNames()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getNameSpaceMap()
: CRDFGraph
- getNameSpaceQualifier()
: CRDFUtilities
- getNcplxconj()
: CEigen
- getNetReaction()
: CEFMTask
- getNetReactionData()
: CEFMTask
- getNewMath()
: CMiaseChangeMath
- getNewValue()
: CMiaseChangeAttribute
- getNext()
: CCopasiNode< _Data >
- getNextId()
: SEDMLUtils
- getNextNonChild()
: CCopasiNode< _Data >
- getNextUnusedSection()
: CExperimentFileInfo
- getNimag()
: CEigen
- getNnegreal()
: CEigen
- getNode()
: CMIRIAMResourceObject
- getNodeList()
: CEvaluationParserBase
, CEvaluationTree
- getNodeNameEntry()
: CQGLNetworkPainter
- getNodeObject()
: CExpression
- getNodes()
: CKinFunction
- getNonOptions()
: COptions
- getNormalizeWeightsPerExperiment()
: CExperiment
- getNotes()
: CAnnotation
, CMiaseBase
, CMiaseNotes
- getNposreal()
: CEigen
- getNreal()
: CEigen
- getNumAssignmentMetabs()
: CModel
- getNumber()
: CCopasiMessage
, CMoiety
- getNumber2QuantityFactor()
: CModel
- getNumberOfBits()
: CZeroSet
- getNumberOfElements()
: CDataEntity
- getNumberOfMeasurements()
: CMiaseTask
- getNumberOfNodeEntries()
: CQGLNetworkPainter
- getNumberOfParametersByUsage()
: CFunctionParameters
- getNumberOfPoints()
: CMiaseUniformTimeCourse
- getNumberOfReactants()
: CSimSummaryInfo
- getNumberOfScanItems()
: CScanProblem
- getNumberOfSetBits()
: CZeroSet
- getNumberOfSteps()
: CQGLNetworkPainter
, CSimSummaryInfo
- getNumberOfSubtaskCalculations()
: CSensMethod
- getNumberOfUnsetBits()
: CZeroSet
- getNumberOfVariables()
: CSensProblem
- getNumChannels()
: CPlotItem
- getNumChildren()
: CCopasiNode< _Data >
, CModelParameter
, CModelParameterGroup
- getNumColorDefinitions()
: CLRenderInformationBase
- getNumColumns()
: CExperiment
- getNumCopasiColors()
: CPlotColors
- getNumCurveSegments()
: CLCurve
- getNumDataRows()
: CExperiment
- getNumDependent()
: CLinkMatrix
, CState
, CStateTemplate
- getNumDependentReactionMetabs()
: CModel
- getNumElements()
: CLGroup
, CLPolygon
, CLRenderCurve
- getNumerator()
: CNormalFraction
- getNumFixed()
: CState
, CStateTemplate
- getNumGradientDefinitions()
: CLRenderInformationBase
- getNumGradientStops()
: CLGradientBase
- getNumIndependent()
: CLinkMatrix
, CState
, CStateTemplate
- getNumIndependentReactionMetabs()
: CModel
- getNumKeys()
: CLLocalStyle
- getNumLineEndings()
: CLRenderInformationBase
- getNumMetabs()
: CModel
- getNumModelValues()
: CModel
- getNumODEMetabs()
: CModel
- getNumOfChanges()
: CMiaseModel
- getNumOfModels()
: CMiaseSed
- getNumOfOutputs()
: CMiaseSed
- getNumOfSimulations()
: CMiaseSed
- getNumOfTasks()
: CMiaseSed
- getNumRoles()
: CLStyle
- getNumRoots()
: CMathModel
, CModel
- getNumSteps()
: CQCopasiAnimation
, CScanItem
- getNumStyles()
: CLGlobalRenderInformation
, CLLocalRenderInformation
- getNumTypes()
: CLStyle
- getNumUnconvertedRows()
: CStepMatrix
- getNumVariable()
: CState
, CStateTemplate
- getNumVariableMetabs()
: CModel
- getNumVariables()
: CAbstractLayoutInterface
, CTimeSeries
- getNzero()
: CEigen
- getObject()
: CArrayAnnotation
, CCopasiContainer
, CCopasiMatrixReference< CType >
, CCopasiObject
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiVector< T >
, CCopasiVectorN< CType >
, CCopasiVectorReference< CType >
, CMathContainer
, CMathDependencyNode
, CMathObject
, CModelParameter
, CObjectInterface
, COptItem
, CQModelElementTreeWidgetItem
, CQSideCompoundWizardPage::CQListWidgetModelItem
, CRDFNode
, CReaction
, CScanItem
, ObjectBrowserItem
, Refresh
, RefreshTemplate< CClass >
- getObjectAncestor()
: CCopasiObject
- getObjectCN()
: CEvaluationNodeObject
, CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
, COptItem
- getObjectDataFromRefresh()
: CDotOutput
- getObjectDataModel()
: CCopasiObject
- getObjectDisplayName()
: CArrayAnnotation
, CArrayElementReference
, CCopasiObject
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiParameter
, CCopasiReportSeparator
, CCopasiStaticString
, CEvent
, CFittingPoint
, CMetab
, COptItem
, CReaction
- getObjectForSbmlId()
: SEDMLUtils
- getObjectFromName()
: CCopasiXMLParser
- getObjectInterfacePtr()
: CEvaluationNodeObject
- getObjectiveFunction()
: COptProblem
- getObjectiveValue()
: CExperiment
- getObjectKey()
: CCompartmentGraphNode
, CGraphNode
- getObjectMap()
: CExperiment
- getObjectName()
: CCopasiObject
, CCopasiObjectName
- getObjectNameVector()
: CReportTable
- getObjectParent()
: CCopasiObject
- getObjectRole()
: CLGraphicalObject
- getObjects()
: CCopasiContainer
, CFunctionParameterMap
, COutputInterface
, PlotWindow
- getObjectsAt()
: CLLayoutRenderer
- getObjectsAtViewportPosition()
: CLLayoutRenderer
- getObjectsInBoundingBox()
: CLLayoutRenderer
- getObjectSingle()
: CCopasiSelectionDialog
- getObjectType()
: CCopasiObject
, CCopasiObjectName
- getObjectValue()
: CFitItem
, COptItem
- getObjectValuePtr()
: CEvaluationNodeObject
- getObjectVector()
: CCopasiSelectionDialog
- getOfficialDataTypeURI()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getOffset()
: CLGradientStop
- getOpenFileName()
: CopasiFileDialog
- getOptimizationWidget()
: ListViews
- getOptItem()
: COptProblem
- getOptItemList()
: COptProblem
- getOptItemSize()
: COptProblem
- getOrder()
: CMathEvent
- getORG()
: CCreator
- getOrigHeight()
: CLabel
- getOriginalValue()
: CSlider
- getOrigNodeKey()
: CCompartmentGraphNode
, CGraphNode
- getOrigValueForSpecies()
: CDataEntity
- getOrigWidth()
: CLabel
- getOutCrossingsLimit()
: CCrossSectionProblem
- getOutput()
: CMiaseSed
- getOutputDir()
: Arguments
- getOutputEndTime()
: CMiaseUniformTimeCourse
- getOutputEvent()
: CTrajectoryProblem
- getOutputHandler()
: CCopasiTask
- getOutputInSubtask()
: CScanProblem
- getOutputMode()
: CCopasiTask
- getOutputStartTime()
: CMiaseUniformTimeCourse
, CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getOutputToGenerate()
: Arguments
- getPainter()
: CQGLLayoutViewer
, CQGLViewport
- getParameter()
: CCopasiParameterGroup
- getParameterByUsage()
: CFunctionParameters
- getParameterIndex()
: CReaction
- getParameterMapping()
: CReaction
- getParameterMappings()
: CReaction
- getParameterName()
: CReactionInterface
- getParameters()
: CReaction
- getParameterValue()
: CReaction
- getParameterWindow()
: CQLayoutThread
- getParamNum()
: CGA
- getParent()
: CCopasiNode< _Data >
, CModelParameter
- getParentSubjects()
: CRDFGraph
- getParticipatesIn()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
- getParticipationIndexAnn()
: CCSPMethod
- getParticipationIndexNormedColumnAnn()
: CCSPMethod
- getParticipationIndexNormedRowAnn()
: CCSPMethod
- getParticleFlux()
: CModel
, CReaction
- getParticleFluxObject()
: CMathReaction
- getParticleFluxReference()
: CReaction
- getPath()
: CQConnectionGraphicsItem
, CRDFNode
- getPauseAction()
: CQPlayerControlWidget
- getPersistentTrigger()
: CEvent
- getPlayAction()
: CQPlayerControlWidget
- getPlot()
: PlotWindow
- getPlot2D()
: CMiaseOutput
- getPlotDefinitionList()
: CCopasiDataModel
, DataModelGUI
- getPlotList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getPoint()
: CArrow
- getPointers()
: CFunctionParameterMap
- getPointNearCircle()
: CQGLNetworkPainter
- getPointOnCircle()
: CQGLNetworkPainter
- getPointOnRectangle()
: CGraphNode
, CQGLNetworkPainter
- getPopSize()
: CGA
- getPosition()
: CLBoundingBox
, CLGraphicalObject
- getPositionPoint()
: CCellDesignerImporter
- getPossibleTargetFunctions()
: CSensProblem
- getPossibleVariables()
: CSensProblem
- getPotential()
: CAbstractLayoutInterface
, CCopasiSpringLayout
- getPrecision()
: CReportDefinition
- getPredicate()
: CBiologicalDescription
- getPredicateFromDisplayName()
: CRDFPredicate
- getPredicateFromURI()
: CRDFPredicate
- getPredicatePath()
: CRDFGraph
- getPrerequisites()
: CCopasiObject
, CMathDependencyNode
, CMathExpression
, CMathObject
, CObjectInterface
, CParticleReference
- getPrimary()
: CCopasiObjectName
- getPriorityExpression()
: CEvent
- getPriorityExpressionPtr()
: CEvent
- getProblem()
: CCopasiTask
- getProcessingModes()
: CMathDependencyNodeIterator
, CNodeContextIterator< Node, Context >
- getProcessQueue()
: CMathModel
- getProcessQueueExecutionTime()
: CMathModel
, CModel
, CProcessQueue
- getProcessTime()
: CCopasiTimeVariable
- getProductCompartments()
: CChemEqParserBase
- getProductMulitplicities()
: CChemEqParserBase
- getProductNames()
: CChemEqParserBase
- getProducts()
: CChemEq
, CNormalSum
- getPropensityObject()
: CMathReaction
- getPropensityReference()
: CReaction
- getptc_()
: CTruncatedNewton
- getPWD()
: COptions
- getQuantity2NumberFactor()
: CModel
- getQuantityRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getQuantityUnitEnum()
: CModel
- getQuantityUnitName()
: CModel
- getQuantityUnitOldXMLName()
: CModel
- getQuantityUnitsDisplayString()
: CModel
- getR()
: CEigen
- getRadicalPointerAnn()
: CCSPMethod
- getRadius()
: CLRadialGradient
- getRadiusX()
: CLRectangle
- getRadiusY()
: CLRectangle
- getRandomCC()
: Cmt19937
, Cmt19937HR
, Cr250
, CRandom
- getRandomCO()
: Cmt19937
, Cmt19937HR
, Cr250
, CRandom
- getRandomExp()
: CRandom
- getRandomGamma()
: CRandom
- getRandomizeStartValues()
: COptProblem
- getRandomNormal()
: CRandom
- getRandomNormal01()
: CRandom
- getRandomNormalLog()
: CRandom
- getRandomNormalPositive()
: CRandom
- getRandomOO()
: Cmt19937
, Cmt19937HR
, Cr250
, CRandom
- getRandomPoisson()
: CRandom
- getRandomS()
: Cmt19937
, Cr250
, CRandom
- getRandomStdGamma()
: CRandom
- getRandomU()
: Cmt19937
, Cr250
, CRandom
- getRandomValue()
: COptItem
- getRate()
: CModelEntity
- getRateReference()
: CModelEntity
- getRDFGraph()
: CMIRIAMInfo
- getReacSlowSpacePrintAnn()
: CILDMMethod
- getReaction()
: CModelParameterReactionParameter
, CStepMatrixColumn
- getReactionEquation()
: CEFMTask
- getReactionIndex4Hybrid()
: CHybridMethodODE45
- getReactions()
: CModel
- getRecentFiles()
: CConfigurationFile
- getRecentMIRIAMResources()
: CConfigurationFile
- getRecentSBMLFiles()
: CConfigurationFile
- getRecentSEDMLFiles()
: CConfigurationFile
- getRecordedSteps()
: CTimeSeries
- getRed()
: CLColorDefinition
- getRedStoi()
: CModel
- getReferenceDirectory()
: CCopasiDataModel
- getReferenceRenderInformationKey()
: CLRenderInformationBase
- getReferences()
: CMIRIAMInfo
- getRefresh()
: CCopasiObject
- getRelativeValue()
: CLRelAbsVector
- getRemainder()
: CCopasiObjectName
- getRemoteResourceNodes()
: CRDFGraph
- getRenderInformation()
: CLayout
, CListOfLayouts
- getReorderedReactions()
: CEFMProblem
- getReport()
: CCopasiTask
- getReportDefinition()
: CReport
- getReportDefinitionList()
: CCopasiDataModel
- getReportFile()
: Arguments
- getReportList()
: CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getResiduals()
: CFitProblem
- getResolver()
: CQCopasiGraphicsItem
, CQLayoutScene
- getResource()
: CBiologicalDescription
, CMIRIAMResourceObject
, CRDFObject
, CRDFSubject
, CReference
- getResourceIndexFromDisplayName()
: CMIRIAMResources
- getResourceInfo()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResourceInstitution()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResourceList()
: CMIRIAMResourceObject
, CMIRIAMResources
- getResourceLocation()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getResult()
: CCopasiTask
, CFunctionAnalyzer
, CSensProblem
, CSteadyStateTask
- getResultAnnotated()
: CSensProblem
- getReversibility()
: CChemEq
, CChemEqInterface
- getRight()
: CEvaluationNodeOperator
, CNodeK
, CNormalGeneralPower
, CNormalLogicalItem
- getRMS()
: CExperiment
, CFitProblem
- getRole()
: CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
, CGraphCurve
, CLMetabReferenceGlyph
, CLReferenceGlyph
- getRoleDisplayName()
: CLMetabReferenceGlyph
- getRoleList()
: CLStyle
- getRoot()
: CBitPatternTree
, CCopasiRootContainer
, CCopasiTree< _Node >
, CEvaluationTree
, ObjectList
- getRootFinders()
: CMathModel
, CMathTrigger
, CModel
- getRootNode()
: CEvaluationParserBase
- getRoots()
: CMathEventN::CTrigger
, CTrajectoryMethod
- getRootValuePtr()
: CMathTrigger::CRootFinder
- getRow()
: CQBrowserPaneDM::CNode
, CQParameterOverviewDM
, CQPlotSubwidget
- getRowIndex()
: CCompressedColumnFormat
- getRowPivots()
: CLinkMatrix
- getRows()
: CSparseMatrix
- getRowSliderPos()
: CQBarChart
- getRX()
: CLEllipse
- getRY()
: CLEllipse
- getSaveFileName()
: CopasiFileDialog
, CQSBMLFileDialog
, CQSEDMLFileDialog
- getSBMLBoundingBox()
: CLBoundingBox
- getSBMLDimensions()
: CLDimensions
- getSBMLDocument()
: CCellDesignerImporter
, CSBMLExporter
- getSBMLFileName()
: CCopasiDataModel
- getSBMLId()
: CEvent
, CFunction
, CModelEntity
, CReaction
, CTimeSeries
- getSBMLid()
: SBMLReference
- getSBMLPoint()
: CLPoint
- getSBMLUnitDefinition()
: CSBMLunit
- getSBMLUnitDefinitionForId()
: SBMLImporter
- getScale()
: CExperimentObjectMap::CDataColumn
, CExperimentObjectMap
- getScaledBMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getScaledConcentrationCC()
: CMCAMethod
- getScaledConcentrationCCAnn()
: CMCAMethod
- getScaledCovarianceMatrixAnn()
: CLNAMethod
- getScaledCovarianceMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getScaledElasticities()
: CMCAMethod
- getScaledElasticitiesAnn()
: CMCAMethod
- getScaledFisherInformation()
: CFitProblem
- getScaledFisherInformationEigenvalues()
: CFitProblem
- getScaledFisherInformationEigenvectors()
: CFitProblem
- getScaledFluxCC()
: CMCAMethod
- getScaledFluxCCAnn()
: CMCAMethod
- getScaledResult()
: CSensProblem
- getScaledResultAnnotated()
: CSensProblem
- getScaleEnd()
: CQEffectDescription
- getScaleMode()
: CQCopasiAnimation
- getScales()
: CQCopasiAnimation
, QConservedSpeciesAnimation
, QFluxModeAnimation
, QTimeCourseAnimation
- getScaleStart()
: CQEffectDescription
- getScaling()
: CSlider
- getScalingMode()
: CQLayoutMainWindow
- getScanItem()
: CScanProblem
- getScanWidget()
: ListViews
- getScore()
: CTableauLine
- getSeconds()
: CCopasiTimeVariable
- getSed()
: CMiaseML
- getSEDMLDocument()
: CSEDMLExporter
- getSegmentAt()
: CLCurve
- getSelectedCompartments()
: CQAutolayoutWizard
- getSelectedMetabolites()
: CQAutolayoutWizard
- getSelectedReactions()
: CQAutolayoutWizard
- getSelection()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
, CQNameSelectionDialog
- getSelectionBox()
: CLLayoutRenderer
- getSeparator()
: CExperiment
, CReportDefinition
, CReportTable
, CTableCell
- getServicesInfo()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getServicesVersion()
: MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getSet()
: CModelParameter
, CRegisteredObjectName
- getSetChild()
: CBitPatternTreeNode
- getSeverity()
: SBMLIncompatibility
- getSibling()
: CCopasiNode< _Data >
- getSideCompounds()
: CQSideCompoundWizardPage
- getSideMetabolites()
: CQAutolayoutWizard
- getSimulation()
: CMiaseSed
- getSimulationReference()
: CMiaseTask
- getSimulationType()
: CMathObject
, CModelParameter
- getSingleLineComment()
: CODEExporter
, CODEExporterC
- getSingleObjectCN()
: CCrossSectionProblem
, CSensItem
- getSingleObjectDisplayName()
: CSensItem
- getSize()
: CGraphNode
, CNormalCall
, CNormalSum
- getSlider()
: SliderSettingsDialog
- getSliderList()
: SCopasiXMLGUI
- getSliderObject()
: CSlider
- getSliderObjectCN()
: CSlider
- getSliders()
: CCopasiTask
- getSliderType()
: CSlider
- getSliderValue()
: CSlider
- getSlowParticipationIndexAnn()
: CCSPMethod
- getSlowPropensitySum()
: CStateRecord
- getSolutionValue()
: COptProblem
- getSolutionVariables()
: COptProblem
- getSortRole()
: CQBrowserPaneDM::CNode
- getSource()
: CMiaseMeasurementData
, CMiaseModel
- getSpeciesChanges()
: CEFMTask
- getSpreadMethod()
: CLGradientBase
- getStabilityResolution()
: CSteadyStateMethod
- getStart()
: CLLineSegment
- getStartColor()
: CQEffectDescription
- getStartHead()
: CLGroup
, CLRenderCurve
- getStartOfLine()
: CArrow
- getStartValue()
: COptItem
- getState()
: CCrossSectionTask
, CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CMathContainer
, CModel
, CSteadyStateTask
, CTrajectoryTask
, CTSSATask
- getStateReduced()
: CMathContainer
- getStateTemplate()
: CModel
- getStaticString()
: CCopasiStaticString
- getStatistics()
: CSBMLunitInterface
- getStatus()
: CFunctionAnalyzer::CValue
, CModelEntity
- getStdDeviation()
: CFitProblem
- getSteadyStateStatus()
: CLNAMethod
, CMCAMethod
- getSteadyStateWidget()
: ListViews
- getStepBackwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStepForwardAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStepMatrixColumn()
: CBitPatternTreeNode
- getStepNumber()
: CCrossSectionProblem
, CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getStepSize()
: CCrossSectionProblem
, CTrajectoryProblem
, CTSSAProblem
- getStepsPerSecond()
: CQLayoutMainWindow
- getStiffness()
: CEigen
- getStochTimeAndIndex()
: CHybridMethod
, CHybridMethodLSODA
, CHybridMethodODE45
- getStoi()
: CModel
- getStopAction()
: CQPlayerControlWidget
- getStopColor()
: CLGradientStop
- getStream()
: CReport
- getStroke()
: CLGraphicalPrimitive1D
- getStrokeWidth()
: CLGraphicalPrimitive1D
- getStyle()
: CLGlobalRenderInformation
, CLLocalRenderInformation
, CQCopasiGraphicsItem
- getSubject()
: CRDFNode
- getSubPathIndex()
: CRDFPredicate
- getSubstrateCompartments()
: CChemEqParserBase
- getSubstrateMulitplicities()
: CChemEqParserBase
- getSubstrateNames()
: CChemEqParserBase
- getSubstrates()
: CChemEq
- getSubTask()
: CLNAProblem
, CMCAProblem
- getSubtask()
: CScanProblem
- getSubtaskType()
: COptProblem
- getSubTaskType()
: CSensProblem
- getSubType()
: CCopasiMethod
- getSubtype()
: CNodeK
- getSubWidget()
: CQTSSAResultWidget
- getSums()
: CNormalLcm
- getSymbolicExpExp()
: CSBMLunit
- getSymbolicExponent()
: CSBMLunit
- getSynced()
: CSlider
- getSystemSeed()
: CRandom
- getTable()
: CReportBody
, CTSSAMethod
- getTableAddr()
: CReportDefinition
- getTableName()
: CTSSAMethod
- getTag()
: CLBase
- getTarget()
: CMiaseChange
, CReport
- getTargetFunctions()
: CSensProblem
- getTargetGlyph()
: CLReferenceGlyph
- getTargetGlyphKey()
: CLReferenceGlyph
- getTargetKey()
: CEventAssignment
- getTargetObject()
: CEventAssignment
- getTargetValues()
: CMathEvent
- getTask()
: Arguments
, CMiaseSed
, TaskWidget
- getTaskForFolderId()
: SliderDialog
- getTaskForName()
: Arguments
- getTaskList()
: CCopasiDataModel
, CCopasiXML
, CCopasiXMLParser
- getTaskName()
: Arguments
- getTaskToSwitchTo()
: Arguments
- getTaskType()
: CReportDefinition
- getTemp()
: COptions
- getTeX()
: CStructureParser
- getText()
: CCopasiMessage
, CLabel
, CLText
, CLTextGlyph
, CQExpressionMmlStackedWidget
, CQTextDialog
- getTextAnchor()
: CLGroup
, CLText
- getTexture()
: CQFontRenderer
- getTextureForText()
: CQGLNetworkPainter
- getTextureSize()
: CLFontRendererBase
, CQFontRenderer
- getTextWidth()
: CQGLNetworkPainter
- getThreadTime()
: CCopasiTimeVariable
- getThreshold()
: CCrossSectionProblem
, CCrossValidationSet
- getTickFactor()
: CSlider
- getTickNumber()
: CSlider
- getTime()
: CDataEntity
, CModel
, CState
, CStateRecord
- getTimeData()
: CExperiment
- getTimeLimit()
: CCrossSectionProblem
- getTimeSeries()
: CCrossSectionTask
, CTrajectoryTask
, CTSSATask
- getTimeUnitEnum()
: CModel
- getTimeUnitName()
: CModel
- getTimeUnitsDisplayString()
: CModel
- getTitle()
: CPlotItem
, CReportDefinition
, CTimeSeries
- getTMP1PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTMP2PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTMP3PrintAnn()
: CILDMMethod
- getTotalNumberOfSteps()
: CScanMethod
- getTotalNumberReference()
: CMoiety
- getTotalTime()
: CSimSummaryInfo
- getTotSteps()
: CModel
- getTrajectoryWidget()
: ListViews
- getTransientTime()
: CLyapProblem
- getTransientUpdateSequence()
: CModel
- getTransitionTime()
: CMetab
- getTreeSelection()
: CQSimpleSelectionTree
- getTreesWithDiscontinuities()
: CModel
- getTreshold()
: CSparseMatrix
- getTrigger()
: CMathEventN
- getTriggerExpression()
: CEvent
- getTriggerExpressionPtr()
: CEvent
- getTriplet()
: CBiologicalDescription
, CCreator
, CModification
, CReference
- getTriplets()
: CRDFGraph
- getTrueExpression()
: CMathTrigger::CRootFinder
, CNormalChoice
, CNormalChoiceLogical
- getType()
: C2DPlotCurve
, CCopasiMessage
, CCopasiMethod
, CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, CCopasiProblem
, CCopasiTask
, CEvaluationNode
, CEvaluationTree
, CEvent
, CFunctionParameter
, CMathEvent
, CMiaseChange
, CMiaseChangeAttribute
, CMiaseChangeMath
, CMiaseModel
, CModelParameter
, CNodeK
, CNormalCall
, CNormalFunction
, CNormalGeneralPower
, CNormalItem
, CNormalLogicalItem
, CPlotItem
, CProcessQueue::CAction
, CRandom
, CRDFLiteral
, CRDFObject
, CRDFPredicate
, CRDFSubject
, CScanItemData
, ObjectBrowserItem
- getTypeList()
: CLStyle
- getTypes()
: CQCompartmentDM
, CQGlobalQuantityDM
, CQSpecieDM
- getUndefinedFunction()
: CCopasiRootContainer
- getUniqueParameterName()
: CCopasiParameterGroup
- getUnit()
: CModelParameter
- getUnits()
: CCopasiContainer
, CCopasiObject
- getUnknownMiriamResource()
: CCopasiRootContainer
- getUnscaledBMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getUnscaledConcentrationCC()
: CMCAMethod
- getUnscaledConcentrationCCAnn()
: CMCAMethod
- getUnscaledCovarianceMatrixAnn()
: CLNAMethod
- getUnscaledCovarianceMatrixReducedAnn()
: CLNAMethod
- getUnscaledElasticities()
: CMCAMethod
- getUnscaledElasticitiesAnn()
: CMCAMethod
- getUnscaledFluxCC()
: CMCAMethod
- getUnscaledFluxCCAnn()
: CMCAMethod
- getUnsetBitIndexes()
: CBitPatternMethod
, CBitPatternTreeMethod
, CStepMatrix
- getUnsetChild()
: CBitPatternTreeNode
- getUnsupportedAnnotations()
: CAnnotation
, CCopasiXMLParser::ListOfUnsupportedAnnotationsElement
, ListOfUnsupportedAnnotationsElement
- getUpdateActions()
: CCopasiSpringLayout
- getUpdateMethod()
: CCopasiObject
, CFitItem
, COptItem
- getUpdateSequence()
: CMathDependencyGraph
, CModel
- getUpperBound()
: COptItem
- getUpperBoundValue()
: COptItem
- getUptoDateObjects()
: CModel
- getURI()
: CBiologicalDescription
, CMIRIAMResourceObject
, CRDFPredicate
, CReference
, MiriamWebServicesSoapBindingProxy
- getURL()
: Copasi2SBMLTranslator
, SBMLReference
- getUsage()
: CFunctionParameter
, CReactionInterface
- getUsedFunctions()
: CFunctionDB
- getUserOrder()
: CStateTemplate
- getValidator()
: CQExpressionWidget
- getValidValueCount()
: CExperimentSet
- getValue()
: CCopasiParameter
, CCopasiParameterGroup
, CEvaluationNode
, CFunctionAnalyzer::CValue
, CModelEntity
, CModelParameter
, CModelParameterSpecies
, COptions::COptionValue
, COptions
, CTableCell
, CXMLAttributeList
, QTimeCourseAnimation
- getValueForRow()
: CQCurrentValueTable
- getValueForSpecies()
: CDataEntity
- getValueFromNumberNode()
: CSBMLunitInterface
- getValueObject()
: CArrayElementReference
, CCopasiContainer
, CCopasiMatrixReference< CType >
, CCopasiObject
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiVectorReference< CType >
, CMetab
, CModelEntity
- getValuePointer()
: CArrayElementReference
, CCopasiMatrixReference< CType >
, CCopasiObject
, CCopasiObjectReference< CType >
, CCopasiParameter
, CCopasiTimer
, CCopasiVectorReference< CType >
, CEvaluationNode
, CMathObject
, CMetab
, CModelEntity
, CObjectInterface
- getValueReference()
: CCopasiParameter
, CModelEntity
, CMoiety
- getValues()
: CCompressedColumnFormat
, CMathContainer
- getValueType()
: CMathObject
- getVariable()
: CReadConfig
- getVariableGradients()
: COptProblem
- getVariableIndex()
: CEvaluationTree
, CFunction
- getVariables()
: CFunction
, CSensProblem
- getVariablesDescription()
: CAbstractLayoutInterface
- getVariableSize()
: COptProblem
- getVariablesPointerList()
: CSensItem
- getVariableStdDeviations()
: CFitProblem
- getVariableValue()
: CEvaluationTree
, CFunction
- getVData()
: CMiasePlot2D
- getVec_TimeScale()
: CTSSAMethod
- getVector()
: CEvaluationNodeVector
- getVersion()
: CMiaseML
, Copasi2SBMLTranslator
, CReadConfig
, CVersion
- getVersionDevel()
: CVersion
- getVersionMajor()
: CVersion
- getVersionMinor()
: CVersion
- getVfastSpacePrintAnn()
: CILDMMethod
, CILDMModifiedMethod
- getViewportHeight()
: CQGLLayoutPainter
- getViewportWidth()
: CQGLLayoutPainter
- getVolumeRateUnitsDisplayString()
: CModel
- getVolumeUnitEnum()
: CModel
- getVolumeUnitName()
: CModel
- getVolumeUnitsDisplayString()
: CModel
- getVslowMetabPrintAnn()
: CILDMMethod
, CILDMModifiedMethod
- getVslowPrintAnn()
: CILDMMethod
, CILDMModifiedMethod
- getVslowSpacePrintAnn()
: CILDMMethod
, CILDMModifiedMethod
- getVTextAnchor()
: CLGroup
, CLText
- getWeight()
: CCrossValidationSet
- getWeightMethod()
: CExperiment
- getWholeOutput()
: CMiaseOutput
- getWidgetForTask()
: Worker
- getWidgetList()
: CScanContainerWidget
- getWidth()
: CLDimensions
, CLGraphicalObject
, CLImage
, CLRectangle
, CQScreenshotOptionsDialog
- getWindowMenu()
: CQAnimationWindow
, CQCheckModelWindow
, CQNewMainWindow
, CWindowInterface
, PlotWindow
, SliderDialog
- getWindows()
: CopasiUI3Window
- getWorkingDirectory()
: CConfigurationFile
- getX()
: CLGraphicalObject
, CLImage
, CLPoint
, CLRectangle
, CLText
, CQScreenshotOptionsDialog
- getXData()
: CMiasePlot2D
- getXML()
: CCopasiXMLParser::UnsupportedAnnotationElement
, UnsupportedAnnotationElement
- getXmlNs()
: CMiaseAnnotation
- getXmlns()
: CMiaseML
- getXmlNs()
: CMiaseNotes
- getXOffset()
: CLRenderPoint
- getXPathAndName()
: SEDMLUtils
- getXPathForObject()
: SEDMLUtils
- getXPoint1()
: CLLinearGradient
- getXPoint2()
: CLLinearGradient
- getXPPString()
: CEvaluationNode
, CEvaluationNodeCall
, CEvaluationNodeChoice
, CEvaluationNodeConstant
, CEvaluationNodeDelay
, CEvaluationNodeFunction
, CEvaluationNodeLogical
, CEvaluationNodeObject
, CEvaluationNodeOperator
, CEvaluationNodeVector
, CExpression
- getY()
: CLGraphicalObject
, CLImage
, CLPoint
, CLRectangle
, CLText
, CQScreenshotOptionsDialog
- getYOffset()
: CLRenderPoint
- getYPoint1()
: CLLinearGradient
- getYPoint2()
: CLLinearGradient
- getZ()
: CLImage
, CLPoint
, CLRectangle
, CLText
- getZeroSet()
: CBitPatternTreeNode
, CStepMatrixColumn
- getZOffset()
: CLRenderPoint
- getZoomFactor()
: CLLayoutRenderer
, CQGLLayoutPainter
, CQGLNetworkPainter
- getZPoint1()
: CLLinearGradient
- getZPoint2()
: CLLinearGradient
- globalCheckBoxToggled()
: SliderSettingsDialog
- GlobalRenderInformationElement()
: CCopasiXMLParser::GlobalRenderInformationElement
- GlobalStyleElement()
: CCopasiXMLParser::GlobalStyleElement
- gradient()
: COptMethodLevenbergMarquardt
, COptMethodSteepestDescent
- GradientStopElement()
: CCopasiXMLParser::GradientStopElement
- graphFromXml()
: CRDFParser
- GroupElement()
: CCopasiXMLParser::GroupElement
- gtims_()
: CTruncatedNewton
- guessColumnNumber()
: CExperiment
, CTableRow
- guessGraphRoot()
: CRDFGraph
- GUIElement()
: CCopasiXMLParser::GUIElement