- e -

• CCopasiException() : CCopasiException
• CEFMAlgorithm() : CEFMAlgorithm
• CEFMMethod() : CEFMMethod
• CEFMProblem() : CEFMProblem
• CEFMTask() : CEFMTask
• CEigen() : CEigen
• CellDesignerSpecies() : CellDesignerSpecies
• CEnumAnnotation() : CEnumAnnotation< Type, Enum >
• CEnvironmentInformation() : CSBMLunitInterface::CEnvironmentInformation
• CEvaluationLexer() : CEvaluationLexer
• CEvaluationNode() : CEvaluationNode
• CEvaluationNodeCall() : CEvaluationNodeCall
• CEvaluationNodeChoice() : CEvaluationNodeChoice
• CEvaluationNodeConstant() : CEvaluationNodeConstant
• CEvaluationNodeDelay() : CEvaluationNodeDelay
• CEvaluationNodeFunction() : CEvaluationNodeFunction
• CEvaluationNodeLogical() : CEvaluationNodeLogical
• CEvaluationNodeNumber() : CEvaluationNodeNumber
• CEvaluationNodeObject() : CEvaluationNodeObject
• CEvaluationNodeOperator() : CEvaluationNodeOperator
• CEvaluationNodeStructure() : CEvaluationNodeStructure
• CEvaluationNodeUnit() : CEvaluationNodeUnit
• CEvaluationNodeVariable() : CEvaluationNodeVariable
• CEvaluationNodeVector() : CEvaluationNodeVector
• CEvaluationNodeWhiteSpace() : CEvaluationNodeWhiteSpace
• CEvaluationParserBase() : CEvaluationParserBase
• CEvaluationTree() : CEvaluationTree
• CEvent() : CEvent
• CEventAssignment() : CEventAssignment
• CExpat() : CExpat
• CExpatTemplate() : CExpatTemplate< CType >
• CExperiment() : CExperiment
• CExperimentFileInfo() : CExperimentFileInfo
• CExperimentInfo() : CExperimentFileInfo::CExperimentInfo
• CExperimentObjectMap() : CExperimentObjectMap
• CExperimentSet() : CExperimentSet
• CExpression() : CExpression
• CExpressionGenerator() : CExpressionGenerator
• CExpressionInformation() : CSBMLunitInterface::CExpressionInformation
• EditPoints() : EditPoints
• elevateChildren() : CConfigurationFile , CCopasiParameterGroup , CEFMProblem , CExperiment , CExperimentObjectMap::CDataColumn , CExperimentObjectMap , CExperimentSet , CFitItem , CFitProblem , CHybridMethod , CHybridMethodODE45 , CLNAMethod , CLsodaMethod2 , CLsodaMethod , CLyapProblem , CLyapWolfMethod , CMCAMethod , CMIRIAMResources , CNewtonMethod , COptMethodSS , COptProblem , COscillationProblem , CRadau5Method , CSteadyStateMethod , CStochasticRungeKuttaRI5 , CStochDirectMethod , CStochMethod , CTauLeapMethod , CTimeSensLsodaMethod , CTimeSensProblem , CTrajAdaptiveSA , CTrajectoryMethodDsaLsodar , CTrajectoryProblem , CTSSAMethod , CTSSAProblem
• EllipseHandler() : EllipseHandler
• empty() : CData , CDataVector< CType > , CMathUpdateSequence , CMIRIAMInfo , CRDFGraph , CUndoData::CChangeSet , CUndoData , CValidity
• emptyOutputData() : CCSPMethod
• emptyPlot() : CQBarChart
• emptyVectors() : CCSPMethod , CILDMMethod , CILDMModifiedMethod , CTSSAMethod
• enableAdditionalOptimizationParameters() : CConfigurationFile
• enableCdataSectionHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableCharacterDataHandler() : CExpatTemplate< CType > , CXMLParser
• enableCommentHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableDefaultHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableDoctypeDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableElementHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableEndCdataSectionHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableEndDoctypeDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableEndElementHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableEndNamespaceDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableExternalEntityRefHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableNamespaceDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enablePrint() : CInternalSolver , Cxerrwd
• enableProcessingInstructionHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableSkippedEntityHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableStartCdataSectionHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableStartDoctypeDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableStartElementHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableStartNamespaceDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableUnknownEncodingHandler() : CExpatTemplate< CType >
• enableXmlDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• encode() : CCopasiXMLInterface , Cmd5
• end() : CCallParameters< Type > , CCopasiTree< _Node > , CData , CDataObjectMap , CDataVector< CType > , CFluxMode , CFunctionParameters , CharacterDataHandler , CMathUpdateSequence , CModelParameterGroup , CModelParameterSet , CNodeContextIterator< Node, Context > , CommentHandler , COptLog , CStepMatrix , CTableauMatrix , CUndoData::CChangeSet , CUndoStack , CVectorCore< CType > , CXMLHandler , MiriamAnnotationHandler , UNKNOWNHandler , UnsupportedAnnotationHandler
• end_name() : CFunctionParameters
• endCdataSectionHandler() : CExpatTemplate< CType >
• endCOPASIkey() : SBMLReference
• endDependent() : CStateTemplate
• endDoctypeDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• endElement() : CStructureParser
• endElementHandler() : CExpatTemplate< CType >
• endFixed() : CStateTemplate
• endIndependent() : CStateTemplate
• endIndex() : CCopasiParameterGroup
• endName() : CCopasiParameterGroup , CDataVector< CType >
• endNamespaceDeclHandler() : CExpatTemplate< CType >
• endRow() : CCompressedColumnFormat
• endSaveElement() : CCopasiXMLInterface
• endSBMLid() : SBMLReference
• endThread() : CContext< Data >
• enforceSquare() : CCellDesignerImporter
• ensureParameterGroupHasAllElements() : CScanItem , CScanItemLinear , CScanItemRandom
• enterLogEntry() : COptLog
• Entity() : CMath::Entity< CType >
• equal_range() : CDataObjectMap
• erase() : CDataObjectMap , CXMLAttributeList
• ErrorHandler() : CRDFParser
• escape() : CCommonName
• escapeDisplayName() : CExpressionGenerator
• escapeId() : CReaction
• estimateError() : CRungeKutta
• eval() : dgemm
• EvalF() : CHybridMethodODE45
• evalF() : CHybridMethodODE45 , CHybridNextReactionLSODAMethod , CHybridNextReactionLSODAMethod::LSODA
• EvalF() : CLayoutEngine
• evalF() : CLayoutEngine
• EvalF() : CLsodaMethod2
• evalF() : CLsodaMethod2
• EvalF() : CLsodaMethod
• evalF() : CLsodaMethod , CLyapWolfMethod
• EvalF() : CLyapWolfMethod
• evalF() : CRadau5Method
• EvalF() : CRadau5Method , CTimeSensLsodaMethod
• evalF() : CTimeSensLsodaMethod , CTrajectoryMethodDsaLsodar
• evalJ() : CLsodaMethod2
• EvalJ() : CLsodaMethod2 , CLsodaMethod
• evalJ() : CLsodaMethod
• EvalJ() : CRadau5Method
• evalJ() : CRadau5Method
• EvalJ() : CTimeSensLsodaMethod
• evalJ() : CTimeSensLsodaMethod
• EvalM() : CRadau5Method
• evalMinimizeIntervals() : COptProblem
• evalNoise() : CStochasticRungeKuttaRI5
• EvalR() : CHybridMethodODE45
• evalR() : CHybridMethodODE45 , CLsodaMethod
• EvalR() : CLsodaMethod
• evalR() : CRadau5Method
• EvalR() : CRadau5Method
• evalR() : CTimeSensLsodaMethod
• EvalR() : CTimeSensLsodaMethod
• evalR() : CTrajectoryMethodDsaLsodar
• evalRate() : CStochasticRungeKuttaRI5
• evalRoot() : CLsodaMethod2 , CStochasticRungeKuttaRI5
• evalsort() : CILDMModifiedMethod
• EvalTemplate() : CBrent::EvalTemplate< CType > , CRootFinder::EvalTemplate< CType >
• evaluate() : COptMethodCoranaWalk , COptMethodDE , COptMethodEP , COptMethodGA , COptMethodGASR , COptMethodHookeJeeves , COptMethodLevenbergMarquardt , COptMethodNelderMead , COptMethodNL2SOL , COptMethodPraxis , COptMethodPS , COptMethodSA , COptMethodSRES , COptMethodSS , COptMethodStatistics , COptMethodSteepestDescent , COptMethodTruncatedNewton , CRandomSearch , CSBMLunitInterface
• evaluateFunction() : COptMethodPraxis , COptMethodTruncatedNewton
• evaluateNode() : CFunctionAnalyzer
• eventCallBack() : CAnalyticsTask , CCrossSectionTask
• EventHandler() : EventHandler
• execute2() : LinearAutoScaler2
• executeAction() : CMathEventQueue
• executeAssignment() : CMathEvent
• executeCallback() : CMathEvent
• executePostProcessData() : CUndoData
• executePreProcessData() : CUndoData
• exist() : CDirEntry
• existDependentEntities() : CModelExpansion
• exists() : CModelExpansion::ElementsMap
• existsFixedMetab() : CObjectLists
• exponentiate() : CUnit , CValidatedUnit
• exponents() : CLyapTask
• exportAlgorithm() : CSEDMLExporter
• exportAndAssignUnit() : CSBMLExporter
• exportClosingData() : CODEExporter , CODEExporterXPPAUT
• exportClosingString() : CODEExporter , CODEExporterC
• exportCombineArchive() : CDataModel
• exportCompartments() : CODEExporter
• exportDOTFormat() : CMathDependencyGraph
• exportEventAssignments() : CSBMLExporter
• exportExpression() : CODEExporter
• exportKineticFunction() : CODEExporter , CODEExporterC
• exportKineticFunctionGroup() : CODEExporter , CODEExporterC
• exportLayout() : CSBMLExporter
• exportMathModel() : CDataModel
• exportMathModelToString() : CDataModel
• exportMetabolites() : CODEExporter
• exportMetabolitesConcentrations() : CODEExporter
• exportModel() : CSBMLExporter
• exportModelAndTasks() : CSEDMLExporter
• exportModelAndTasksToString() : CSEDMLExporter
• exportModelEntityExpression() : CODEExporter
• exportModelToString() : CSBMLExporter
• exportModelValues() : CODEExporter
• exportModelValuesExpressions() : CODEExporter
• exportNthPlot() : CSEDMLExporter
• exportNthScanItem() : CSEDMLExporter
• exportNumber() : CODEExporter , CODEExporterC
• exportObjectNodesFromModel() : CODEExporter
• exportODEs() : CODEExporter
• exportPlotItem() : CSEDMLExporter
• exportReacParamsAndFuncs() : CODEExporter
• exportReferenceToSBML() : CLTextGlyph
• exportReport() : CSEDMLExporter
• exportSBML() : CDataModel
• exportSBMLToString() : CDataModel
• exportSEDML() : CDataModel
• exportSEDMLToString() : CDataModel
• exportShinyArchive() : CDataModel
• exportSimulatedObject() : CODEExporter
• exportSingleCompartment() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleFunction() : CODEExporter , CODEExporterC
• exportSingleLine() : CODEExporterXPPAUT
• exportSingleMetabolite() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleModelEntity() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleModVal() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleObject() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleODE() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportSingleParameter() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportStyleForItem() : CSEDMLExporter
• exportTitleData() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportTitleString() : CODEExporter , CODEExporterBM , CODEExporterC , CODEExporterXPPAUT
• exportToDotFile() : CLayout
• exportToSBML() : CLayout , CLCompartmentGlyph , CLCurve , CLGeneralGlyph , CLGraphicalObject , CListOfLayouts , CLMetabGlyph , CLMetabReferenceGlyph , CLReactionGlyph , CLReferenceGlyph , CLTextGlyph
• exportToSBMLBezier() : CLLineSegment
• exportToSBMLLineSegment() : CLLineSegment
• exportToStream() : CODEExporter
• Expression2PresentationMML() : Expression2PresentationMML
• Expression2PresentationMMLUnits() : Expression2PresentationMMLUnits
• expressionContainsObject() : CModelExpansion
• extendedTimeSeriesSize() : CExperiment
• externalEntityRefHandler() : CExpatTemplate< CType >
• extract_1d_attributes() : CLLayoutRenderer
• extract_2d_attributes() : CLLayoutRenderer
• extract_arrowhead_information() : CLLayoutRenderer
• extract_group_attributes() : CLLayoutRenderer
• extract_text_attributes() : CLLayoutRenderer
• extract_transformation_attributes() : CLLayoutRenderer
• extractId() : CMIRIAMResource , CMIRIAMResourceObject
• extractNamespaceFromPattern() : CMIRIAMResource