- d -

• CData() : CData
• CDataArray() : CDataArray
• CDataColumn() : CExperimentObjectMap::CDataColumn
• CDataContainer() : CDataContainer
• CDataHandler() : CDataHandler
• CDataMatrixReference() : CDataMatrixReference< CType >
• CDataModel() : CDataModel
• CDataObject() : CDataObject
• CDataObjectMap() : CDataObjectMap
• CDataObjectReference() : CDataObjectReference< CType >
• CDataString() : CDataString
• CDataValue() : CDataValue
• CDataVector() : CDataVector< CType >
• CDataVectorN() : CDataVectorN< CType >
• CDataVectorNS() : CDataVectorNS< CType >
• CDataVectorReference() : CDataVectorReference< CType >
• CDataVectorS() : CDataVectorS< CType >
• CDecisionVector() : CKeyFactory::CDecisionVector
• CDefaultOutputDescription() : CDefaultOutputDescription
• CDependencyGraph() : CDependencyGraph
• CDependencyGraphNode() : CDependencyGraphNode
• CDependentNumberReference() : CDependentNumberReference
• CDerive() : CDerive
• CDescription() : CCopasiTask::CDescription
• DataObject() : CObjectInterface
• DBL() : CCopasiXMLInterface::DBL
• debug() : FlexLexer
• debugOutput() : CSBMLunitInterface
• decode() : Cmd5
• decomposeJacobian() : CSSAMethod
• deepCopy() : CDataVector< CType >
• defaultHandler() : CExpatTemplate< CType >
• delayAssignment() : CMathEvent
• deleteAssignment() : CEvent
• deleteBranch() : CDerive
• deleteChildren() : CCopasiNode< _Data >
• deleteConverterData() : CRDFGraphConverter
• deleteCopasiModel() : SBMLImporter , SEDMLImporter
• deleteData() : CDataValue
• deleteOldData() : CDataModel
• deleteParentofCurrentVersionProvenance() : CProvenanceXMLWriter
• deleteValidValues() : CCopasiParameter
• deleteValue() : CCopasiParameter
• deleteVersion() : CModelVersionHierarchy
• deleteVersionProvenance() : CProvenanceXMLWriter
• dependentNumber() : CMoiety
• dependsOn() : CMathDependencyGraph
• deps() : CRungeKutta
• deregisterExpression() : CJitCompiler
• deregisterHandler() : CRegisteredCommonName
• deregisterUpdateSequence() : CMathContainer
• deriveBranch() : CDerive
• descentLine() : COptMethodSteepestDescent
• destroy() : CExpatTemplate< CType > , CRootContainer
• destroyRootMask() : CHybridMethodODE45 , CLsodaMethod2 , CLsodaMethod , CRadau5Method , CStochasticRungeKuttaRI5 , CTimeSensLsodaMethod
• destroyUnreferencedNode() : CRDFGraph
• destruct() : CBiologicalDescription , CCreator , CDataObject , CModelParameter , CModelParameterSet , CModification , CReference , CUndoObjectInterface
• detachNode() : CCopasiTree< _Node >
• determineIntegrationType() : CHybridMethodODE45
• determineUnits() : CSBMLunitInterface
• determineVersion() : CCellDesignerImporter
• deuflhard() : CILDMMethod
• deuflhard_metab() : CILDMModifiedMethod
• dgemm() : dgemm
• diag() : CSSAMethod
• diff() : CModelParameter , CModelParameterGroup , CModelParameterSet
• digest() : Cmd5
• dimensionality() : CArray , CArrayInterface , CDataArray , CMatrixInterface< MatrixType > , CVectorInterface< VectorType >
• DimensionsHandler() : DimensionsHandler
• dintdy_() : CInternalSolver
• directionToEnum() : CCellDesignerImporter
• dirName() : CDirEntry
• disownSBMLDocument() : CSBMLExporter
• displayNamesToCN() : CDataArray
• displayNameToNamePair() : CChemEqInterface
• displayPopulations() : CConfigurationFile
• distance() : CCellDesignerImporter , CCopasiSpringLayout , CLLayoutRenderer
• distancePointLineSegment() : CLLayoutRenderer
• divergenceRequested() : CLyapProblem
• divide() : CDerive
• divideByObject() : SBMLImporter
• divideByVolume() : SBMLImporter
• divset_N() : CNL2SOL
• dn2fb_() : CNL2SOL
• do_collapsing() : CSensMethod
• do_collapsing_innerloop() : CSensMethod
• do_scaling() : CSensMethod
• do_target_calculation() : CSensMethod
• do_variation() : CSensMethod
• doColumnPivot() : CLinkMatrix
• doesExist() : CMetabNameInterface
• doesVersionExist() : CModelVersionHierarchy
• doIntegration() : CNewtonMethod
• doJacobian() : CSteadyStateMethod
• doMapping() : SBMLImporter
• doNewtonStep() : CNewtonMethod
• doOneStep() : CRungeKutta
• doRowPivot() : CLinkMatrix
• doSingleSSAStep() : CTrajAdaptiveSA
• doSingleStep() : CHybridMethod , CHybridMethodODE45 , CStochDirectMethod , CStochMethod , CStochNextReactionMethod , CTauLeapMethod , CTrajectoryMethodDsaLsodar
• doSingleTauLeapStep() : CTrajAdaptiveSA
• dot() : CLPoint
• DoubleLine() : DoubleLine
• dprja_() : CInternalSolver
• dr250() : Cr250
• draw() : Bar , Label3D
• draw_cap() : CLLayoutRenderer
• draw_curve() : CLLayoutRenderer
• draw_datapoints() : CLLayoutRenderer
• draw_ellipse() : CLLayoutRenderer
• draw_group() : CLLayoutRenderer
• draw_image() : CLLayoutRenderer
• draw_layout() : CLLayoutRenderer
• draw_line() : CLLayoutRenderer
• draw_line_segment() : CLLayoutRenderer
• draw_object() : CLLayoutRenderer
• draw_polygon() : CLLayoutRenderer
• draw_rectangle() : CLLayoutRenderer
• draw_selection_box() : CLLayoutRenderer
• draw_text() : CLLayoutRenderer
• drawBegin() : Bar
• drawEnd() : Bar
• drawSelectionBox() : CLLayoutRenderer
• drawZero() : Bar
• drchek_() : CInternalSolver
• droots_() : CInternalSolver
• drop() : CSBMLunitInterface::CEnvironmentInformation
• dsolsy_() : CInternalSolver
• dstoda_() : CInternalSolver
• dumpStatus() : COptMethodPS
• duplicate() : CModelExpansion
• duplicateCompartment() : CModelExpansion
• duplicateEvent() : CModelExpansion
• duplicateGlobalQuantity() : CModelExpansion
• duplicateMetab() : CModelExpansion
• duplicateReaction() : CModelExpansion