- a -

• abort_handler() : test000101
• about() : CopasiUI3Window
• AboutDialog() : AboutDialog
• aboutQt() : CopasiUI3Window
• accept() : CQNameSelectionDialog , CQProgressDialog , CQReportDefinitionSelect , CQScreenshotOptionsDialog
• acoth() : CEvaluationNodeFunction
• acsch() : CEvaluationNodeFunction
• adaptCurveForCircle() : CQGLNetworkPainter
• adaptCurveForRectangles() : CQGLNetworkPainter
• adaptToHeight() : CLabel
• add() : CCopasiContainer , CCopasiVector< T > , CCopasiVectorN< CType > , CFunctionDB , CFunctionParameters , CKeyFactory , CKeyFactory::HashTable , CLyapWolfMethod , CModelExpansion::ElementsMap , CModelParameterGroup , CMoiety , CNormalCall , CNormalLcm , CNormalSum , CompartmentInfo , CQBrowserPaneDM , CStateTemplate , CStepMatrix , CXMLAttributeList , SBMLReference
• addAllPositions() : CCellDesignerImporter
• addAndAdaptName() : CFunctionDB
• addAnnotation() : CMiaseBase
• addAssignment() : CMathEventN , CProcessQueue
• addCalculation() : CProcessQueue
• addCallParameter() : CFunctionParameterMap
• addChange() : CMiaseModel
• addChannel() : CPlotItem
• addChild() : CCopasiNode< _Data > , CEvaluationNodeCall , CEvaluationNodeVector
• addChildElement() : CLGroup
• addChildren() : CEvaluationNode
• addColorDefinition() : CLRenderInformationBase
• addColumn() : CMiaseOutput , CStepMatrix
• addCompartment() : CModelExpansion::SetOfModelElements
• addCompartmentGlyph() : CLayout
• addCompartments() : CModelAdd
• addCompartmentsExpressions() : CModelAdd
• addCompartmentVariables() : CCopasiSpringLayout
• addContent() : CMiaseParser
• addCrossValidation() : CFitItem
• addCurve2D() : CQPlotSubwidget
• addCurveElement() : CLRenderCurve
• addCurveSegment() : CLCurve
• addCurveSlot() : CQPlotSubwidget
• addCurveTab() : CQPlotSubwidget
• addDatamodel() : CCopasiRootContainer
• addDefaultRenderInfoItemsToList() : CQNewMainWindow
• addDefaultReports() : CCopasiDataModel
• addDefaultTasks() : CCopasiDataModel
• addDependency() : CCellDesignerImporter
• addDependent() : CDependencyGraph , CDependencyGraphNode , CMathDependencyNode
• addDeprecatedURL() : CMIRIAMResource
• addDirectDependency() : CCopasiObject
• addEdge() : CRDFNode
• addElement() : CChemEq , CLPolygon
• addElementReference() : CArrayAnnotation
• addEvent() : CModelExpansion::SetOfModelElements
• addEvents() : CModelAdd
• addExperiment() : CExperimentSet , CFitItem
• addFile() : CRecentFiles
• addFix() : CKeyFactory , CKeyFactory::HashTable , CXMLElementHandler< CType, CCommon >
• addGeneralGlyph() : CLayout
• addGlobalQuantity() : CModelExpansion::SetOfModelElements
• addGlobalRenderInfoItemsToList() : CQNewMainWindow
• addGlobalRenderInformation() : CListOfLayouts , test000097
• addGlyph() : CQLayoutScene
• addGradientDefinition() : CLRenderInformationBase
• addGradientStop() : CLGradientBase
• addGroup() : CCopasiParameterGroup
• addHisto1D() : CQPlotSubwidget
• addHisto1DTab() : CQPlotSubwidget
• addHistoSlot() : CQPlotSubwidget
• addInterface() : COutputHandler
• addItem() : CProcessReport , CProgressBar
• addItemInAnimation() : CQLayoutMainWindow
• AdditionalGOElement() : CCopasiXMLParser::AdditionalGOElement
• addKey() : CLLocalStyle
• addLayout() : CListOfLayouts
• addLine() : CTableauMatrix
• addLineEnding() : CLRenderInformationBase
• addLocalRenderInformation() : CLayout , test000097
• addMatrixReference() : CCopasiContainer
• addMeasurement() : CMiaseTask
• addMetab() : CModelExpansion::SetOfModelElements
• addMetabolite() : CChemEq , CCompartment
• addMetaboliteForAnimation() : CQGLNetworkPainter
• addMetaboliteGlyph() : CLayout
• addMetabolites() : CModelAdd
• addMetabolitesExpressions() : CModelAdd
• addMetabReferenceGlyph() : CLReactionGlyph
• addMIRIAMResource() : CMIRIAMResources
• addMode() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod
• addModel() : CMiaseSed
• addModelValues() : CModelAdd
• addModelValuesExpressions() : CModelAdd
• addModifier() : CChemEqInterface , CReaction
• addNameSpace() : CRDFGraph
• addNode() : CDependencyGraph
• addNotes() : CMiaseBase
• addObject() : CMathDependencyGraph , CModelExpansion::SetOfModelElements
• addObjectReference() : CCopasiContainer
• addOptItem() : COptProblem
• addOutput() : CMiaseSed
• addParameter() : CCopasiParameterGroup
• addParameterMapping() : CReaction
• addPlot() : CQPlotSubwidget
• addPlot2D() : CMiaseOutput
• addPlotItem() : CQPlotSubwidget
• addPositionVariables() : CCopasiSpringLayout
• addPrerequisite() : CMathDependencyNode
• addProduct() : CReaction
• addReaction() : CModelExpansion::SetOfModelElements
• addReactionGlyph() : CLayout
• addReactions() : CModelAdd
• addReactionVariables() : CCopasiSpringLayout
• addReferenceGlyph() : CLGeneralGlyph
• addReport() : CCopasiDataModel
• addRole() : CLStyle
• addSBMLAttributes() : CLGradientBase , CLGraphicalPrimitive1D , CLGraphicalPrimitive2D , CLRenderInformationBase , CLRenderPoint , CLStyle , CLTransformation2D
• addScanItem() : CScanProblem
• addSibling() : CCopasiNode< _Data >
• addSimulation() : CMiaseSed
• addSlider() : SliderDialog
• addSpecies() : CModelParameterCompartment
• addStyle() : CLGlobalRenderInformation , CLLocalRenderInformation
• addSubglyph() : CLGeneralGlyph
• addSubstrate() : CReaction
• addTableElement() : CReportDefinition
• addTask() : CCopasiDataModel , CMiaseSed
• addTextGlyph() : CLayout
• addToHistory() : CQTaskMethodWidget
• addToMainWindow() : CWindowInterface
• addToMultiplicity() : CChemEqElement
• addToSelection() : CLLayoutRenderer
• addTriplet() : CRDFGraph
• addTripletToGraph() : CRDFNode
• addType() : CLStyle
• addUnsupportedAnnotation() : CAnnotation
• addVariable() : CFunction
• addVariables() : CSensProblem
• addVectorReference() : CCopasiContainer
• addWidget() : CScanContainerWidget
• addWindow() : CopasiUI3Window
• adjust_value() : CLGradientStops
• adjustForEmptyLines() : CExperimentFileInfo
• adjustTable() : TaskWidget
• allocate() : CMathContainer , CMathEventN , CMathEventN::CTrigger , CTimeSeries
• allocateDiscontinuous() : CMathEventN::CTrigger
• allPositive() : CSteadyStateMethod
• analyse_render_information() : CLLayoutRenderer
• angle() : CCellDesignerImporter
• append() : CReport
• appendDependentCompartments() : CModel
• appendDependentEvents() : CModel
• appendDependentFunctions() : CFunctionDB
• appendDependentMetabolites() : CModel
• appendDependentModelObjects() : CModel
• appendDependentModelValues() : CModel
• appendDependentReactions() : CModel
• appendDependentTasks() : CCopasiDataModel
• appendElementReferences() : CArrayAnnotation
• applyActiveParameterSet() : CModel
• applyColumnPivot() : CLinkMatrix
• applyDefaults() : CCopasiSpringLayout::Parameters
• applyDelayRefreshes() : CMathEvent
• applyDependentRefreshes() : CMathEvent
• applyExponent() : CSBMLunit
• applyInitialValues() : CMathContainer , CMathModel , CMathTrigger , CMathTrigger::CRootFinder , CModel
• applyInverseExponent() : CSBMLunit
• applyPivot() : CMatrix< CType > , CVectorCore< CType >
• applyRowPivot() : CLinkMatrix
• applyStoichiometricExpressions() : SBMLImporter
• applyStyle() : CQRenderConverter
• applyTo() : CLayoutState
• applyToScene() : CQCopasiAnimation , CQEffectDescription
• applyUpdateSequence() : CMathContainer
• applyValueRefreshes() : CMathEvent
• arccot() : CEvaluationNodeFunction
• arccsc() : CEvaluationNodeFunction
• arcsec() : CEvaluationNodeFunction
• areApproximatelyEqual() : SBMLImporter , SEDMLImporter
• areEqual() : CNormalBase
• areEqualFunctions() : SBMLImporter
• areEqualSubtrees() : SBMLImporter
• areOfSameType() : CQPlotSubwidget
• areRulesUnique() : SBMLImporter
• areSBMLUnitDefinitionsIdentical() : SBMLImporter
• Arguments() : Arguments
• array() : CArrayAnnotation , CMatrix< CType > , CVectorCore< CType >
• ArrayOf_USCORExsd_USCOREstring() : ArrayOf_USCORExsd_USCOREstring
• asech() : CEvaluationNodeFunction
• assembleSubTreeForMassAction() : CODEExporter
• assertGroup() : CCopasiParameterGroup
• assertParameter() : CCopasiParameterGroup
• assignGroupContent() : CModelParameterGroup
• assignmentData() : CQParameterOverviewDM
• AssignmentElement() : CCopasiXMLParser::AssignmentElement
• assignSBMLIdsToReactions() : CSBMLExporter
• assignSetContent() : CModelParameterSet
• assistantBtnClicked() : TaskWidget
• attachKey() : ObjectBrowserItem
• attachNode() : CCopasiTree< _Node >
• autoexcept() : copasi::autoexcept
• autoSave() : CCopasiDataModel , CopasiUI3Window
• autoscale() : ValueScale
• autoUpdateMIRIAMResources() : CMIRIAMResources
• averageDivergence() : CLyapTask
• CAbstractLayoutInterface() : CAbstractLayoutInterface
• CAction() : CProcessQueue::CAction
• CalculateKernel() : CBitPatternMethod , CBitPatternTreeMethod
• CalculateLNA() : CLNAMethod
• CalculateMCA() : CMCAMethod
• CAllocation() : CMath::CAllocationStack::CAllocation
• CAllocationStack() : CMath::CAllocationStack
• CallParameterElement() : CCopasiXMLParser::CallParameterElement
• CAnnotation() : CAnnotation
• CArrayAnnotation() : CArrayAnnotation
• CArrayElementReference() : CArrayElementReference
• CArrow() : CArrow
• CAssignment() : CMathEvent::CAssignment , CMathEventN::CAssignment
• CCopasiArray() : CCopasiArray